# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Oeh00660.fasta.nr -Q eh00660.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 eh00660, 983 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 3071326396 residues in 8985982 sequences statistics sampled from 60000 to 8984095 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1287+/-0.000181; mu= 13.6860+/- 0.010 mean_var=72.6259+/-14.662, 0's: 22 Z-trim: 31 B-trim: 2751 in 1/66 Lambda= 0.150497 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(8985982) gi|74724833|sp|Q99650.1|OSMR_HUMAN RecName: Full=O ( 979) 6656 1455.2 0 gi|114600500|ref|XP_001141406.1| PREDICTED: oncost ( 979) 6620 1447.4 0 gi|109077038|ref|XP_001083745.1| PREDICTED: simila ( 977) 6338 1386.2 0 gi|149732929|ref|XP_001497043.1| PREDICTED: oncost ( 973) 5032 1102.6 0 gi|73954301|ref|XP_546341.2| PREDICTED: similar to ( 967) 4844 1061.8 0 gi|81890503|sp|Q65Z14.1|OSMR_RAT RecName: Full=Onc ( 962) 3665 805.8 0 gi|223460974|gb|AAI37704.1| Oncostatin M receptor ( 972) 3535 777.6 0 gi|148671405|gb|EDL03352.1| oncostatin M receptor, ( 971) 3530 776.5 0 gi|81870500|sp|O70458.1|OSMR_MOUSE RecName: Full=O ( 971) 3525 775.4 0 gi|3721860|dbj|BAA33725.1| oncostatin M receptor b ( 970) 3519 774.1 0 gi|148671404|gb|EDL03351.1| oncostatin M receptor, (1011) 3519 774.1 0 gi|126321677|ref|XP_001372196.1| PREDICTED: simila (1038) 2369 524.4 1.2e-145 gi|15012082|gb|AAH10943.1| OSMR protein [Homo sapi ( 342) 2247 497.6 4.9e-138 gi|194384316|dbj|BAG64931.1| unnamed protein produ ( 316) 2121 470.2 7.9e-130 gi|149016485|gb|EDL75703.1| oncostatin M receptor ( 536) 1984 440.6 1.1e-120 gi|149732931|ref|XP_001497116.1| PREDICTED: simila (1188) 1524 341.0 2.3e-90 gi|118103710|ref|XP_425020.2| PREDICTED: similar t ( 732) 1501 335.9 5e-89 gi|39645550|gb|AAH63468.1| OSMR protein [Homo sapi ( 215) 1443 322.9 1.2e-85 gi|119913226|ref|XP_587754.3| PREDICTED: similar t (1095) 1445 323.8 3.1e-85 gi|19571788|emb|CAC94786.1| cytokine receptor-beta (1083) 1430 320.6 3e-84 gi|224090357|ref|XP_002195624.1| PREDICTED: leukem (1088) 1400 314.1 2.7e-82 gi|81870502|sp|O70535.1|LIFR_RAT RecName: Full=Leu (1093) 1372 308.0 1.9e-80 gi|149016481|gb|EDL75699.1| leukemia inhibitory fa (1093) 1371 307.8 2.2e-80 gi|126321679|ref|XP_001372289.1| PREDICTED: simila (1083) 1334 299.7 5.6e-78 gi|1170785|sp|P42703.1|LIFR_MOUSE RecName: Full=Le (1092) 1328 298.4 1.4e-77 gi|149460835|ref|XP_001507581.1| PREDICTED: simila ( 966) 1326 298.0 1.7e-77 gi|74207051|dbj|BAE33308.1| unnamed protein produc (1092) 1326 298.0 1.9e-77 gi|149634263|ref|XP_001507624.1| PREDICTED: simila ( 555) 1272 286.1 3.8e-74 gi|109658415|gb|AAI18402.1| Oncostatin M receptor ( 324) 1263 283.9 9.7e-74 gi|75055414|sp|Q5XNR9.1|LIFR_CANFA RecName: Full=L (1097) 1231 277.4 3.1e-71 gi|114600505|ref|XP_001141959.1| PREDICTED: leukem (1097) 1204 271.5 1.8e-69 gi|1170784|sp|P42702.1|LIFR_HUMAN RecName: Full=Le (1097) 1200 270.7 3.2e-69 gi|158261141|dbj|BAF82748.1| unnamed protein produ (1097) 1199 270.4 3.8e-69 gi|258656|gb|AAB23884.1| leukaemia inhibitory fact (1078) 1189 268.3 1.7e-68 gi|441494|dbj|BAA04258.1| soluble D-factor/LIF rec ( 719) 1029 233.4 3.5e-58 gi|148671402|gb|EDL03349.1| leukemia inhibitory fa ( 723) 1029 233.4 3.5e-58 gi|74219134|dbj|BAE26706.1| unnamed protein produc ( 719) 1011 229.5 5.3e-57 gi|149627766|ref|XP_001520033.1| PREDICTED: simila ( 391) 746 171.7 6.9e-40 gi|159885679|tpe|CAI96518.1| TPA: leukemia inhibit ( 939) 726 167.7 2.8e-38 gi|159885723|tpe|CAL90972.1| TPA: putative oncosta ( 674) 626 145.9 7.3e-32 gi|122891252|emb|CAM13257.1| novel protein [Danio ( 781) 626 145.9 8.2e-32 gi|189519803|ref|XP_001920274.1| PREDICTED: oncost ( 787) 626 145.9 8.3e-32 gi|206582066|pdb|3E0G|A Chain A, Structure Of The ( 483) 547 128.6 8.3e-27 gi|61403566|gb|AAH91862.1| Leukemia inhibitory fac ( 929) 543 127.9 2.5e-26 gi|118094660|ref|XP_422534.2| PREDICTED: similar t ( 871) 542 127.7 2.8e-26 gi|122891251|emb|CAM13256.1| novel protein (zgc:11 ( 930) 541 127.5 3.4e-26 gi|58219081|emb|CAF21997.2| interleukin 12 recepto ( 869) 540 127.3 3.7e-26 gi|38639034|gb|AAR25691.1| class I helical cytokin ( 844) 538 126.8 4.9e-26 gi|38639036|gb|AAR25692.1| class I helical cytokin ( 894) 519 122.7 9e-25 gi|223647484|gb|ACN10500.1| Interleukin-12 recepto ( 835) 503 119.2 9.5e-24 >>gi|74724833|sp|Q99650.1|OSMR_HUMAN RecName: Full=Oncos (979 aa) initn: 6656 init1: 6656 opt: 6656 Z-score: 7802.8 bits: 1455.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 6656; 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