# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Oej00452.fasta.nr -Q ej00452.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ej00452, 860 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2779448989 residues in 8089198 sequences statistics sampled from 60000 to 8088407 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4116+/-0.000187; mu= 12.7980+/- 0.010 mean_var=80.3399+/-15.481, 0's: 25 Z-trim: 25 B-trim: 0 in 0/67 Lambda= 0.143090 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(8089198) gi|102467484|ref|NP_060221.2| neutral sphingomyeli ( 837) 5681 1182.9 0 gi|119576005|gb|EAW55601.1| hypothetical protein F ( 837) 5669 1180.4 0 gi|7020298|dbj|BAA91070.1| unnamed protein product ( 798) 5413 1127.5 0 gi|194043414|ref|XP_001929624.1| PREDICTED: sphing ( 839) 5002 1042.7 0 gi|148665056|gb|EDK97472.1| sphingomyelin phosphod ( 835) 4975 1037.1 0 gi|148665055|gb|EDK97471.1| sphingomyelin phosphod ( 833) 4948 1031.6 0 gi|26330998|dbj|BAC29229.1| unnamed protein produc ( 794) 4865 1014.4 0 gi|26327537|dbj|BAC27512.1| unnamed protein produc ( 794) 4854 1012.1 0 gi|20071251|gb|AAH26767.1| Smpd4 protein [Mus musc ( 794) 4848 1010.9 0 gi|26326955|dbj|BAC27221.1| unnamed protein produc ( 793) 4831 1007.4 0 gi|194387634|dbj|BAG61230.1| unnamed protein produ ( 764) 4619 963.6 0 gi|194382754|dbj|BAG64547.1| unnamed protein produ ( 724) 4609 961.5 0 gi|118098721|ref|XP_001232199.1| PREDICTED: simila ( 797) 4135 863.7 0 gi|74216796|dbj|BAE37796.1| unnamed protein produc ( 637) 3849 804.6 0 gi|66910748|gb|AAH97653.1| Smpd4 protein [Xenopus ( 796) 3666 766.9 0 gi|160773900|gb|AAI55502.1| LOC100127861 protein [ ( 796) 3647 763.0 0 gi|194386342|dbj|BAG59735.1| unnamed protein produ ( 615) 3595 752.2 1.6e-214 gi|119576004|gb|EAW55600.1| hypothetical protein F ( 530) 3569 746.7 5.9e-213 gi|40674045|gb|AAH64947.1| SMPD4 protein [Homo sap ( 735) 3432 718.6 2.5e-204 gi|124015179|sp|Q9NXE4.2|NSMA3_HUMAN RecName: Full ( 827) 3432 718.6 2.7e-204 gi|169125668|gb|ACA48221.1| SKNY protein [Homo sap ( 866) 3432 718.6 2.8e-204 gi|119576001|gb|EAW55597.1| hypothetical protein F ( 866) 3432 718.6 2.8e-204 gi|194391350|dbj|BAG60793.1| unnamed protein produ ( 607) 3422 716.4 9e-204 gi|82187187|sp|Q6PFJ7.1|NSMA3_DANRE RecName: Full= ( 791) 3314 694.2 5.7e-197 gi|213627496|gb|AAI71455.1| Smpd4 protein [Danio r ( 791) 3307 692.8 1.5e-196 gi|194382616|dbj|BAG64478.1| unnamed protein produ ( 502) 3116 653.2 8.1e-185 gi|119576003|gb|EAW55599.1| hypothetical protein F ( 912) 3112 652.6 2.3e-184 gi|7021055|dbj|BAA91368.1| unnamed protein product ( 605) 3107 651.4 3.4e-184 gi|73996001|ref|XP_543560.2| PREDICTED: similar to ( 827) 3095 649.0 2.4e-183 gi|149019750|gb|EDL77898.1| rCG36774 [Rattus norve ( 823) 3066 643.1 1.5e-181 gi|109494763|ref|XP_001063553.1| PREDICTED: simila (1024) 3066 643.1 1.8e-181 gi|109493602|ref|XP_001058775.1| PREDICTED: simila (1024) 3066 643.1 1.8e-181 gi|124015180|sp|Q6ZPR5.2|NSMA3_MOUSE RecName: Full ( 823) 3040 637.7 6.2e-180 gi|12859688|dbj|BAB31737.1| unnamed protein produc ( 823) 3032 636.0 2e-179 gi|194043412|ref|XP_001929623.1| PREDICTED: sphing ( 868) 3026 634.8 4.8e-179 gi|149720162|ref|XP_001488324.1| PREDICTED: sphing ( 852) 3006 630.7 8.3e-178 gi|148745032|gb|AAI42451.1| SMPD4 protein [Bos tau ( 856) 3000 629.4 2e-177 gi|119909670|ref|XP_583777.3| PREDICTED: sphingomy ( 867) 3000 629.4 2e-177 gi|50949353|emb|CAB66671.2| hypothetical protein [ ( 431) 2884 605.3 1.9e-170 gi|119576002|gb|EAW55598.1| hypothetical protein F ( 758) 2885 605.7 2.5e-170 gi|49065526|emb|CAG38581.1| FLJ20297 [Homo sapiens ( 428) 2868 602.0 1.8e-169 gi|55733541|emb|CAH93448.1| hypothetical protein [ ( 428) 2853 598.9 1.6e-168 gi|90084423|dbj|BAE91053.1| unnamed protein produc ( 428) 2810 590.0 7.4e-166 gi|149531352|ref|XP_001509989.1| PREDICTED: simila ( 509) 2587 544.0 6.1e-152 gi|118098719|ref|XP_415236.2| PREDICTED: similar t ( 827) 2539 534.3 8.5e-149 gi|224072101|ref|XP_002196840.1| PREDICTED: sphing ( 849) 2539 534.3 8.7e-149 gi|7022351|dbj|BAA91567.1| unnamed protein product ( 363) 2383 501.8 2.2e-139 gi|34533603|dbj|BAC86751.1| unnamed protein produc ( 398) 2276 479.7 1.1e-132 gi|74211258|dbj|BAE37694.1| unnamed protein produc ( 807) 2272 479.1 3.3e-132 gi|124015181|sp|Q5XHG1.2|NSMA3_XENLA RecName: Full ( 824) 2232 470.9 1e-129 >>gi|102467484|ref|NP_060221.2| neutral sphingomyelinase (837 aa) initn: 5681 init1: 5681 opt: 5681 Z-score: 6333.2 bits: 1182.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 5681; 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