# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Ofh04242.fasta.nr -Q fh04242.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 fh04242, 809 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 3071326396 residues in 8985982 sequences statistics sampled from 60000 to 8981194 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3816+/-0.000186; mu= 12.1027+/- 0.010 mean_var=72.2791+/-14.725, 0's: 28 Z-trim: 51 B-trim: 4408 in 2/67 Lambda= 0.150858 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(8985982) gi|13431382|sp|Q9Y5F1.1|PCDBC_HUMAN RecName: Full= ( 795) 5157 1132.1 0 gi|62510889|sp|Q5DRD7.1|PCDBC_PANTR RecName: Full= ( 795) 5030 1104.4 0 gi|109078974|ref|XP_001087513.1| PREDICTED: protoc ( 795) 4847 1064.6 0 gi|114602298|ref|XP_001145920.1| PREDICTED: simila ( 797) 4657 1023.2 0 gi|62510890|sp|Q5DRD8.1|PCDBB_PANTR RecName: Full= ( 797) 4615 1014.1 0 gi|119582376|gb|EAW61972.1| protocadherin beta 11 ( 797) 4570 1004.3 0 gi|109079037|ref|XP_001091423.1| PREDICTED: protoc ( 797) 4569 1004.1 0 gi|13431383|sp|Q9Y5F2.1|PCDBB_HUMAN RecName: Full= ( 797) 4568 1003.9 0 gi|189066673|dbj|BAG36220.1| unnamed protein produ ( 797) 4564 1003.0 0 gi|168277520|dbj|BAG10738.1| protocadherin beta 11 ( 797) 4562 1002.6 0 gi|62088030|dbj|BAD92462.1| protocadherin beta 11 ( 799) 4562 1002.6 0 gi|194219824|ref|XP_001918074.1| PREDICTED: simila ( 798) 4477 984.1 0 gi|62510887|sp|Q5DRD5.1|PCDBE_PANTR RecName: Full= ( 798) 3973 874.4 0 gi|13431380|sp|Q9Y5E9.1|PCDBE_HUMAN RecName: Full= ( 798) 3962 872.0 0 gi|68532427|gb|AAH98144.1| PCDHB14 protein [Homo s ( 797) 3955 870.4 0 gi|109079047|ref|XP_001091889.1| PREDICTED: protoc ( 798) 3926 864.1 0 gi|109078996|ref|XP_001090002.1| PREDICTED: simila ( 795) 3921 863.0 0 gi|62510884|sp|Q5DRD2.1|PCDB2_PANTR RecName: Full= ( 798) 3893 857.0 0 gi|149017306|gb|EDL76357.1| rCG49392 [Rattus norve ( 802) 3891 856.5 0 gi|114602262|ref|XP_001144418.1| PREDICTED: simila ( 795) 3887 855.6 0 gi|13431373|sp|Q9Y5E2.1|PCDB7_HUMAN RecName: Full= ( 793) 3883 854.8 0 gi|13876298|gb|AAK26069.1| protocadherin beta 19 [ ( 801) 3883 854.8 0 gi|14039478|gb|AAK53237.1|AF326312_1 protocadherin ( 801) 3882 854.6 0 gi|62510883|sp|Q5DRD1.1|PCDB3_PANTR RecName: Full= ( 796) 3881 854.3 0 gi|62896679|dbj|BAD96280.1| protocadherin beta 7 p ( 793) 3880 854.1 0 gi|74184732|dbj|BAE27968.1| unnamed protein produc ( 801) 3878 853.7 0 gi|62896915|dbj|BAD96398.1| protocadherin beta 7 p ( 793) 3877 853.5 0 gi|13431377|sp|Q9Y5E6.1|PCDB3_HUMAN RecName: Full= ( 796) 3877 853.5 0 gi|109079018|ref|XP_001090814.1| PREDICTED: protoc ( 796) 3874 852.8 0 gi|68533589|gb|AAH98574.1| Protocadherin beta 7 [H ( 793) 3871 852.2 0 gi|85396890|gb|AAI04818.1| Protocadherin beta 3 [H ( 796) 3869 851.7 0 gi|62510888|sp|Q5DRD6.1|PCDBD_PANTR RecName: Full= ( 798) 3867 851.3 0 gi|13431376|sp|Q9Y5E5.1|PCDB4_HUMAN RecName: Full= ( 795) 3866 851.1 0 gi|114602284|ref|XP_001144937.1| PREDICTED: protoc ( 798) 3866 851.1 0 gi|114602248|ref|XP_001144032.1| PREDICTED: protoc ( 798) 3865 850.9 0 gi|62089076|dbj|BAD92982.1| protocadherin beta 2 p ( 784) 3860 849.8 0 gi|189069366|dbj|BAG36398.1| unnamed protein produ ( 795) 3860 849.8 0 gi|114602268|ref|XP_001144643.1| PREDICTED: simila ( 793) 3857 849.1 0 gi|189054431|dbj|BAG37204.1| unnamed protein produ ( 798) 3856 848.9 0 gi|12654693|gb|AAH01186.1| Protocadherin beta 5 [H ( 795) 3854 848.5 0 gi|62088366|dbj|BAD92630.1| protocadherin beta 5 p ( 796) 3854 848.5 0 gi|62510879|sp|Q5DRC7.1|PCDB7_PANTR RecName: Full= ( 793) 3853 848.2 0 gi|13431378|sp|Q9Y5E7.1|PCDB2_HUMAN RecName: Full= ( 798) 3853 848.2 0 gi|8926619|gb|AAF81914.1|AF217757_1 protocadherin ( 776) 3852 848.0 0 gi|114602306|ref|XP_001146165.1| PREDICTED: protoc ( 776) 3851 847.8 0 gi|108885347|sp|Q9NRJ7.2|PCDBG_HUMAN RecName: Full ( 776) 3849 847.4 0 gi|62510882|sp|Q5DRD0.1|PCDB4_PANTR RecName: Full= ( 795) 3848 847.2 0 gi|62510886|sp|Q5DRD4.1|PCDBH_PANTR RecName: Full= ( 788) 3844 846.3 0 gi|13431375|sp|Q9Y5E4.1|PCDB5_HUMAN RecName: Full= ( 795) 3843 846.1 0 gi|68534244|gb|AAH98575.1| Protocadherin beta 2 [H ( 798) 3842 845.9 0 >>gi|13431382|sp|Q9Y5F1.1|PCDBC_HUMAN RecName: Full=Prot (795 aa) initn: 5157 init1: 5157 opt: 5157 Z-score: 6059.3 bits: 1132.1 E(): 0 Smith-Waterman score: 5157; 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