# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Oeh00644.fasta.nr -Q eh00644.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 eh00644, 1229 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2355815254 residues in 6825066 sequences statistics sampled from 60000 to 6822777 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1295+/-0.000184; mu= 14.8815+/- 0.010 mean_var=74.7609+/-14.516, 0's: 42 Z-trim: 61 B-trim: 0 in 0/68 Lambda= 0.148333 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(6825066) gi|21105795|gb|AAM34795.1|AF512556_1 integrin, alp (1181) 7727 1663.9 0 gi|124942|sp|P17301.1|ITA2_HUMAN Integrin alpha-2 (1181) 7722 1662.9 0 gi|114600323|ref|XP_526928.2| PREDICTED: hypotheti (1181) 7707 1659.6 0 gi|119575268|gb|EAW54873.1| integrin, alpha 2 (CD4 (1179) 7703 1658.8 0 gi|109077204|ref|XP_001095246.1| PREDICTED: integr (1180) 7604 1637.6 0 gi|194223901|ref|XP_001494668.2| PREDICTED: simila (1194) 6904 1487.8 0 gi|119913150|ref|XP_613651.3| PREDICTED: similar t (1365) 6850 1476.3 0 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simila (1177) 2311 504.9 1e-139 gi|119591830|gb|EAW71424.1| integrin, alpha 10, is (1177) 2281 498.5 8.6e-138 gi|115502407|sp|O75578|ITA10_HUMAN Integrin alpha- (1167) 2280 498.3 1e-137 gi|3420888|gb|AAC31952.1| integrin subunit alpha 1 (1167) 2279 498.1 1.2e-137 gi|73981421|ref|XP_850355.1| PREDICTED: similar to (1165) 2273 496.8 2.8e-137 gi|109732283|gb|AAI15771.1| Integrin, alpha 10 [Mu (1166) 2273 496.8 2.8e-137 gi|119889504|ref|XP_582982.3| PREDICTED: similar t (1167) 2270 496.1 4.4e-137 gi|164565428|ref|NP_001101169.2| integrin, alpha 1 (1167) 2269 495.9 5.1e-137 gi|124486692|ref|NP_001074522.1| integrin, alpha 1 (1167) 2261 494.2 1.7e-136 gi|114558438|ref|XP_514418.2| PREDICTED: integrin, (1167) 2259 493.8 2.2e-136 gi|189524131|ref|XP_001921191.1| PREDICTED: simila ( 734) 2208 482.7 3e-133 gi|118096010|ref|XP_413930.2| PREDICTED: similar t (1191) 2070 453.3 3.4e-124 gi|189442879|gb|AAI67840.1| Integrin, alpha 11 [sy (1188) 2042 447.3 2.2e-122 gi|119901955|ref|XP_602058.3| 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