# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Oah03162.fasta.nr -Q ah03162.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ah03162, 1120 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2355815254 residues in 6825066 sequences statistics sampled from 60000 to 6824586 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0628+/-0.000184; mu= 14.9985+/- 0.010 mean_var=72.4021+/-14.127, 0's: 34 Z-trim: 36 B-trim: 0 in 0/68 Lambda= 0.150730 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(6825066) gi|121940538|sp|Q14C87|T132D_HUMAN Transmembrane p (1099) 7258 1588.4 0 gi|37196676|dbj|BAC97794.1| HBE120 [Homo sapiens] (1099) 7253 1587.3 0 gi|109730321|gb|AAI14627.1| TMEM132D protein [Homo (1099) 7250 1586.7 0 gi|194214423|ref|XP_001916304.1| PREDICTED: simila (1099) 6525 1429.0 0 gi|148687591|gb|EDL19538.1| transmembrane protein (1274) 6154 1348.4 0 gi|81894111|sp|Q76HP3|T132D_MOUSE Transmembrane pr (1097) 6114 1339.6 0 gi|26350341|dbj|BAC38810.1| unnamed protein produc (1097) 6103 1337.2 0 gi|81864946|sp|Q76HP2|T132D_RAT Transmembrane prot (1097) 6099 1336.4 0 gi|149063207|gb|EDM13530.1| hypothetical protein r (1095) 6077 1331.6 0 gi|126323950|ref|XP_001378954.1| PREDICTED: simila (1096) 6070 1330.1 0 gi|118098448|ref|XP_415097.2| PREDICTED: similar t (1090) 5964 1307.0 0 gi|73995089|ref|XP_543358.2| PREDICTED: similar to (1092) 5957 1305.5 0 gi|119909171|ref|XP_609289.3| PREDICTED: similar t (1174) 5911 1295.5 0 gi|149408916|ref|XP_001508797.1| PREDICTED: simila (1090) 5906 1294.4 0 gi|118098453|ref|XP_415100.2| PREDICTED: hypotheti (1104) 4604 1011.3 0 gi|114647787|ref|XP_522557.2| PREDICTED: hypotheti (1158) 4401 967.1 0 gi|194214418|ref|XP_001494149.2| PREDICTED: simila (1113) 4379 962.3 0 gi|172046143|sp|Q8N3T6.2|T132C_HUMAN Transmembrane (1107) 4365 959.3 0 gi|126323956|ref|XP_001379005.1| PREDICTED: hypoth (1159) 4329 951.5 0 gi|109099241|ref|XP_001106655.1| PREDICTED: simila (1098) 4312 947.8 0 gi|109099246|ref|XP_001107847.1| PREDICTED: simila ( 754) 4303 945.7 0 gi|149720802|ref|XP_001494285.1| PREDICTED: simila ( 727) 4291 943.1 0 gi|73995113|ref|XP_543360.2| PREDICTED: similar to (1089) 4232 930.4 0 gi|148687598|gb|EDL19545.1| mCG8571, isoform CRA_b (1137) 4146 911.7 0 gi|149254388|ref|XP_920984.3| PREDICTED: hypotheti (1171) 4146 911.7 0 gi|149254600|ref|XP_984653.2| PREDICTED: hypotheti (1171) 4137 909.7 0 gi|147733704|sp|Q8CEF9|T132C_MOUSE Transmembrane p (1107) 4136 909.5 0 gi|26390211|dbj|BAC25861.1| unnamed protein produc (1143) 4136 909.5 0 gi|119618906|gb|EAW98500.1| transmembrane protein ( 637) 4081 897.3 0 gi|149408905|ref|XP_001507972.1| PREDICTED: simila (1069) 3811 838.8 0 gi|126323962|ref|XP_001379097.1| PREDICTED: simila (1064) 3664 806.8 0 gi|149063212|gb|EDM13535.1| rCG21827, isoform CRA_ ( 923) 3320 732.0 3.1e-208 gi|118098457|ref|XP_415101.2| PREDICTED: similar t (1069) 3239 714.4 7.1e-203 gi|149408910|ref|XP_001508373.1| PREDICTED: simila ( 734) 3032 669.3 1.9e-189 gi|73995126|ref|XP_543363.2| PREDICTED: similar to (1072) 3027 668.3 5.3e-189 gi|119618883|gb|EAW98477.1| transmembrane protein (1103) 2966 655.1 5.4e-185 gi|149720795|ref|XP_001493655.1| PREDICTED: simila (1084) 2964 654.6 7.2e-185 gi|145566963|sp|Q14DG7|T132B_HUMAN Transmembrane p (1078) 2955 652.7 2.8e-184 gi|160773536|gb|AAI55386.1| Unknown (protein for M ( 663) 2936 648.4 3.3e-183 gi|94375669|ref|XP_984094.1| PREDICTED: similar to (1192) 2882 636.8 1.8e-179 gi|109497295|ref|XP_001078766.1| PREDICTED: simila (1079) 2868 633.8 1.4e-178 gi|94375443|ref|XP_920802.2| PREDICTED: similar to (1119) 2856 631.2 8.6e-178 gi|169204360|ref|XP_044062.9| PREDICTED: hypotheti (1120) 2827 624.9 6.8e-176 gi|169205051|ref|XP_001715627.1| PREDICTED: hypoth (1142) 2827 624.9 6.9e-176 gi|21732438|emb|CAD38581.1| hypothetical protein [ ( 723) 2806 620.1 1.2e-174 gi|109099221|ref|XP_001103750.1| PREDICTED: simila (1064) 2802 619.4 2.8e-174 gi|193785211|dbj|BAG54364.1| unnamed protein produ ( 724) 2789 616.4 1.5e-173 gi|26330392|dbj|BAC28926.1| unnamed protein produc ( 719) 2737 605.1 3.8e-170 gi|148687605|gb|EDL19552.1| mCG142549 [Mus musculu (1015) 2679 592.6 3.1e-166 gi|169154363|emb|CAQ14618.1| novel protein similar ( 665) 2490 551.4 5.3e-154 >>gi|121940538|sp|Q14C87|T132D_HUMAN Transmembrane prote (1099 aa) initn: 7258 init1: 7258 opt: 7258 Z-score: 8520.6 bits: 1588.4 E(): 0 Smith-Waterman score: 7258; 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