# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Oej00702.fasta.nr -Q ej00702.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ej00702, 1236 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2355815254 residues in 6825066 sequences statistics sampled from 60000 to 6816699 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8702+/-0.000195; mu= 11.4913+/- 0.011 mean_var=108.6424+/-20.588, 0's: 32 Z-trim: 77 B-trim: 6 in 1/65 Lambda= 0.123048 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(6825066) gi|143811421|sp|Q13201|MMRN1_HUMAN Multimerin-1 pr (1228) 7936 1420.7 0 gi|39645323|gb|AAH63848.1| Multimerin 1 [Homo sapi (1228) 7930 1419.7 0 gi|927596|gb|AAC52065.1| prepromultimerin (1228) 7922 1418.2 0 gi|114595173|ref|XP_517342.2| PREDICTED: hypotheti (1229) 7819 1399.9 0 gi|109074983|ref|XP_001101702.1| PREDICTED: simila (1221) 7498 1343.0 0 gi|149701546|ref|XP_001497011.1| PREDICTED: multim (1221) 6240 1119.6 0 gi|74001894|ref|XP_544980.2| PREDICTED: similar to (1212) 5952 1068.5 0 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