# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Oaf12619.fasta.nr -Q af12619.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 af12619, 1850 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2355815254 residues in 6825066 sequences statistics sampled from 60000 to 6817348 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3352+/-0.000201; mu= 11.1019+/- 0.011 mean_var=118.3336+/-22.880, 0's: 34 Z-trim: 68 B-trim: 758 in 1/67 Lambda= 0.117902 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(6825066) gi|168273128|dbj|BAG10403.1| neuron navigator 3 [s (1842) 11895 2035.8 0 gi|147704669|sp|Q80TN7|NAV3_MOUSE Neuron navigator (2359) 6190 1065.5 0 gi|148689762|gb|EDL21709.1| mCG20172 [Mus musculus (2376) 6190 1065.5 0 gi|149067022|gb|EDM16755.1| rCG48939 [Rattus norve (1616) 6163 1060.8 0 gi|124486648|ref|NP_001074504.1| neuron navigator (2366) 6163 1060.9 0 gi|109480505|ref|XP_235115.4| PREDICTED: similar t (2362) 6145 1057.9 0 gi|109481847|ref|XP_001078354.1| PREDICTED: simila (2363) 6145 1057.9 0 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