# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Obm05571.fasta.nr -Q bm05571.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 bm05571, 541 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2355815254 residues in 6825066 sequences statistics sampled from 60000 to 6799289 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6625+/-0.000185; mu= 12.4114+/- 0.010 mean_var=72.5968+/-14.077, 0's: 35 Z-trim: 229 B-trim: 180 in 1/64 Lambda= 0.150527 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(6825066) gi|62089260|dbj|BAD93074.1| zinc finger protein 42 ( 541) 3805 836.2 0 gi|34925651|sp|Q9BUY5|ZN426_HUMAN Zinc finger prot ( 554) 3632 798.7 0 gi|114675263|ref|XP_512350.2| PREDICTED: zinc fing ( 536) 3596 790.8 0 gi|109123290|ref|XP_001098009.1| PREDICTED: simila ( 551) 3485 766.8 0 gi|23274112|gb|AAH23931.1| Zfp426 protein [Mus mus ( 549) 2744 605.8 8.6e-171 gi|26331812|dbj|BAC29636.1| unnamed protein produc ( 564) 2742 605.4 1.2e-170 gi|148693156|gb|EDL25103.1| zinc finger protein 42 ( 549) 2740 605.0 1.6e-170 gi|81914881|sp|Q8R1D1|ZN426_MOUSE Zinc finger prot ( 550) 2731 603.0 6.1e-170 gi|148693158|gb|EDL25105.1| zinc finger protein 42 ( 564) 2731 603.0 6.2e-170 gi|149020572|gb|EDL78377.1| rCG31920, isoform CRA_ ( 532) 2726 601.9 1.3e-169 gi|149020570|gb|EDL78375.1| rCG31920, isoform CRA_ ( 552) 2713 599.1 9.2e-169 gi|145558847|sp|A1L1L7|ZN426_RAT Zinc finger prote ( 553) 2704 597.1 3.6e-168 gi|148693157|gb|EDL25104.1| zinc finger protein 42 ( 482) 2595 573.4 4.3e-161 gi|114675215|ref|XP_001160876.1| PREDICTED: zinc f ( 616) 2219 491.9 1.9e-136 gi|114675217|ref|XP_524100.2| PREDICTED: zinc fing ( 549) 2036 452.1 1.7e-124 gi|194213262|ref|XP_001916751.1| PREDICTED: simila ( 638) 1977 439.3 1.3e-120 gi|16551981|dbj|BAB71213.1| unnamed protein produc ( 790) 1902 423.1 1.2e-115 gi|97219157|sp|Q96MR9|ZN560_HUMAN Zinc finger prot ( 790) 1901 422.9 1.4e-115 gi|109123288|ref|XP_001097611.1| PREDICTED: simila ( 791) 1888 420.1 1e-114 gi|114675255|ref|XP_524101.2| PREDICTED: zinc fing ( 790) 1842 410.1 1e-111 gi|82921764|ref|XP_925665.1| PREDICTED: similar to ( 604) 1821 405.4 2e-110 gi|119604456|gb|EAW84050.1| hCG2042064 [Homo sapie ( 649) 1807 402.4 1.7e-109 gi|187671939|sp|Q147U1.2|YS028_HUMAN Zinc finger p ( 533) 1802 401.2 3.2e-109 gi|194213205|ref|XP_001491806.2| PREDICTED: simila ( 935) 1789 398.7 3.4e-108 gi|74194406|dbj|BAE24702.1| unnamed protein produc ( 754) 1757 391.6 3.6e-106 gi|115528560|gb|AAI24560.1| OTTMUSG00000016588 pro ( 522) 1740 387.8 3.6e-105 gi|123207821|emb|CAM26620.1| novel KRAB box and zi ( 526) 1731 385.8 1.4e-104 gi|123222748|emb|CAM21998.1| novel KRAB box and zi ( 554) 1729 385.4 2e-104 gi|119368828|sp|Q96MU6|ZN778_HUMAN Zinc finger pro ( 687) 1692 377.5 5.9e-102 gi|126325082|ref|XP_001374239.1| PREDICTED: simila ( 570) 1632 364.4 4.4e-98 gi|123232535|emb|CAM21132.1| novel KRAB box and zi ( 610) 1631 364.2 5.3e-98 gi|149250150|ref|XP_001480959.1| PREDICTED: simila ( 641) 1622 362.2 2.1e-97 gi|119912000|ref|XP_585787.3| PREDICTED: similar t ( 669) 1621 362.0 2.6e-97 gi|131328735|gb|AAH12405.3| 2310001H12Rik protein ( 526) 1616 360.9 4.6e-97 gi|149250458|ref|XP_001472116.1| PREDICTED: simila ( 569) 1615 360.7 5.6e-97 gi|123210392|emb|CAM27283.1| novel KRAB box and zi ( 582) 1614 360.5 6.7e-97 gi|123227460|emb|CAM27169.1| novel KRAB box and zi ( 834) 1614 360.6 8.6e-97 gi|74760022|sp|Q8N972|ZN709_HUMAN Zinc finger prot ( 641) 1611 359.8 1.1e-96 gi|119604682|gb|EAW84276.1| zinc finger protein 70 ( 721) 1611 359.9 1.2e-96 gi|114675515|ref|XP_524120.2| PREDICTED: hypotheti (1305) 1607 359.3 3.4e-96 gi|123211459|emb|CAM28025.1| novel KRAB box and zi ( 554) 1580 353.1 1.1e-94 gi|123232536|emb|CAM21133.1| novel KRAB box and zi ( 522) 1574 351.7 2.5e-94 gi|114664134|ref|XP_511167.2| PREDICTED: hypotheti ( 728) 1566 350.1 1.1e-93 gi|21754722|dbj|BAC04552.1| unnamed protein produc ( 595) 1564 349.6 1.3e-93 gi|119604430|gb|EAW84024.1| hCG2039382 [Homo sapie ( 602) 1564 349.6 1.3e-93 gi|94730691|sp|Q32M78|ZN699_HUMAN Zinc finger prot ( 642) 1564 349.6 1.3e-93 gi|153792259|ref|NP_872337.2| zinc finger protein ( 729) 1562 349.3 2e-93 gi|123232533|emb|CAM21130.1| novel KRAB box and zi ( 610) 1560 348.8 2.3e-93 gi|149026508|gb|EDL82658.1| rCG53336 [Rattus norve ( 649) 1558 348.3 3.3e-93 gi|149250475|ref|XP_001472364.1| PREDICTED: simila ( 839) 1555 347.8 6.2e-93 >>gi|62089260|dbj|BAD93074.1| zinc finger protein 426 va (541 aa) initn: 3805 init1: 3805 opt: 3805 Z-score: 4466.8 bits: 836.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 3805; 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