# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Ofg01250.fasta.nr -Q fg01250.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 fg01250, 897 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2355815254 residues in 6825066 sequences statistics sampled from 60000 to 6807886 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6024+/-0.000209; mu= 8.4806+/- 0.012 mean_var=149.7214+/-29.099, 0's: 45 Z-trim: 119 B-trim: 597 in 1/63 Lambda= 0.104817 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(6825066) gi|62087832|dbj|BAD92363.1| I-kappa-B-related prot ( 897) 6078 931.5 0 gi|119602498|gb|EAW82092.1| nuclear factor of kapp (1299) 5710 876.0 0 gi|182662416|sp|Q96HA7.2|IKBL2_HUMAN NF-kappa-B in (1378) 5705 875.3 0 gi|14250636|gb|AAH08782.1| Nuclear factor of kappa (1219) 5700 874.5 0 gi|114622205|ref|XP_520018.2| PREDICTED: I-kappa-B (1379) 5594 858.5 0 gi|149066080|gb|EDM15953.1| nuclear factor of kapp (1367) 4070 628.0 7.4e-177 gi|122143239|sp|Q0P5G1.1|IKBL2_BOVIN NF-kappa-B in (1374) 4029 621.8 5.4e-175 gi|194035506|ref|XP_001927565.1| PREDICTED: simila (1373) 3952 610.2 1.7e-171 gi|194035508|ref|XP_001927577.1| PREDICTED: simila (1219) 3522 545.1 6e-152 gi|194215207|ref|XP_001917198.1| PREDICTED: simila (1275) 3381 523.8 1.6e-145 gi|42557296|gb|AAH66068.1| Nuclear factor of kappa (1213) 2555 398.9 6.3e-108 gi|182662417|sp|Q6NZL6.2|IKBL2_MOUSE NF-kappa-B in (1363) 2555 398.9 6.8e-108 gi|148697651|gb|EDL29598.1| nuclear factor of kapp (1363) 2555 398.9 6.8e-108 gi|119602499|gb|EAW82093.1| nuclear factor of kapp ( 718) 2240 351.0 9.5e-94 gi|6580428|emb|CAB63467.1| IkappaBR [Homo sapiens] ( 559) 2229 349.2 2.5e-93 gi|73974886|ref|XP_532357.2| PREDICTED: similar to (1301) 1788 282.9 5.4e-73 gi|126323070|ref|XP_001372025.1| PREDICTED: simila (1366) 1670 265.1 1.3e-67 gi|746415|gb|AAA85819.1| I kappa BR ( 481) 1373 219.7 2.1e-54 gi|182662397|sp|A9JR78.1|IKBL2_DANRE NF-kappa-B in (1427) 1169 189.4 8.7e-45 gi|189530604|ref|XP_001339690.2| PREDICTED: simila (1346) 1166 188.9 1.1e-44 gi|47230061|emb|CAG10475.1| unnamed protein produc (1266) 1073 174.8 1.9e-40 gi|149493585|ref|XP_001515577.1| PREDICTED: simila ( 429) 1053 171.3 7.2e-40 gi|183985768|gb|AAI66347.1| Unknown (protein for I (1282) 1016 166.2 7.4e-38 gi|62185663|gb|AAH92364.1| Zgc:171416 protein [Dan ( 485) 956 156.7 2e-35 gi|194118079|gb|EDW40122.1| GL25090 [Drosophila pe (1404) 908 149.9 6.5e-33 gi|115624683|ref|XP_001203525.1| PREDICTED: simila (1544) 907 149.8 7.7e-33 gi|54642013|gb|EAL30762.1| GA20366-PA [Drosophila (1404) 904 149.3 9.9e-33 gi|193898554|gb|EDV97420.1| GH16854 [Drosophila gr (1402) 856 142.0 1.5e-30 gi|190653193|gb|EDV50436.1| GG14941 [Drosophila er (1405) 844 140.2 5.3e-30 gi|7295200|gb|AAF50523.1| CG7457-PA [Drosophila me (1405) 821 136.7 6e-29 gi|21392114|gb|AAM48411.1| RE28066p [Drosophila me (1405) 818 136.3 8.2e-29 gi|190625212|gb|EDV40736.1| GF23769 [Drosophila an (1393) 813 135.5 1.4e-28 gi|194180183|gb|EDW93794.1| GE20393 [Drosophila ya (1405) 799 133.4 6e-28 gi|194118563|gb|EDW40606.1| GM24993 [Drosophila se (1337) 785 131.3 2.5e-27 gi|10129816|emb|CAC08218.1| IkappaB related protei ( 344) 726 121.7 4.7e-25 gi|190585940|gb|EDV26008.1| hypothetical protein T (1302) 683 115.8 1.1e-22 gi|115696777|ref|XP_001178669.1| PREDICTED: simila (1321) 670 113.9 4.3e-22 gi|108877994|gb|EAT42219.1| conserved hypothetical (1321) 598 103.0 8.1e-19 gi|193919287|gb|EDW18154.1| GI13076 [Drosophila mo (1417) 580 100.3 5.6e-18 gi|157015944|gb|EAA11011.4| AGAP006055-PA [Anophel (1519) 578 100.0 7.2e-18 gi|167868350|gb|EDS31733.1| conserved hypothetical (1439) 574 99.4 1.1e-17 gi|194155347|gb|EDW70531.1| GJ13826 [Drosophila vi (1406) 572 99.1 1.3e-17 gi|194165203|gb|EDW80104.1| GK24203 [Drosophila wi (1423) 570 98.8 1.6e-17 gi|91094261|ref|XP_969516.1| PREDICTED: similar to (1285) 532 93.0 8e-16 gi|156548712|ref|XP_001603097.1| PREDICTED: simila (1312) 524 91.8 1.9e-15 gi|110759457|ref|XP_624762.2| PREDICTED: similar t ( 854) 467 83.0 5.5e-13 gi|193647945|ref|XP_001948353.1| PREDICTED: simila (1258) 459 81.9 1.7e-12 gi|156216108|gb|EDO37052.1| predicted protein [Nem ( 579) 427 76.8 2.8e-11 gi|163772626|gb|EDQ86276.1| predicted protein [Mon (1212) 385 70.7 3.8e-09 gi|6690397|gb|AAF24125.1|AF121775_1 nasopharyngeal ( 366) 366 67.3 1.2e-08 >>gi|62087832|dbj|BAD92363.1| I-kappa-B-related protein (897 aa) initn: 6078 init1: 6078 opt: 6078 Z-score: 4973.7 bits: 931.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 6078; 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