# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Off03388.fasta.nr -Q ff03388.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ff03388, 537 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 3020366983 residues in 8842601 sequences statistics sampled from 60000 to 8812897 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7405+/-0.000187; mu= 11.4317+/- 0.010 mean_var=72.8508+/-13.974, 0's: 26 Z-trim: 219 B-trim: 11 in 1/66 Lambda= 0.150265 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(8842601) gi|114613693|ref|XP_527766.2| PREDICTED: zinc fing ( 760) 3774 828.3 0 gi|116242865|sp|Q8NEM1.2|ZN680_HUMAN RecName: Full ( 530) 3771 827.5 0 gi|21265141|gb|AAH30700.1| Zinc finger protein 680 ( 530) 3757 824.5 0 gi|190689997|gb|ACE86773.1| zinc finger protein 68 ( 530) 3751 823.2 0 gi|119598373|gb|EAW77967.1| zinc finger protein 68 ( 452) 3225 709.1 7.5e-202 gi|110349778|ref|NP_066971.2| zinc finger protein ( 569) 2882 634.8 2.1e-179 gi|114613705|ref|XP_527768.2| PREDICTED: zinc fing ( 655) 2862 630.6 4.7e-178 gi|109066430|ref|XP_001097971.1| PREDICTED: simila ( 560) 2727 601.2 2.7e-169 gi|85681871|sp|Q03936.2|ZNF92_HUMAN RecName: Full= ( 586) 2669 588.7 1.7e-165 gi|119572686|gb|EAW52301.1| zinc finger protein 92 ( 607) 2663 587.4 4.4e-165 gi|148806912|ref|NP_001092096.1| zinc finger prote ( 572) 2655 585.6 1.4e-164 gi|109066422|ref|XP_001097169.1| PREDICTED: simila ( 586) 2654 585.4 1.6e-164 gi|30173456|sp|Q8TF32.2|ZN431_HUMAN RecName: Full= ( 576) 2629 580.0 6.9e-163 gi|26251755|gb|AAH40506.1| Zinc finger protein 431 ( 576) 2627 579.6 9.4e-163 gi|119605337|gb|EAW84931.1| hCG36734 [Homo sapiens ( 560) 2606 575.0 2.2e-161 gi|114676344|ref|XP_001145538.1| PREDICTED: zinc f ( 559) 2604 574.6 2.9e-161 gi|84627547|gb|AAI11777.1| Zinc finger protein 430 ( 569) 2599 573.5 6.3e-161 gi|215274175|sp|Q03923.3|ZNF85_HUMAN RecName: Full ( 595) 2599 573.5 6.5e-161 gi|52788280|sp|Q14593.2|ZN273_HUMAN RecName: Full= ( 504) 2597 573.0 7.7e-161 gi|1017722|gb|AAA79179.1| repressor transcriptiona ( 595) 2588 571.1 3.4e-160 gi|158254382|dbj|BAF83164.1| unnamed protein produ ( 570) 2587 570.9 3.8e-160 gi|119605290|gb|EAW84884.1| zinc finger protein 43 ( 570) 2587 570.9 3.8e-160 gi|34925658|sp|Q9H8G1.2|ZN430_HUMAN RecName: Full= ( 570) 2584 570.2 6e-160 gi|114676319|ref|XP_001144468.1| PREDICTED: zinc f ( 569) 2574 568.1 2.7e-159 gi|114676358|ref|XP_512547.2| PREDICTED: zinc fing (1186) 2576 568.8 3.3e-159 gi|47077562|dbj|BAD18665.1| unnamed protein produc ( 563) 2569 567.0 5.6e-159 gi|229485309|sp|P17019.3|ZN708_HUMAN RecName: Full ( 563) 2563 565.7 1.4e-158 gi|109124104|ref|XP_001082498.1| PREDICTED: simila ( 566) 2560 565.0 2.2e-158 gi|225000280|gb|AAI72551.1| Zinc finger protein 70 ( 563) 2558 564.6 2.9e-158 gi|169213820|ref|XP_001714913.1| PREDICTED: simila ( 920) 2557 564.6 4.8e-158 gi|169213609|ref|XP_001719810.1| PREDICTED: zinc f (1114) 2557 564.7 5.6e-158 gi|119605298|gb|EAW84892.1| zinc finger protein 70 ( 648) 2551 563.1 9.3e-158 gi|109124127|ref|XP_001084590.1| PREDICTED: zinc f ( 582) 2549 562.7 1.2e-157 gi|148612807|ref|NP_258429.2| zinc finger protein ( 563) 2547 562.2 1.5e-157 gi|21752592|dbj|BAC04216.1| unnamed protein produc ( 540) 2538 560.2 5.8e-157 gi|114676394|ref|XP_001147366.1| PREDICTED: hypoth ( 540) 2528 558.1 2.6e-156 gi|212288104|sp|A6NK21.3|YI017_HUMAN RecName: Full ( 547) 2526 557.6 3.5e-156 gi|226530355|ref|NP_001152765.1| zinc finger prote ( 536) 2525 557.4 4e-156 gi|190485783|sp|O75373.2|ZN737_HUMAN RecName: Full ( 536) 2525 557.4 4e-156 gi|114676346|ref|XP_524178.2| PREDICTED: hypotheti ( 563) 2524 557.2 4.9e-156 gi|114676418|ref|XP_524454.2| PREDICTED: zinc fing (1325) 2520 556.7 1.6e-155 gi|215274193|sp|O75437.3|ZN254_HUMAN RecName: Full ( 659) 2514 555.1 2.4e-155 gi|114613601|ref|XP_001139474.1| PREDICTED: zinc f ( 554) 2508 553.7 5.3e-155 gi|187665002|sp|A6NF79.3|ZN734_HUMAN RecName: Full ( 559) 2508 553.7 5.4e-155 gi|109066435|ref|XP_001098865.1| PREDICTED: zinc f ( 852) 2509 554.1 6.2e-155 gi|119605292|gb|EAW84886.1| zinc finger protein 71 ( 712) 2508 553.8 6.4e-155 gi|71051560|gb|AAH43147.2| Zinc finger protein 254 ( 659) 2505 553.2 9.5e-155 gi|114679826|ref|XP_001149923.1| PREDICTED: zinc f ( 659) 2502 552.5 1.5e-154 gi|38258829|sp|Q96JC4.1|ZN479_HUMAN RecName: Full= ( 524) 2500 552.0 1.7e-154 gi|114676383|ref|XP_001147215.1| PREDICTED: zinc f ( 704) 2499 551.9 2.4e-154 >>gi|114613693|ref|XP_527766.2| PREDICTED: zinc finger p (760 aa) initn: 3774 init1: 3774 opt: 3774 Z-score: 4421.4 bits: 828.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 3774; 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99.434% identity (99.623% similar) in 530 aa overlap (8-537:1-530) 10 20 30 40 50 60 ff0338 IGRCTAKMPGPPGSLEMGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNLYRKVMFENYRNLVFLG :::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|190 MPGPPGRLEMGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNLYRKVMFENYRNLVFLG 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 ff0338 IAVSKPHLITCLEQGKEPWNRKRQEMVAKPPVIYSHFTEDLWPEHSIKDSFQKVILRGYG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|190 IAVSKPHLITCLEQGKEPWNRKRQEMVAKPPVIYSHFTEDLWPEHSIKDSFQKVILRGYG 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 ff0338 KCGHENLQLRISCKSVDESKVFKEGYNELNQCLRTTQSKIFQCDKYVKVFHKFSNSNSHK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|190 KCGHENLQLRISCKSVDESKVFKEGYNELNQCLRTTQSKIFQCDKYVKVFHKFSNSNSHK 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 ff0338 KRNTGKKVFKCKECGKSFCMLSHLTQHIRIHTRENSYKCEECGKVLNWFSELIKHKGIHM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|190 KRNTGKKVFKCKECGKSFCMLSHLTQHIRIHTRENSYKCEECGKVLNWFSELIKHKGIHM 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 ff0338 GEKPYKCEECGKAFNQSSTLIKHKKIHIEEKPFKCEECGKAFSLFSILSKHKIIHTGDKP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|190 GEKPYKCEECGKAFNQSSTLIKHKKIHIEEKPFKCEECGKAFSLFSILSKHKIIHTGDKP 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 ff0338 YKCDECHKAFNWFATLTNHKRIHTGEKPFKCEECGKDFNQFSNLTKHKKIHTGEKPYKCE :::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::: gi|190 YKCDECHKAFNWFATLTNHKRIHTGEKPFKCEECGKGFNQFSNLTKHKKIHTGEKPYKCE 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 ff0338 ECGKAFNQFANLTRHKKIHTGEKSYKCEECGKAFIQSSNLTEHMRIHTGEKPYKCEECGK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|190 ECGKAFNQFANLTRHKKIHTGEKSYKCEECGKAFIQSSNLTEHMRIHTGEKPYKCEECGK 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 ff0338 AFNGCSSLTRHKRIHTRENTYKCEECGKGFTLFSTLTNHKVIHTGEKSYKCDECGNVFNW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|190 AFNGCSSLTRHKRIHTRENTYKCEECGKGFTLFSTLTNHKVIHTGEKSYKCDECGNVFNW 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 ff0338 PATLANHKRIHAREKPYKCEECGKAFNRSSHLTRHKKIHTGEKLYKPEKCDNNFDNT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: gi|190 PATLANHKRIHAREKPYKCEECGKAFNRSSHLTRHKKIHTGEKLYKPEKCDDNFDNT 480 490 500 510 520 530 >>gi|119598373|gb|EAW77967.1| zinc finger protein 680, i (452 aa) initn: 3225 init1: 3225 opt: 3225 Z-score: 3781.1 bits: 709.1 E(): 7.5e-202 Smith-Waterman score: 3225; 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