# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Ofh11147.fasta.nr -Q fh11147.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 fh11147, 1210 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2355815254 residues in 6825066 sequences statistics sampled from 60000 to 6816003 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1319+/-0.000187; mu= 15.2693+/- 0.011 mean_var=79.3354+/-15.443, 0's: 45 Z-trim: 123 B-trim: 13 in 1/64 Lambda= 0.143993 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(6825066) gi|62088238|dbj|BAD92566.1| Neural cell adhesion m (1210) 8183 1710.5 0 gi|110832793|sp|O00533.2|CHL1_HUMAN Neural cell ad (1208) 8171 1708.0 0 gi|114585164|ref|XP_001136570.1| PREDICTED: cell a (1209) 8099 1693.0 0 gi|194221130|ref|XP_001497302.2| PREDICTED: simila (1209) 7563 1581.7 0 gi|193785234|dbj|BAG54387.1| unnamed protein produ (1113) 7548 1578.5 0 gi|124297745|gb|AAI31672.1| Cell adhesion molecule (1209) 7088 1483.0 0 gi|148666973|gb|EDK99389.1| cell adhesion molecule (1210) 7088 1483.0 0 gi|81908490|sp|P70232.1|CHL1_MOUSE Neural cell adh (1209) 6978 1460.2 0 gi|114585168|ref|XP_001136479.1| PREDICTED: cell a (1155) 6835 1430.4 0 gi|2190958|gb|AAB60937.1| neural cell adhesion mol (1224) 6610 1383.7 0 gi|119584273|gb|EAW63869.1| cell adhesion molecule (1224) 6605 1382.7 0 gi|27894376|ref|NP_006605.2| cell adhesion molecul (1224) 6604 1382.5 0 gi|114585156|ref|XP_516242.2| PREDICTED: cell adhe (1225) 6577 1376.9 0 gi|109035955|ref|XP_001097680.1| PREDICTED: simila (1199) 6495 1359.8 0 gi|73985057|ref|XP_533760.2| PREDICTED: similar to (1245) 6149 1288.0 0 gi|119914461|ref|XP_580533.3| PREDICTED: similar t (1225) 6057 1268.8 0 gi|109474014|ref|XP_001077843.1| PREDICTED: simila (1225) 5814 1218.4 0 gi|126336357|ref|XP_001373792.1| PREDICTED: simila (1224) 5027 1054.9 0 gi|26333963|dbj|BAC30699.1| unnamed protein produc (1150) 4586 963.2 0 gi|118097056|ref|XP_414434.2| PREDICTED: similar t (1225) 4454 935.8 0 gi|149638023|ref|XP_001505304.1| PREDICTED: simila (1155) 4384 921.3 0 gi|149036843|gb|EDL91461.1| rCG56047 [Rattus norve ( 733) 4209 884.8 0 gi|26339468|dbj|BAC33405.1| unnamed protein produc ( 544) 3324 700.8 4.9e-199 gi|47227361|emb|CAF96910.1| unnamed protein produc (1154) 2744 580.6 1.6e-162 gi|123220711|emb|CAM22465.1| L1 cell adhesion mole (1250) 2575 545.5 6.3e-152 gi|148697923|gb|EDL29870.1| L1 cell adhesion molec (1255) 2575 545.5 6.3e-152 gi|167045807|gb|ABZ10475.1| L1 cell adhesion molec (1252) 2560 542.4 5.5e-151 gi|123220712|emb|CAM22466.1| L1 cell adhesion mole (1255) 2559 542.2 6.3e-151 gi|34785231|gb|AAH56988.1| L1 cell adhesion molecu (1259) 2559 542.2 6.3e-151 gi|74009165|ref|XP_549364.2| PREDICTED: similar to (1256) 2558 542.0 7.3e-151 gi|145652526|gb|ABP88252.1| non-neural L1CAM [Homo (1248) 2557 541.8 8.4e-151 gi|119593193|gb|EAW72787.1| L1 cell adhesion molec (1248) 2548 539.9 3.1e-150 gi|119593195|gb|EAW72789.1| L1 cell adhesion molec (1255) 2545 539.3 4.7e-150 gi|194228433|ref|XP_001491834.2| PREDICTED: simila (1312) 2541 538.5 8.7e-150 gi|33354079|dbj|BAC81123.1| L1 cell adhesion molec (1255) 2538 537.8 1.3e-149 gi|114690628|ref|XP_001139376.1| PREDICTED: simila (1257) 2536 537.4 1.7e-149 gi|109132753|ref|XP_001087986.1| PREDICTED: L1 cel (1248) 2534 537.0 2.3e-149 gi|347807|gb|AAA59476.1| cell adhesion molecule L1 (1253) 2534 537.0 2.3e-149 gi|33354077|dbj|BAC81122.1| L1 cell adhesion molec (1255) 2534 537.0 2.3e-149 gi|1705571|sp|P32004|L1CAM_HUMAN Neural cell adhes (1257) 2534 537.0 2.3e-149 gi|158260531|dbj|BAF82443.1| unnamed protein produ (1257) 2534 537.0 2.3e-149 gi|56741|emb|CAA41860.1| neural cell adhesion mole (1255) 2533 536.8 2.7e-149 gi|20455467|sp|Q05695|L1CAM_RAT Neural cell adhesi (1259) 2533 536.8 2.7e-149 gi|184185488|gb|ACC68891.1| neural cell adhesion m (1260) 2533 536.8 2.7e-149 gi|226133|prf||1411301A neural adhesion mol L1 (1260) 2532 536.6 3.1e-149 gi|49119255|gb|AAH73282.1| Unknown (protein for MG (1225) 2530 536.2 4e-149 gi|170649623|gb|ACB21210.1| L1 cell adhesion molec (1252) 2529 536.0 4.7e-149 gi|33354081|dbj|BAC81124.1| L1 cell adhesion molec (1255) 2529 536.0 4.7e-149 gi|73981717|ref|XP_856963.1| PREDICTED: similar to (1164) 2527 535.5 6e-149 gi|4732113|gb|AAD28610.1|AF129167_1 neural cell ad (1248) 2527 535.5 6.3e-149 >>gi|62088238|dbj|BAD92566.1| Neural cell adhesion molec (1210 aa) initn: 8183 init1: 8183 opt: 8183 Z-score: 9179.1 bits: 1710.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 8183; 100.000% identity (100.000% similar) in 1210 aa overlap (1-1210:1-1210) 10 20 30 40 50 60 fh1114 RAMEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQSKVQVAFPFDEYFQIECE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 RAMEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQSKVQVAFPFDEYFQIECE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 fh1114 AKGNPEPTFSWTKDGNPFYFTDHRIIPSNNSGTFRIPNEGHISHFQGKYRCFASNKLGIA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 AKGNPEPTFSWTKDGNPFYFTDHRIIPSNNSGTFRIPNEGHISHFQGKYRCFASNKLGIA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 fh1114 MSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 MSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 fh1114 RVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSSNSIKQRKPKLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 RVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSSNSIKQRKPKLL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 fh1114 LPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIGGDLPKGREAKENYGKTLKIE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 LPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIGGDLPKGREAKENYGKTLKIE 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 fh1114 NVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQSAVYSTGSNGILLCEAEGEP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 NVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQSAVYSTGSNGILLCEAEGEP 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 fh1114 QPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPREISFTNLQPNHTAVYQCEASNVHGTILANANIDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 QPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPREISFTNLQPNHTAVYQCEASNVHGTILANANIDV 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 fh1114 VDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSWQKVEEVKPLEGRRYHIYENGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 VDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSWQKVEEVKPLEGRRYHIYENGT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 fh1114 LQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKLRVSPKNPRIPKLHMLELHCES :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 LQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKLRVSPKNPRIPKLHMLELHCES 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 fh1114 KCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLTISNVTLEDQGIYCCSAHTALD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 KCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLTISNVTLEDQGIYCCSAHTALD 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 fh1114 SAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQNRSVRLTWEAGADHNSNISEYIVEFEGNKEEPGR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 SAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQNRSVRLTWEAGADHNSNISEYIVEFEGNKEEPGR 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 fh1114 WEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQPSDHHETPPAAPDRNPQNI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 WEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQPSDHHETPPAAPDRNPQNI 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 fh1114 RVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQGAPVEWEEETVTNHTLRVMTPAVY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 RVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQGAPVEWEEETVTNHTLRVMTPAVY 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 fh1114 APYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPVIHGVDVINSTLVKVTWSTVPKDRV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 APYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPVIHGVDVINSTLVKVTWSTVPKDRV 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 fh1114 HGRLKGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSLDAFSEFHLTVLAYNSK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 HGRLKGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSLDAFSEFHLTVLAYNSK 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 fh1114 GAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTATLSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIIND :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 GAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTATLSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIIND 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 fh1114 TYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYLRACTSQGCGKPITEESSTLGEGSKG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 TYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYLRACTSQGCGKPITEESSTLGEGSKG 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 fh1114 IGKISGVNLTQKTHPVEVFEPGAEHIVRLMTKNWGDNDSIFQDVIETRGREYAGLYDDIS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 IGKISGVNLTQKTHPVEVFEPGAEHIVRLMTKNWGDNDSIFQDVIETRGREYAGLYDDIS 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 fh1114 TQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEIQSVKDETFGEYSD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 TQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEIQSVKDETFGEYSD 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 fh1114 SDEKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDHGLFSEDGSFIGAYAGSKEKGSVESNG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 SDEKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDHGLFSEDGSFIGAYAGSKEKGSVESNG 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 fh1114 SSTATFPLRA :::::::::: gi|620 SSTATFPLRA 1210 >>gi|110832793|sp|O00533.2|CHL1_HUMAN Neural cell adhesi (1208 aa) initn: 8171 init1: 8171 opt: 8171 Z-score: 9165.6 bits: 1708.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 8171; 100.000% identity (100.000% similar) in 1208 aa overlap (3-1210:1-1208) 10 20 30 40 50 60 fh1114 RAMEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQSKVQVAFPFDEYFQIECE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|110 MEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQSKVQVAFPFDEYFQIECE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 fh1114 AKGNPEPTFSWTKDGNPFYFTDHRIIPSNNSGTFRIPNEGHISHFQGKYRCFASNKLGIA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|110 AKGNPEPTFSWTKDGNPFYFTDHRIIPSNNSGTFRIPNEGHISHFQGKYRCFASNKLGIA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 fh1114 MSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|110 MSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 fh1114 RVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSSNSIKQRKPKLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|110 RVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSSNSIKQRKPKLL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 fh1114 LPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIGGDLPKGREAKENYGKTLKIE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|110 LPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIGGDLPKGREAKENYGKTLKIE 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 fh1114 NVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQSAVYSTGSNGILLCEAEGEP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|110 NVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQSAVYSTGSNGILLCEAEGEP 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 fh1114 QPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPREISFTNLQPNHTAVYQCEASNVHGTILANANIDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|110 QPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPREISFTNLQPNHTAVYQCEASNVHGTILANANIDV 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 fh1114 VDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSWQKVEEVKPLEGRRYHIYENGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|110 VDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSWQKVEEVKPLEGRRYHIYENGT 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 fh1114 LQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKLRVSPKNPRIPKLHMLELHCES :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|110 LQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKLRVSPKNPRIPKLHMLELHCES 480 490 500 510 520 530 550 560 570 580 590 600 fh1114 KCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLTISNVTLEDQGIYCCSAHTALD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|110 KCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLTISNVTLEDQGIYCCSAHTALD 540 550 560 570 580 590 610 620 630 640 650 660 fh1114 SAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQNRSVRLTWEAGADHNSNISEYIVEFEGNKEEPGR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|110 SAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQNRSVRLTWEAGADHNSNISEYIVEFEGNKEEPGR 600 610 620 630 640 650 670 680 690 700 710 720 fh1114 WEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQPSDHHETPPAAPDRNPQNI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|110 WEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQPSDHHETPPAAPDRNPQNI 660 670 680 690 700 710 730 740 750 760 770 780 fh1114 RVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQGAPVEWEEETVTNHTLRVMTPAVY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|110 RVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQGAPVEWEEETVTNHTLRVMTPAVY 720 730 740 750 760 770 790 800 810 820 830 840 fh1114 APYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPVIHGVDVINSTLVKVTWSTVPKDRV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|110 APYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPVIHGVDVINSTLVKVTWSTVPKDRV 780 790 800 810 820 830 850 860 870 880 890 900 fh1114 HGRLKGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSLDAFSEFHLTVLAYNSK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|110 HGRLKGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSLDAFSEFHLTVLAYNSK 840 850 860 870 880 890 910 920 930 940 950 960 fh1114 GAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTATLSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIIND :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|110 GAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTATLSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIIND 900 910 920 930 940 950 970 980 990 1000 1010 1020 fh1114 TYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYLRACTSQGCGKPITEESSTLGEGSKG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|110 TYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYLRACTSQGCGKPITEESSTLGEGSKG 960 970 980 990 1000 1010 1030 1040 1050 1060 1070 1080 fh1114 IGKISGVNLTQKTHPVEVFEPGAEHIVRLMTKNWGDNDSIFQDVIETRGREYAGLYDDIS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|110 IGKISGVNLTQKTHPVEVFEPGAEHIVRLMTKNWGDNDSIFQDVIETRGREYAGLYDDIS 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1090 1100 1110 1120 1130 1140 fh1114 TQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEIQSVKDETFGEYSD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|110 TQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEIQSVKDETFGEYSD 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1150 1160 1170 1180 1190 1200 fh1114 SDEKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDHGLFSEDGSFIGAYAGSKEKGSVESNG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|110 SDEKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDHGLFSEDGSFIGAYAGSKEKGSVESNG 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1210 fh1114 SSTATFPLRA :::::::::: gi|110 SSTATFPLRA 1200 >>gi|114585164|ref|XP_001136570.1| PREDICTED: cell adhes (1209 aa) initn: 8097 init1: 6883 opt: 8099 Z-score: 9084.8 bits: 1693.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 8099; 99.007% identity (99.669% similar) in 1209 aa overlap (3-1210:1-1209) 10 20 30 40 50 60 fh1114 RAMEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQSKVQVAFPFDEYFQIECE :::::::::::: :.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 MEPLLLGRGLIVSLIFFLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQSKVQVAFPFDEYFQIECE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 fh1114 AKGNPEPTFSWTKDGNPFYFTDHRIIPSNNSGTFRIPNEGHISHFQGKYRCFASNKLGIA ::::::: :::::::::::::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 AKGNPEPIFSWTKDGNPFYFTDHRIMTSNNSGTFRIPNEGHISHFQGKYRCFASNKLGIA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 fh1114 MSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 MSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 fh1114 RVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSSNSIKQRKPKLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 RVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSSNSIKQRKPKLL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 fh1114 LPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIGGDLPKGREAKENYGKTLKIE ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::: gi|114 LPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIGGDLPKGRETKENYGKTLKIE 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 fh1114 NVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQSAVYSTGSNGILLCEAEGEP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 NVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQSAVYSTGSNGILLCEAEGEP 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 fh1114 QPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPREISFTNLQPNHTAVYQCEASNVHGTILANANIDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 QPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPREISFTNLQPNHTAVYQCEASNVHGTILANANIDV 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 fh1114 VDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSWQKVEEVKPLEGRRYHIYENGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 VDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSWQKVEEVKPLEGRRYHIYENGT 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 fh1114 LQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKLRVSPKNPRIPKLHMLELHCES :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 LQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKLRVSPKNPRIPKLHMLELHCES 480 490 500 510 520 530 550 560 570 580 590 600 fh1114 KCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLTISNVTLEDQGIYCCSAHTALD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 KCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLTISNVTLEDQGIYCCSAHTALD 540 550 560 570 580 590 610 620 630 640 650 660 fh1114 SAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQNRSVRLTWEAGADHNSNISEYIVEFEGNKEEPGR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 SAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQNRSVRLTWEAGADHNSNISEYIVEFEGNKEEPGR 600 610 620 630 640 650 670 680 690 700 710 720 fh1114 WEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQPSDHHETPPAAPDRNPQNI ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::: gi|114 WEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQPSDRHETPPAAPDRNPQNI 660 670 680 690 700 710 730 740 750 760 770 780 fh1114 RVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQGAPVEWEEETVTNHTLRVMTPAVY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 RVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQGAPVEWEEETVTNHTLRVMTPAVY 720 730 740 750 760 770 790 800 810 820 830 840 fh1114 APYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPVIHGVDVINSTLVKVTWSTVPKDRV ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: gi|114 APYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPVIHGVDVINSTLVKVTWSTIPKDRV 780 790 800 810 820 830 850 860 870 880 890 900 fh1114 HGRLKGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSLDAFSEFHLTVLAYNSK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 HGRLKGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSLDAFSEFHLTVLAYNSK 840 850 860 870 880 890 910 920 930 940 950 960 fh1114 GAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTATLSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIIND :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::: gi|114 GAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTATLSWGVPKKLNGNLTGYLLQYQIIND 900 910 920 930 940 950 970 980 990 1000 1010 1020 fh1114 TYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYLRACTSQGCGKPITEESSTLGEGSKG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 TYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYLRACTSQGCGKPITEESSTLGEGSKG 960 970 980 990 1000 1010 1030 1040 1050 1060 1070 fh1114 IGKIS-GVNLTQKTHPVEVFEPGAEHIVRLMTKNWGDNDSIFQDVIETRGREYAGLYDDI ::::: ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 IGKISEGVNLTQKTHPIEVFEPGAEHIVRLMTKNWGDNDSIFQDVIETRGREYAGLYDDI 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 fh1114 STQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEIQSVKDETFGEYS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 STQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEIQSVKDETFGEYS 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 fh1114 DSDEKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDHGLFSEDGSFIGAYAGSKEKGSVESN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 DSDEKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDHGLFSEDGSFIGAYAGSKEKGSVESN 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 fh1114 GSSTATFPLRA ::::::::::: gi|114 GSSTATFPLRA 1200 >>gi|194221130|ref|XP_001497302.2| PREDICTED: similar to (1209 aa) initn: 7561 init1: 6412 opt: 7563 Z-score: 8483.0 bits: 1581.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 7563; 91.315% identity (97.436% similar) in 1209 aa overlap (3-1210:1-1209) 10 20 30 40 50 60 fh1114 RAMEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQSKVQVAFPFDEYFQIECE :: :: :::::. :.:.::::: ::::: ::::::::::::::::::::::::::::: gi|194 MEMLLSGRGLIISLIFFLLKFSTAIEIPLSVQQVPTIIKQSKVQVAFPFDEYFQIECE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 fh1114 AKGNPEPTFSWTKDGNPFYFTDHRIIPSNNSGTFRIPNEGHISHFQGKYRCFASNKLGIA :::::::::.:::: .:: ..: .:: :::::::.:::::::::::::::::::::::.: gi|194 AKGNPEPTFTWTKDDKPFNLSDPQIIVSNNSGTFKIPNEGHISHFQGKYRCFASNKLGVA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 fh1114 MSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDE .:::::::::.:::::::::.:::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: gi|194 VSEEIEFIVPNVPKFPKEKIEPLEVEEGDAIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 fh1114 RVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSSNSIKQRKPKLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: gi|194 RVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSSNSIKQRKPRLL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 fh1114 LPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIGGDLPKGREAKENYGKTLKIE ::: :::.:::.:::::: :::::::::::::::::::.:::::::::.::::::::::: gi|194 LPPPESGGESSLTILKGETLLLECFAEGLPTPQVDWNKLGGDLPKGRETKENYGKTLKIE 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 fh1114 NVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQSAVYSTGSNGILLCEAEGEP ::::.::: :::::.::::.::::::. :::::::::::::.::::::.::::::::::: gi|194 NVSYRDKGIYRCTANNFLGSATHDFHITVEEPPRWTKKPQSGVYSTGSSGILLCEAEGEP 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 fh1114 QPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPREISFTNLQPNHTAVYQCEASNVHGTILANANIDV .:::::::::::....::::::: ::::::::::::::::::::::.:::::::::::: gi|194 EPTIKWRVNGSPIEKNPFAGDVVSSREISFTNLQPNHTAVYQCEASNAHGTILANANIDV 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 fh1114 VDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSWQKVEEVKPLEGRRYHIYENGT :::::::::.: :::::::::::::.::::.::::.::::::::.::::::::::::::: gi|194 VDVRPLIQTEDEENYATVVGYSAFLYCEFFSSPEAIVSWQKVEEAKPLEGRRYHIYENGT 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 fh1114 LQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKLRVSPKNPRIPKLHMLELHCES ::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::.::::::.:. : :::.::: gi|194 LQINRTTEEDAGSYSCWVENAKGKTAVTANLDIRNATKLRISPKNPRVPRSHTLELRCES 480 490 500 510 520 530 550 560 570 580 590 600 fh1114 KCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLTISNVTLEDQGIYCCSAHTALD :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: :::.:::: gi|194 TCDSYLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLTISNVTLEDKGIYSCSAQTALD 540 550 560 570 580 590 610 620 630 640 650 660 fh1114 SAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQNRSVRLTWEAGADHNSNISEYIVEFEGNKEEPGR :.:::::::.::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::: gi|194 SVADITQVTILDVPDPPENLHLSERQNRSVRLTWEAGDDHNSNISEYIVEFEGNKEEPGR 600 610 620 630 640 650 670 680 690 700 710 720 fh1114 WEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQPSDHHETPPAAPDRNPQNI ::::::::::.:::.: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: gi|194 WEELTRVQGKETTVLLSLAPYVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQPSDHHETPPAAPDKNPQNI 660 670 680 690 700 710 730 740 750 760 770 780 fh1114 RVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQGAPVEWEEETVTNHTLRVMTPAVY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: gi|194 RVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQGAPVEWEEETVTNHTLRVMTPTVY 720 730 740 750 760 770 790 800 810 820 830 840 fh1114 APYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPVIHGVDVINSTLVKVTWSTVPKDRV :::::.:::.:.:::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::..::::: gi|194 APYDVQVQAVNHLGSGPEPQSVVLYSGEDYPDTAPVIHGVDVINSTLVKVTWSSIPKDRV 780 790 800 810 820 830 850 860 870 880 890 900 fh1114 HGRLKGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSLDAFSEFHLTVLAYNSK ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::: gi|194 HGHLKGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRSYGMVPSLDAFSEFHLTVLAYNSK 840 850 860 870 880 890 910 920 930 940 950 960 fh1114 GAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTATLSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIIND ::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|194 GAGPESEPYTFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTATLSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIIND 900 910 920 930 940 950 970 980 990 1000 1010 1020 fh1114 TYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYLRACTSQGCGKPITEESSTLGEGSKG :::.::::::::::::.::::: ::::.::::::::::::.::::::::::.:::::::. gi|194 TYEVGELNDINITTPSQPSWHLRNLNAATKYKFYLRACTSKGCGKPITEESTTLGEGSKS 960 970 980 990 1000 1010 1030 1040 1050 1060 1070 fh1114 IGKIS-GVNLTQKTHPVEVFEPGAEHIVRLMTKNWGDNDSIFQDVIETRGREYAGLYDDI ::::: ::::::: ::::::::::::.:::.:::: ::.:::.:::.::::::::::::: gi|194 IGKISEGVNLTQKIHPVEVFEPGAEHVVRLLTKNWVDNNSIFEDVIDTRGREYAGLYDDI 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 fh1114 STQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEIQSVKDETFGEYS ::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::::::::::::.:::::::::::: gi|194 STQGWFIGLMCAIALLTLILLTVCFVKRNKGGKYSVKEKEDLHPDPEVQSVKDETFGEYS 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 fh1114 DSDEKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDHGLFSEDGSFIGAYAGSKEKGSVESN ::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::.:::::::::.::::::::::: gi|194 DSDEKPLKGSLRSLNRDMQATESADSLVEYGEGDHGLFNEDGSFIGAYTGSKEKGSVESN 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 fh1114 GSSTATFPLRA ::::::::::: gi|194 GSSTATFPLRA 1200 >>gi|193785234|dbj|BAG54387.1| unnamed protein product [ (1113 aa) initn: 7548 init1: 7548 opt: 7548 Z-score: 8466.6 bits: 1578.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 7548; 100.000% identity (100.000% similar) in 1113 aa overlap (3-1115:1-1113) 10 20 30 40 50 60 fh1114 RAMEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQSKVQVAFPFDEYFQIECE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 MEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQSKVQVAFPFDEYFQIECE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 fh1114 AKGNPEPTFSWTKDGNPFYFTDHRIIPSNNSGTFRIPNEGHISHFQGKYRCFASNKLGIA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 AKGNPEPTFSWTKDGNPFYFTDHRIIPSNNSGTFRIPNEGHISHFQGKYRCFASNKLGIA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 fh1114 MSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 MSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 fh1114 RVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSSNSIKQRKPKLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 RVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSSNSIKQRKPKLL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 fh1114 LPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIGGDLPKGREAKENYGKTLKIE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 LPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIGGDLPKGREAKENYGKTLKIE 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 fh1114 NVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQSAVYSTGSNGILLCEAEGEP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 NVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQSAVYSTGSNGILLCEAEGEP 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 fh1114 QPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPREISFTNLQPNHTAVYQCEASNVHGTILANANIDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 QPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPREISFTNLQPNHTAVYQCEASNVHGTILANANIDV 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 fh1114 VDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSWQKVEEVKPLEGRRYHIYENGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 VDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSWQKVEEVKPLEGRRYHIYENGT 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 fh1114 LQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKLRVSPKNPRIPKLHMLELHCES :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 LQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKLRVSPKNPRIPKLHMLELHCES 480 490 500 510 520 530 550 560 570 580 590 600 fh1114 KCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLTISNVTLEDQGIYCCSAHTALD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 KCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLTISNVTLEDQGIYCCSAHTALD 540 550 560 570 580 590 610 620 630 640 650 660 fh1114 SAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQNRSVRLTWEAGADHNSNISEYIVEFEGNKEEPGR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 SAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQNRSVRLTWEAGADHNSNISEYIVEFEGNKEEPGR 600 610 620 630 640 650 670 680 690 700 710 720 fh1114 WEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQPSDHHETPPAAPDRNPQNI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 WEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQPSDHHETPPAAPDRNPQNI 660 670 680 690 700 710 730 740 750 760 770 780 fh1114 RVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQGAPVEWEEETVTNHTLRVMTPAVY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 RVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQGAPVEWEEETVTNHTLRVMTPAVY 720 730 740 750 760 770 790 800 810 820 830 840 fh1114 APYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPVIHGVDVINSTLVKVTWSTVPKDRV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 APYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPVIHGVDVINSTLVKVTWSTVPKDRV 780 790 800 810 820 830 850 860 870 880 890 900 fh1114 HGRLKGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSLDAFSEFHLTVLAYNSK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 HGRLKGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSLDAFSEFHLTVLAYNSK 840 850 860 870 880 890 910 920 930 940 950 960 fh1114 GAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTATLSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIIND :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 GAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTATLSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIIND 900 910 920 930 940 950 970 980 990 1000 1010 1020 fh1114 TYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYLRACTSQGCGKPITEESSTLGEGSKG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 TYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYLRACTSQGCGKPITEESSTLGEGSKG 960 970 980 990 1000 1010 1030 1040 1050 1060 1070 1080 fh1114 IGKISGVNLTQKTHPVEVFEPGAEHIVRLMTKNWGDNDSIFQDVIETRGREYAGLYDDIS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 IGKISGVNLTQKTHPVEVFEPGAEHIVRLMTKNWGDNDSIFQDVIETRGREYAGLYDDIS 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1090 1100 1110 1120 1130 1140 fh1114 TQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEIQSVKDETFGEYSD ::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|193 TQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSV 1080 1090 1100 1110 1150 1160 1170 1180 1190 1200 fh1114 SDEKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDHGLFSEDGSFIGAYAGSKEKGSVESNG >>gi|124297745|gb|AAI31672.1| Cell adhesion molecule wit (1209 aa) initn: 7168 init1: 5883 opt: 7088 Z-score: 7949.7 bits: 1483.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 7088; 84.864% identity (94.789% similar) in 1209 aa overlap (3-1210:2-1209) 10 20 30 40 50 60 fh1114 RAMEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQSKVQVAFPFDEYFQIECE :: : :::::. :.:::::.: : ::: ::::::::.::: :::::::::::::::: gi|124 MMELPLCGRGLILSLIFLLLKLSAA-EIPLSVQQVPTIVKQSYVQVAFPFDEYFQIECE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 fh1114 AKGNPEPTFSWTKDGNPFYFTDHRIIPSNNSGTFRIPNEGHISHFQGKYRCFASNKLGIA ::::::: :::::: .:: ..: ::: .::::::.::::::::::::::::::::.:: : gi|124 AKGNPEPIFSWTKDDKPFDLSDPRIIAANNSGTFKIPNEGHISHFQGKYRCFASNRLGTA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 fh1114 MSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDE .:::::::::.:::::::::.:..::::: :::::::::::::::::::::::::::::: gi|124 VSEEIEFIVPGVPKFPKEKIEPIDVEEGDSIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 fh1114 RVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSSNSIKQRKPKLL ::::::.::::::::::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::: gi|124 RVYMSQRGDLYFANVEENDSRNDYCCFAAFPKLRTIVQKMPMKLTVNSSNSIKQRKPKLL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 fh1114 LPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIGGDLPKGREAKENYGKTLKIE :::.. :: :. :.:::. :::::::::::::...:.: :..::.:: . : . :::::: gi|124 LPPAQMGSLSAKTVLKGDTLLLECFAEGLPTPHIQWSKPGSELPEGRATIEVHEKTLKIE 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 fh1114 NVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQSAVYSTGSNGILLCEAEGEP :.::::.:::::::.:.:: :.::::: ::::::: ::::::::::::.::::::::::: gi|124 NISYQDRGNYRCTANNLLGKASHDFHVTVEEPPRWKKKPQSAVYSTGSSGILLCEAEGEP 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 fh1114 QPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPREISFTNLQPNHTAVYQCEASNVHGTILANANIDV :::::::.:: :...::: :: .:::::::::: ::::.::::::::.:::::::::::: gi|124 QPTIKWRLNGLPIEKHPFPGDFMFPREISFTNLLPNHTGVYQCEASNIHGTILANANIDV 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 fh1114 VDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSWQKVEEVKPLEGRRYHIYENGT .:: :::.::. ::::::::::::::::.::::.:.: :. ..:..:::: ::: .:::: gi|124 IDVIPLIKTKNEENYATVVGYSAFLHCEYFASPKATVVWEVADETHPLEGDRYHTHENGT 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 fh1114 LQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKLRVSPKNPRIPKLHMLELHCES :.: ::::::::::::::.::.::...::::::::::::::::::::::: :.:::.::: gi|124 LEIYRTTEEDAGSYSCWVDNAMGKAVITANLDIRNATKLRVSPKNPRIPKSHVLELYCES 480 490 500 510 520 530 550 560 570 580 590 600 fh1114 KCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLTISNVTLEDQGIYCCSAHTALD .:::::::::::::::::::::.::::::::.:::: :::::.: ::::.: :::.:.:: gi|124 QCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEMNGTEDGRIVIDGAYLTISNITAEDQGVYSCSAQTSLD 540 550 560 570 580 590 610 620 630 640 650 660 fh1114 SAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQNRSVRLTWEAGADHNSNISEYIVEFEGNKEEPGR :... :::::: ::::: ::::::::::::::.:::: ::::.:::::::::::.::::. gi|124 STSEKTQVTVLGVPDPPGNLHLSERQNRSVRLSWEAGDDHNSKISEYIVEFEGNREEPGK 600 610 620 630 640 650 670 680 690 700 710 720 fh1114 WEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQPSDHHETPPAAPDRNPQNI :::::::::..: :.: :::.::::::: ::::::::. : :::::::::::::.::::: gi|124 WEELTRVQGEETDVVLSLAPYVRYQFRVTAVNEVGRSHASLPSDHHETPPAAPDKNPQNI 660 670 680 690 700 710 730 740 750 760 770 780 fh1114 RVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQGAPVEWEEETVTNHTLRVMTPAVY :::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::: ::::: :::::::::::.:: gi|124 RVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYKVSWKPQGAPEEWEEEIVTNHTLRVMTPTVY 720 730 740 750 760 770 790 800 810 820 830 840 fh1114 APYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPVIHGVDVINSTLVKVTWSTVPKDRV :::::::::::::::.:::: ::::::::::.:::::. :::.::::::::::..::. : gi|124 APYDVKVQAINQLGSSPDPQPVTLYSGEDYPSTAPVIQRVDVMNSTLVKVTWSSIPKETV 780 790 800 810 820 830 850 860 870 880 890 900 fh1114 HGRLKGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSLDAFSEFHLTVLAYNSK :: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::: gi|124 HGLLRGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSLDPFSEFHLTVLAYNSK 840 850 860 870 880 890 910 920 930 940 950 960 fh1114 GAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTATLSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIIND :::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|124 GAGPESEPYIFQTPEGVPEQPSFLKVIKVDKDTATLSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIIND 900 910 920 930 940 950 970 980 990 1000 1010 1020 fh1114 TYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYLRACTSQGCGKPITEESSTLGEGSKG :::.::::.::.::::: ::::::::.:::::::::::::.::::::.::..:::::::: gi|124 TYELGELNEINVTTPSKSSWHLSNLNSTTKYKFYLRACTSRGCGKPISEEGATLGEGSKG 960 970 980 990 1000 1010 1030 1040 1050 1060 1070 fh1114 IGKIS-GVNLTQKTHPVEVFEPGAEHIVRLMTKNWGDNDSIFQDVIETRGREYAGLYDDI : ::. :::.::: :::::. :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: gi|124 IRKITEGVNVTQKIHPVEVLVPGAEHIVHLMTKNWGDNDSIFQDVIETRGREYAGLYDDI 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 fh1114 STQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEIQSVKDETFGEYS ::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::::::::.::.::::::::: gi|124 STQGWFIGLMCAIALLTLILLTICFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEVQSAKDETFGEYS 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 fh1114 DSDEKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDHGLFSEDGSFIGAYAGSKEKGSVESN ::::::::::::::::.:::::::::::::::::...:.:::::::::.:.::::::::: gi|124 DSDEKPLKGSLRSLNRNMQPTESADSLVEYGEGDQSIFNEDGSFIGAYTGAKEKGSVESN 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 fh1114 GSSTATFPLRA ::::::::::: gi|124 GSSTATFPLRA 1200 >>gi|148666973|gb|EDK99389.1| cell adhesion molecule wit (1210 aa) initn: 7168 init1: 5883 opt: 7088 Z-score: 7949.7 bits: 1483.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 7088; 84.864% identity (94.789% similar) in 1209 aa overlap (3-1210:3-1210) 10 20 30 40 50 60 fh1114 RAMEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQSKVQVAFPFDEYFQIECE :: : :::::. :.:::::.: : ::: ::::::::.::: :::::::::::::::: gi|148 GMMELPLCGRGLILSLIFLLLKLSAA-EIPLSVQQVPTIVKQSYVQVAFPFDEYFQIECE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 fh1114 AKGNPEPTFSWTKDGNPFYFTDHRIIPSNNSGTFRIPNEGHISHFQGKYRCFASNKLGIA ::::::: :::::: .:: ..: ::: .::::::.::::::::::::::::::::.:: : gi|148 AKGNPEPIFSWTKDDKPFDLSDPRIIAANNSGTFKIPNEGHISHFQGKYRCFASNRLGTA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 fh1114 MSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDE .:::::::::.:::::::::.:..::::: :::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 VSEEIEFIVPGVPKFPKEKIEPIDVEEGDSIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 fh1114 RVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSSNSIKQRKPKLL ::::::.::::::::::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::: gi|148 RVYMSQRGDLYFANVEENDSRNDYCCFAAFPKLRTIVQKMPMKLTVNSSNSIKQRKPKLL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 fh1114 LPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIGGDLPKGREAKENYGKTLKIE :::.. :: :. :.:::. :::::::::::::...:.: :..::.:: . : . :::::: gi|148 LPPAQMGSLSAKTVLKGDTLLLECFAEGLPTPHIQWSKPGSELPEGRATIEVHEKTLKIE 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 fh1114 NVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQSAVYSTGSNGILLCEAEGEP :.::::.:::::::.:.:: :.::::: ::::::: ::::::::::::.::::::::::: gi|148 NISYQDRGNYRCTANNLLGKASHDFHVTVEEPPRWKKKPQSAVYSTGSSGILLCEAEGEP 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 fh1114 QPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPREISFTNLQPNHTAVYQCEASNVHGTILANANIDV :::::::.:: :...::: :: .:::::::::: ::::.::::::::.:::::::::::: gi|148 QPTIKWRLNGLPIEKHPFPGDFMFPREISFTNLLPNHTGVYQCEASNIHGTILANANIDV 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 fh1114 VDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSWQKVEEVKPLEGRRYHIYENGT .:: :::.::. ::::::::::::::::.::::.:.: :. ..:..:::: ::: .:::: gi|148 IDVIPLIKTKNEENYATVVGYSAFLHCEYFASPKATVVWEVADETHPLEGDRYHTHENGT 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 fh1114 LQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKLRVSPKNPRIPKLHMLELHCES :.: ::::::::::::::.::.::...::::::::::::::::::::::: :.:::.::: gi|148 LEIYRTTEEDAGSYSCWVDNAMGKAVITANLDIRNATKLRVSPKNPRIPKSHVLELYCES 480 490 500 510 520 530 550 560 570 580 590 600 fh1114 KCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLTISNVTLEDQGIYCCSAHTALD .:::::::::::::::::::::.::::::::.:::: :::::.: ::::.: :::.:.:: gi|148 QCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEMNGTEDGRIVIDGAYLTISNITAEDQGVYSCSAQTSLD 540 550 560 570 580 590 610 620 630 640 650 660 fh1114 SAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQNRSVRLTWEAGADHNSNISEYIVEFEGNKEEPGR :... :::::: ::::: ::::::::::::::.:::: ::::.:::::::::::.::::. gi|148 STSEKTQVTVLGVPDPPGNLHLSERQNRSVRLSWEAGDDHNSKISEYIVEFEGNREEPGK 600 610 620 630 640 650 670 680 690 700 710 720 fh1114 WEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQPSDHHETPPAAPDRNPQNI :::::::::..: :.: :::.::::::: ::::::::. : :::::::::::::.::::: gi|148 WEELTRVQGEETDVVLSLAPYVRYQFRVTAVNEVGRSHASLPSDHHETPPAAPDKNPQNI 660 670 680 690 700 710 730 740 750 760 770 780 fh1114 RVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQGAPVEWEEETVTNHTLRVMTPAVY :::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::: ::::: :::::::::::.:: gi|148 RVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYKVSWKPQGAPEEWEEEIVTNHTLRVMTPTVY 720 730 740 750 760 770 790 800 810 820 830 840 fh1114 APYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPVIHGVDVINSTLVKVTWSTVPKDRV :::::::::::::::.:::: ::::::::::.:::::. :::.::::::::::..::. : gi|148 APYDVKVQAINQLGSSPDPQPVTLYSGEDYPSTAPVIQRVDVMNSTLVKVTWSSIPKETV 780 790 800 810 820 830 850 860 870 880 890 900 fh1114 HGRLKGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSLDAFSEFHLTVLAYNSK :: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::: gi|148 HGLLRGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSLDPFSEFHLTVLAYNSK 840 850 860 870 880 890 910 920 930 940 950 960 fh1114 GAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTATLSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIIND :::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 GAGPESEPYIFQTPEGVPEQPSFLKVIKVDKDTATLSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIIND 900 910 920 930 940 950 970 980 990 1000 1010 1020 fh1114 TYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYLRACTSQGCGKPITEESSTLGEGSKG :::.::::.::.::::: ::::::::.:::::::::::::.::::::.::..:::::::: gi|148 TYELGELNEINVTTPSKSSWHLSNLNSTTKYKFYLRACTSRGCGKPISEEGATLGEGSKG 960 970 980 990 1000 1010 1030 1040 1050 1060 1070 fh1114 IGKIS-GVNLTQKTHPVEVFEPGAEHIVRLMTKNWGDNDSIFQDVIETRGREYAGLYDDI : ::. :::.::: :::::. :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 IRKITEGVNVTQKIHPVEVLVPGAEHIVHLMTKNWGDNDSIFQDVIETRGREYAGLYDDI 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 fh1114 STQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEIQSVKDETFGEYS ::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::::::::.::.::::::::: gi|148 STQGWFIGLMCAIALLTLILLTICFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEVQSAKDETFGEYS 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 fh1114 DSDEKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDHGLFSEDGSFIGAYAGSKEKGSVESN ::::::::::::::::.:::::::::::::::::...:.:::::::::.:.::::::::: gi|148 DSDEKPLKGSLRSLNRNMQPTESADSLVEYGEGDQSIFNEDGSFIGAYTGAKEKGSVESN 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 fh1114 GSSTATFPLRA ::::::::::: gi|148 GSSTATFPLRA 1200 1210 >>gi|81908490|sp|P70232.1|CHL1_MOUSE Neural cell adhesio (1209 aa) initn: 7058 init1: 5773 opt: 6978 Z-score: 7826.2 bits: 1460.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 6978; 83.788% identity (94.045% similar) in 1209 aa overlap (3-1210:2-1209) 10 20 30 40 50 60 fh1114 RAMEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQSKVQVAFPFDEYFQIECE :: : :::::. :.:::::.: : ::: ::::::::.::: :::::::::::::::: gi|819 MMELPLCGRGLILSLIFLLLKLSAA-EIPLSVQQVPTIVKQSYVQVAFPFDEYFQIECE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 fh1114 AKGNPEPTFSWTKDGNPFYFTDHRIIPSNNSGTFRIPNEGHISHFQGKYRCFASNKLGIA ::::::: :::::: .:: ..: ::: .::::::.::::::::::::::::::::.:: : gi|819 AKGNPEPIFSWTKDDKPFDLSDPRIIAANNSGTFKIPNEGHISHFQGKYRCFASNRLGTA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 fh1114 MSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDE .:::::::::.:::::::::.:..::::: :::::::::::::::::::::::::::::: gi|819 VSEEIEFIVPGVPKFPKEKIEPIDVEEGDSIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 fh1114 RVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSSNSIKQRKPKLL ::::::.::::::::::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::: gi|819 RVYMSQRGDLYFANVEENDSRNDYCCFAAFPKLRTIVQKMPMKLTVNSSNSIKQRKPKLL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 fh1114 LPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIGGDLPKGREAKENYGKTLKIE :::.. :: :. :.:::. :::::::::::::...:.: :..::.:: . : . :::::: gi|819 LPPAQMGSLSAKTVLKGDTLLLECFAEGLPTPHIQWSKPGSELPEGRATIEVHEKTLKIE 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 fh1114 NVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQSAVYSTGSNGILLCEAEGEP :.::::.:::::::.:.:: :.::::: ::::::: ::::::::::::.::::::::::: gi|819 NISYQDRGNYRCTANNLLGKASHDFHVTVEEPPRWKKKPQSAVYSTGSSGILLCEAEGEP 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 fh1114 QPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPREISFTNLQPNHTAVYQCEASNVHGTILANANIDV :::::::.:: :...::: :: .:::::::::: ::::.::::::::.:::::::::::: gi|819 QPTIKWRLNGLPIEKHPFPGDFMFPREISFTNLLPNHTGVYQCEASNIHGTILANANIDV 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 fh1114 VDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSWQKVEEVKPLEGRRYHIYENGT .:: :::.::. ::::::::::::::::.::::.:.: :. ..:..:::: ::: .:::: gi|819 IDVIPLIKTKNEENYATVVGYSAFLHCEYFASPKATVVWEVADETHPLEGDRYHTHENGT 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 fh1114 LQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKLRVSPKNPRIPKLHMLELHCES :.: ::::::::::::::.::.::...::::::::::::::::::::::: :.:::.::: gi|819 LEIYRTTEEDAGSYSCWVDNAMGKAVITANLDIRNATKLRVSPKNPRIPKSHVLELYCES 480 490 500 510 520 530 550 560 570 580 590 600 fh1114 KCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLTISNVTLEDQGIYCCSAHTALD .:::::::::::::::::::::.::::::::.:::: :::::.: ::::.: :::.:.:: gi|819 QCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEMNGTEDGRIVIDGAYLTISNITAEDQGVYSCSAQTSLD 540 550 560 570 580 590 610 620 630 640 650 660 fh1114 SAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQNRSVRLTWEAGADHNSNISEYIVEFEGNKEEPGR :.. :::::: : ::::.. .. .:::::: ::: ::::. . :::::::.::::. gi|819 STSKKTQVTVLGVGDPPETFTCQKDKNRSVRLLREAGDDHNSKSASTIVEFEGNREEPGK 600 610 620 630 640 650 670 680 690 700 710 720 fh1114 WEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQPSDHHETPPAAPDRNPQNI :::::::::..: :.: :::.::::::: ::::::::. : :::::::::::::.::::: gi|819 WEELTRVQGEETDVVLSLAPYVRYQFRVTAVNEVGRSHASLPSDHHETPPAAPDKNPQNI 660 670 680 690 700 710 730 740 750 760 770 780 fh1114 RVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQGAPVEWEEETVTNHTLRVMTPAVY :::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::: ::::: :::::::::::.:: gi|819 RVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYKVSWKPQGAPEEWEEEIVTNHTLRVMTPTVY 720 730 740 750 760 770 790 800 810 820 830 840 fh1114 APYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPVIHGVDVINSTLVKVTWSTVPKDRV :::::::::::::::.:::: ::::::::::.:::::. :::.::::::::::..::. : gi|819 APYDVKVQAINQLGSSPDPQPVTLYSGEDYPSTAPVIQRVDVMNSTLVKVTWSSIPKETV 780 790 800 810 820 830 850 860 870 880 890 900 fh1114 HGRLKGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSLDAFSEFHLTVLAYNSK :: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::: gi|819 HGLLRGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSLDPFSEFHLTVLAYNSK 840 850 860 870 880 890 910 920 930 940 950 960 fh1114 GAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTATLSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIIND :::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|819 GAGPESEPYIFQTPEGVPEQPSFLKVIKVDKDTATLSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIIND 900 910 920 930 940 950 970 980 990 1000 1010 1020 fh1114 TYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYLRACTSQGCGKPITEESSTLGEGSKG :::.::::.::.::::: ::::::::.:::::::::::::.::::::.::..:::::::: gi|819 TYELGELNEINVTTPSKSSWHLSNLNSTTKYKFYLRACTSRGCGKPISEEGATLGEGSKG 960 970 980 990 1000 1010 1030 1040 1050 1060 1070 fh1114 IGKIS-GVNLTQKTHPVEVFEPGAEHIVRLMTKNWGDNDSIFQDVIETRGREYAGLYDDI : ::. :::.::: :::::. :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: gi|819 IRKITEGVNVTQKIHPVEVLVPGAEHIVHLMTKNWGDNDSIFQDVIETRGREYAGLYDDI 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 fh1114 STQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEIQSVKDETFGEYS ::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::::::::.::.::::::::: gi|819 STQGWFIGLMCAIALLTLILLTICFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEVQSAKDETFGEYS 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 fh1114 DSDEKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDHGLFSEDGSFIGAYAGSKEKGSVESN ::::::::::::::::.:::::::::::::::::...:.:::::::::.:.::::::::: gi|819 DSDEKPLKGSLRSLNRNMQPTESADSLVEYGEGDQSIFNEDGSFIGAYTGAKEKGSVESN 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 fh1114 GSSTATFPLRA ::::::::::: gi|819 GSSTATFPLRA 1200 >>gi|114585168|ref|XP_001136479.1| PREDICTED: cell adhes (1155 aa) initn: 7739 init1: 6835 opt: 6835 Z-score: 7665.9 bits: 1430.4 E(): 0 Smith-Waterman score: 7637; 94.702% identity (95.364% similar) in 1208 aa overlap (3-1210:1-1155) 10 20 30 40 50 60 fh1114 RAMEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQSKVQVAFPFDEYFQIECE :::::::::::: :.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 MEPLLLGRGLIVSLIFFLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQSKVQVAFPFDEYFQIECE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 fh1114 AKGNPEPTFSWTKDGNPFYFTDHRIIPSNNSGTFRIPNEGHISHFQGKYRCFASNKLGIA ::::::: :::::::::::::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 AKGNPEPIFSWTKDGNPFYFTDHRIMTSNNSGTFRIPNEGHISHFQGKYRCFASNKLGIA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 fh1114 MSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 MSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 fh1114 RVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSSNSIKQRKPKLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 RVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSSNSIKQRKPKLL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 fh1114 LPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIGGDLPKGREAKENYGKTLKIE ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::: gi|114 LPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIGGDLPKGRETKENYGKTLKIE 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 fh1114 NVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQSAVYSTGSNGILLCEAEGEP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 NVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQSAVYSTGSNGILLCEAEGEP 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 fh1114 QPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPREISFTNLQPNHTAVYQCEASNVHGTILANANIDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 QPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPREISFTNLQPNHTAVYQCEASNVHGTILANANIDV 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 fh1114 VDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSWQKVEEVKPLEGRRYHIYENGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 VDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSWQKVEEVKPLEGRRYHIYENGT 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 fh1114 LQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKLRVSPKNPRIPKLHMLELHCES :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 LQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKLRVSPKNPRIPKLHMLELHCES 480 490 500 510 520 530 550 560 570 580 590 600 fh1114 KCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLTISNVTLEDQGIYCCSAHTALD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 KCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLTISNVTLEDQGIYCCSAHTALD 540 550 560 570 580 590 610 620 630 640 650 660 fh1114 SAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQNRSVRLTWEAGADHNSNISEYIVEFEGNKEEPGR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 SAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQNRSVRLTWEAGADHNSNISEYIVEFEGNKEEPGR 600 610 620 630 640 650 670 680 690 700 710 720 fh1114 WEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQPSDHHETPPAAPDRNPQNI ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::: gi|114 WEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQPSDRHETPPAAPDRNPQNI 660 670 680 690 700 710 730 740 750 760 770 780 fh1114 RVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQGAPVEWEEETVTNHTLRVMTPAVY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 RVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQGAPVEWEEETVTNHTLRVMTPAVY 720 730 740 750 760 770 790 800 810 820 830 840 fh1114 APYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPVIHGVDVINSTLVKVTWSTVPKDRV ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: gi|114 APYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPVIHGVDVINSTLVKVTWSTIPKDRV 780 790 800 810 820 830 850 860 870 880 890 900 fh1114 HGRLKGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSLDAFSEFHLTVLAYNSK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 HGRLKGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSLDAFSEFHLTVLAYNSK 840 850 860 870 880 890 910 920 930 940 950 960 fh1114 GAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTATLSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIIND :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::: gi|114 GAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTATLSWGVPKKLNGNLTGYLLQYQIIND 900 910 920 930 940 950 970 980 990 1000 1010 1020 fh1114 TYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYLRACTSQGCGKPITEESSTLGEGSKG ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 TYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYLRACTSQGCGKPITEESSTLGEG--- 960 970 980 990 1000 1010 1030 1040 1050 1060 1070 1080 fh1114 IGKISGVNLTQKTHPVEVFEPGAEHIVRLMTKNWGDNDSIFQDVIETRGREYAGLYDDIS .::::::::: gi|114 --------------------------------------------------KYAGLYDDIS 1020 1090 1100 1110 1120 1130 1140 fh1114 TQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEIQSVKDETFGEYSD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 TQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEIQSVKDETFGEYSD 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1150 1160 1170 1180 1190 1200 fh1114 SDEKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDHGLFSEDGSFIGAYAGSKEKGSVESNG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 SDEKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDHGLFSEDGSFIGAYAGSKEKGSVESNG 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1210 fh1114 SSTATFPLRA :::::::::: gi|114 SSTATFPLRA 1150 >>gi|2190958|gb|AAB60937.1| neural cell adhesion molecul (1224 aa) initn: 6610 init1: 6610 opt: 6610 Z-score: 7413.0 bits: 1383.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 8125; 98.611% identity (98.693% similar) in 1224 aa overlap (3-1210:1-1224) 10 20 30 40 50 60 fh1114 RAMEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQSKVQVAFPFDEYFQIECE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|219 MEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQSKVQVAFPFDEYFQIECE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 fh1114 AKGNPEPTFSWTKDGNPFYFTDHRIIPSNNSGTFRIPNEGHISHFQGKYRCFASNKLGIA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|219 AKGNPEPTFSWTKDGNPFYFTDHRIIPSNNSGTFRIPNEGHISHFQGKYRCFASNKLGIA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 fh1114 MSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|219 MSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 fh1114 RVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNS------------ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|219 RVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSLKHANDSSSSTE 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 fh1114 ----SNSIKQRKPKLLLPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIGGDLP .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|219 IGSKANSIKQRKPKLLLPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIGGDLP 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 fh1114 KGREAKENYGKTLKIENVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQSAVY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|219 KGREAKENYGKTLKIENVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQSAVY 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 fh1114 STGSNGILLCEAEGEPQPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPREISFTNLQPNHTAVYQCE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|219 STGSNGILLCEAEGEPQPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPREISFTNLQPNHTAVYQCE 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 fh1114 ASNVHGTILANANIDVVDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSWQKVEE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|219 ASNVHGTILANANIDVVDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSWQKVEE 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 fh1114 VKPLEGRRYHIYENGTLQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKLRVSPK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|219 VKPLEGRRYHIYENGTLQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKLRVSPK 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 fh1114 NPRIPKLHMLELHCESKCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLTISNVT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|219 NPRIPKLHMLELHCESKCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLTISNVT 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 fh1114 LEDQGIYCCSAHTALDSAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQNRSVRLTWEAGADHNSNI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|219 LEDQGIYCCSAHTALDSAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQNRSVRLTWEAGADHNSNI 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 fh1114 SEYIVEFEGNKEEPGRWEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQPSD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|219 SEYIVEFEGNKEEPGRWEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQPSD 660 670 680 690 700 710 710 720 730 740 750 760 fh1114 HHETPPAAPDRNPQNIRVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQGAPVEWEE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|219 HHETPPAAPDRNPQNIRVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQGAPVEWEE 720 730 740 750 760 770 770 780 790 800 810 820 fh1114 ETVTNHTLRVMTPAVYAPYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPVIHGVDVIN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|219 ETVTNHTLRVMTPAVYAPYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPVIHGVDVIN 780 790 800 810 820 830 830 840 850 860 870 880 fh1114 STLVKVTWSTVPKDRVHGRLKGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|219 STLVKVTWSTVPKDRVHGRLKGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSL 840 850 860 870 880 890 890 900 910 920 930 940 fh1114 DAFSEFHLTVLAYNSKGAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTATLSWGLPKKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|219 DAFSEFHLTVLAYNSKGAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTATLSWGLPKKL 900 910 920 930 940 950 950 960 970 980 990 1000 fh1114 NGNLTGYLLQYQIINDTYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYLRACTSQGCG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|219 NGNLTGYLLQYQIINDTYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYLRACTSQGCG 960 970 980 990 1000 1010 1010 1020 1030 1040 1050 1060 fh1114 KPITEESSTLGEGSKGIGKISGVNLTQKTHPVEVFEPGAEHIVRLMTKNWGDNDSIFQDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|219 KPITEESSTLGEGSKGIGKISGVNLTQKTHPVEVFEPGAEHIVRLMTKNWGDNDSIFQDV 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1070 1080 1090 1100 1110 1120 fh1114 IETRGREYAGLYDDISTQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|219 IETRGREYAGLYDDISTQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPD 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1130 1140 1150 1160 1170 1180 fh1114 PEIQSVKDETFGEYSDSDEKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDHGLFSEDGSFI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|219 PEIQSVKDETFGEYSDSDEKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDHGLFSEDGSFI 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1190 1200 1210 fh1114 GAYAGSKEKGSVESNGSSTATFPLRA :::::::::::::::::::::::::: gi|219 GAYAGSKEKGSVESNGSSTATFPLRA 1200 1210 1220 1210 residues in 1 query sequences 2355815254 residues in 6825066 library sequences Tcomplib [34.26] (8 proc) start: Sat Aug 9 14:23:05 2008 done: Sat Aug 9 14:25:18 2008 Total Scan time: 1139.460 Total Display time: 0.920 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]