# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Off00542.fasta.nr -Q ff00542.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ff00542, 972 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2355815254 residues in 6825066 sequences statistics sampled from 60000 to 6817648 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1996+/-0.000199; mu= 10.3299+/- 0.011 mean_var=118.7144+/-22.790, 0's: 37 Z-trim: 53 B-trim: 0 in 0/68 Lambda= 0.117712 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(6825066) gi|73919614|sp|Q8NHY3.1|GA2L2_HUMAN GAS2-like prot ( 880) 6109 1049.1 0 gi|114668028|ref|XP_001174066.1| PREDICTED: growth ( 880) 5991 1029.1 0 gi|109114025|ref|XP_001114413.1| PREDICTED: simila ( 879) 5482 942.6 0 gi|76642919|ref|XP_585382.2| PREDICTED: similar to ( 875) 4247 732.9 1.4e-208 gi|194217262|ref|XP_001917950.1| PREDICTED: growth ( 827) 3458 598.9 2.9e-168 gi|73966952|ref|XP_548257.2| PREDICTED: similar to ( 881) 3112 540.1 1.5e-150 gi|73919615|sp|Q5SSG4.1|GA2L2_MOUSE GAS2-like prot ( 860) 2500 436.2 2.8e-119 gi|126313953|ref|XP_001373480.1| PREDICTED: simila ( 889) 2135 374.2 1.3e-100 gi|149053666|gb|EDM05483.1| growth arrest-specific ( 288) 1716 302.6 1.5e-79 gi|148683755|gb|EDL15702.1| hypothetical protein L ( 297) 1712 302.0 2.5e-79 gi|118100112|ref|XP_425395.2| PREDICTED: hypotheti ( 523) 1534 272.0 4.7e-70 gi|21070342|gb|AAM34264.1|AF508784_1 GAS2-related ( 213) 1276 227.8 3.8e-57 gi|189538690|ref|XP_001338383.2| PREDICTED: simila ( 894) 1267 226.8 3.1e-56 gi|109114027|ref|XP_001114392.1| PREDICTED: simila ( 215) 1197 214.4 4.2e-53 gi|62898936|dbj|BAD97322.1| growth arrest-specific ( 681) 791 145.9 5.5e-32 gi|15029673|gb|AAH11047.1| Growth arrest-specific ( 681) 788 145.4 7.9e-32 gi|73915341|sp|Q99501.2|GA2L1_HUMAN GAS2-like prot ( 681) 786 145.0 9.9e-32 gi|73995404|ref|XP_543468.2| PREDICTED: similar to ( 718) 776 143.4 3.4e-31 gi|194043186|ref|XP_001928858.1| PREDICTED: growth ( 681) 767 141.8 9.3e-31 gi|134025114|gb|AAI34475.1| GAS2L1 protein [Bos ta ( 679) 763 141.1 1.5e-30 gi|149047595|gb|EDM00265.1| growth arrest-specific ( 678) 757 140.1 3e-30 gi|194214131|ref|XP_001495331.2| PREDICTED: simila ( 672) 754 139.6 4.3e-30 gi|73919613|sp|Q8JZP9.1|GA2L1_MOUSE GAS2-like prot ( 678) 753 139.4 4.8e-30 gi|156212013|gb|EDO33092.1| predicted protein [Nem ( 256) 742 137.2 8.6e-30 gi|118091112|ref|XP_420902.2| PREDICTED: similar t ( 314) 719 133.3 1.5e-28 gi|1666071|emb|CAA69174.1| GAR22 protein [Homo sap ( 337) 715 132.7 2.5e-28 gi|1707491|emb|CAA69176.1| GAR22 protein [Homo sap ( 329) 714 132.5 2.8e-28 gi|120945|sp|P11862.1|GAS2_MOUSE Growth arrest-spe ( 314) 708 131.5 5.5e-28 gi|73978239|ref|XP_539741.2| PREDICTED: similar to ( 575) 708 131.7 8.5e-28 gi|149055778|gb|EDM07209.1| similar to growth arre ( 314) 703 130.6 9.9e-28 gi|149719529|ref|XP_001505039.1| PREDICTED: simila ( 313) 702 130.5 1.1e-27 gi|73988733|ref|XP_534091.2| PREDICTED: similar to ( 313) 700 130.1 1.4e-27 gi|154425862|gb|AAI51515.1| GAS2 protein [Bos taur ( 313) 699 129.9 1.6e-27 gi|194037662|ref|XP_001928851.1| PREDICTED: growth ( 669) 702 130.8 1.9e-27 gi|149047594|gb|EDM00264.1| growth arrest-specific ( 428) 699 130.1 2e-27 gi|3913719|sp|O43903.1|GAS2_HUMAN Growth arrest-sp ( 313) 697 129.6 2e-27 gi|194226701|ref|XP_001496568.2| PREDICTED: growth ( 696) 701 130.6 2.2e-27 gi|109106997|ref|XP_001091603.1| PREDICTED: simila ( 313) 696 129.4 2.2e-27 gi|126332208|ref|XP_001368313.1| PREDICTED: simila ( 315) 693 128.9 3.2e-27 gi|149409535|ref|XP_001509170.1| PREDICTED: simila ( 314) 692 128.8 3.6e-27 gi|12859972|dbj|BAB31826.1| unnamed protein produc ( 344) 691 128.6 4.3e-27 gi|118082546|ref|XP_416172.2| PREDICTED: similar t ( 722) 692 129.1 6.6e-27 gi|21070338|gb|AAM34262.1|AF508323_1 GAS2-related ( 337) 687 127.9 6.8e-27 gi|114646511|ref|XP_509301.2| PREDICTED: growth ar ( 694) 688 128.4 1e-26 gi|73919616|sp|Q86XJ1.1|GA2L3_HUMAN GAS2-like prot ( 694) 688 128.4 1e-26 gi|126339616|ref|XP_001365224.1| PREDICTED: simila ( 699) 667 124.8 1.2e-25 gi|109480455|ref|XP_001056437.1| PREDICTED: simila ( 747) 660 123.7 2.9e-25 gi|119892657|ref|XP_001251560.1| PREDICTED: simila ( 692) 655 122.8 5e-25 gi|74218035|dbj|BAE42001.1| unnamed protein produc ( 683) 647 121.4 1.3e-24 gi|74218810|dbj|BAE37814.1| unnamed protein produc ( 368) 641 120.2 1.6e-24 >>gi|73919614|sp|Q8NHY3.1|GA2L2_HUMAN GAS2-like protein (880 aa) initn: 6109 init1: 6109 opt: 6109 Z-score: 5608.8 bits: 1049.1 E(): 0 Smith-Waterman score: 6109; 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