# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Oeh00685.fasta.nr -Q eh00685.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 eh00685, 596 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 3071326396 residues in 8985982 sequences statistics sampled from 60000 to 8973060 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5597+/-0.000197; mu= 11.2855+/- 0.011 mean_var=117.3102+/-22.297, 0's: 43 Z-trim: 52 B-trim: 0 in 0/68 Lambda= 0.118415 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(8985982) gi|408403|gb|AAA19951.1| neu differentiation facto ( 462) 3043 531.0 3.5e-148 gi|119583816|gb|EAW63412.1| neuregulin 1, isoform ( 462) 3035 529.6 9.1e-148 gi|73979243|ref|XP_858147.1| PREDICTED: similar to ( 461) 2935 512.6 1.3e-142 gi|236463556|ref|NP_001153476.1| neuregulin 1 isof ( 459) 2908 507.9 3.1e-141 gi|164682534|gb|ABY66350.1| neuregulin 1 isoform n ( 458) 2901 506.7 7e-141 gi|149057874|gb|EDM09117.1| neuregulin 1, isoform ( 461) 2838 496.0 1.2e-137 gi|408383|gb|AAA19941.1| neu differentiation facto ( 461) 2837 495.8 1.4e-137 gi|2459765|gb|AAB71812.1| neuregulin [Mesocricetus ( 461) 2812 491.5 2.7e-136 gi|114619624|ref|XP_001168800.1| PREDICTED: neureg ( 640) 2790 487.9 4.5e-135 gi|9297018|sp|Q02297.3|NRG1_HUMAN RecName: Full=Pr ( 640) 2790 487.9 4.5e-135 gi|119583812|gb|EAW63408.1| neuregulin 1, isoform ( 640) 2782 486.6 1.2e-134 gi|223462375|gb|AAI50610.1| Neuregulin 1 [Homo sap ( 640) 2780 486.2 1.5e-134 gi|114619620|ref|XP_001168773.1| PREDICTED: neureg ( 648) 2764 483.5 9.8e-134 gi|109086106|ref|XP_001086071.1| PREDICTED: simila ( 640) 2761 483.0 1.4e-133 gi|73979245|ref|XP_858187.1| PREDICTED: similar to ( 638) 2682 469.5 1.6e-129 gi|236464528|ref|NP_001153480.1| neuregulin 1 isof ( 420) 2653 464.3 3.8e-128 gi|116006957|ref|NP_039251.2| neuregulin 1 isoform ( 637) 2655 464.9 3.9e-128 gi|114619622|ref|XP_519699.2| PREDICTED: similar t ( 637) 2655 464.9 3.9e-128 gi|183997|gb|AAA58640.1| heregulin-beta2 ( 637) 2649 463.9 7.9e-128 gi|221042104|dbj|BAH12729.1| unnamed protein produ ( 420) 2645 463.0 9.7e-128 gi|119583820|gb|EAW63416.1| neuregulin 1, isoform ( 637) 2647 463.5 1e-127 gi|116006955|ref|NP_039250.2| neuregulin 1 isoform ( 645) 2644 463.0 1.4e-127 gi|114619618|ref|XP_001168989.1| PREDICTED: neureg ( 645) 2644 463.0 1.4e-127 gi|183995|gb|AAA58639.1| heregulin-beta1 ( 645) 2638 462.0 2.9e-127 gi|119583819|gb|EAW63415.1| neuregulin 1, isoform ( 645) 2636 461.6 3.7e-127 gi|109086104|ref|XP_001085962.1| PREDICTED: simila ( 637) 2626 459.9 1.2e-126 gi|109086102|ref|XP_001086184.1| PREDICTED: simila ( 645) 2615 458.1 4.5e-126 gi|149057884|gb|EDM09127.1| neuregulin 1, isoform ( 422) 2608 456.6 7.8e-126 gi|149057880|gb|EDM09123.1| neuregulin 1, isoform ( 639) 2610 457.2 8.1e-126 gi|408399|gb|AAA19949.1| neu differentiation facto ( 422) 2607 456.5 8.7e-126 gi|408389|gb|AAA19944.1| neu differentiation facto ( 639) 2609 457.0 9.1e-126 gi|73979249|ref|XP_858269.1| PREDICTED: similar to ( 635) 2547 446.4 1.4e-122 gi|73979229|ref|XP_857861.1| PREDICTED: similar to ( 643) 2536 444.6 5.2e-122 gi|37700461|gb|AAR00250.1| neuregulin 1 alpha isof ( 394) 2519 441.4 2.8e-121 gi|49659891|gb|AAT68241.1| neuregulin-1 type I bet ( 645) 2504 439.1 2.3e-120 gi|149057885|gb|EDM09128.1| neuregulin 1, isoform ( 419) 2480 434.8 3e-119 gi|149057882|gb|EDM09125.1| neuregulin 1, isoform ( 636) 2482 435.3 3.1e-119 gi|408393|gb|AAA19946.1| neu differentiation facto ( 636) 2481 435.2 3.5e-119 gi|408387|gb|AAA19943.1| neu differentiation facto ( 636) 2481 435.2 3.5e-119 gi|149057876|gb|EDM09119.1| neuregulin 1, isoform ( 644) 2471 433.4 1.1e-118 gi|62752958|gb|AAX98677.1| glial growth factor 1 [ ( 644) 2470 433.3 1.3e-118 gi|236462348|ref|NP_001153471.1| neuregulin 1 isof ( 624) 2427 425.9 2e-116 gi|119583821|gb|EAW63417.1| neuregulin 1, isoform ( 636) 2399 421.1 5.7e-115 gi|148821073|gb|ABR13843.1| neuregulin 1 type IV f ( 498) 2394 420.2 8.8e-115 gi|149742623|ref|XP_001493412.1| PREDICTED: neureg ( 640) 2367 415.7 2.5e-113 gi|149057877|gb|EDM09120.1| neuregulin 1, isoform ( 855) 2314 406.8 1.6e-110 gi|11066050|gb|AAG28433.1|AF194993_1 glial growth ( 782) 2313 406.6 1.7e-110 gi|149410716|ref|XP_001508509.1| PREDICTED: simila ( 829) 2242 394.5 8e-107 gi|126330747|ref|XP_001372072.1| PREDICTED: simila ( 624) 2185 384.6 5.7e-104 gi|62903398|gb|AAY19481.1| neuregulin-1 beta1b [Ra ( 366) 2082 366.7 7.9e-99 >>gi|408403|gb|AAA19951.1| neu differentiation factor (462 aa) initn: 3043 init1: 3043 opt: 3043 Z-score: 2817.6 bits: 531.0 E(): 3.5e-148 Smith-Waterman score: 3043; 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