# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Ofh17222s1.fasta.nr -Q fh17222s1.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 fh17222s1, 4161 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2779448989 residues in 8089198 sequences statistics sampled from 60000 to 8084943 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7388+/-0.000185; mu= 15.1956+/- 0.010 mean_var=86.7121+/-17.342, 0's: 36 Z-trim: 54 B-trim: 3482 in 1/65 Lambda= 0.137732 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 49, opt: 37, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(8089198) gi|126215690|sp|Q63HN8.2|RN213_HUMAN RecName: Full (3280) 21910 4365.9 0 gi|73964722|ref|XP_540474.2| PREDICTED: similar to (3388) 16571 3305.0 0 gi|52545944|emb|CAH56189.1| hypothetical protein [ (2114) 14074 2808.7 0 gi|194676304|ref|XP_590465.4| PREDICTED: similar t (5169) 11469 2291.4 0 gi|148702755|gb|EDL34702.1| mCG142721, isoform CRA (5229) 11225 2242.9 0 gi|123264882|emb|CAM18889.1| ring finger protein 2 (4910) 11057 2209.5 0 gi|34365262|emb|CAE45967.1| hypothetical protein [ (1642) 10996 2197.0 0 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.:::::::.::... gi|739 QAWLQMVKNLSMPLELLGSKGYLQSCGRMARDAIREVRIHWNRIFPVALFVEHVVLGVRN 2070 2080 2090 2100 2110 2120 2900 2910 2920 2930 2940 2950 fh1722 RVPELQGLVTEHVFLLDKCLRENSDVKTHGPFEAVMRTLCECKETASKTLSRFGIQPCSI ..::::.:::.:.:::.: :...::.::. :: .::.:::.::: :::::::: :::: . gi|739 KIPELQALVTDHLFLLNKYLQDDSDIKTYRPFVTVMHTLCKCKEQASKTLSRFEIQPCPV 2130 2140 2150 2160 2170 2180 2960 2970 2980 2990 3000 3010 fh1722 CLGDAKDPVCLPCDHVHCLRCLRAWFASEQMICPYCLTALPDEFSPAVSQAHREAIEKHA :::::..:: ::: :: ::::. . .. :: :::::: :: .:: .:.: ::.::.::: gi|739 CLGDAQEPVSLPCGHVFCLRCINTCITLGQMACPYCLTDLPKDFSLTVNQEHRDAIRKHA 2190 2200 2210 2220 2230 2240 3020 3030 3040 3050 3060 3070 fh1722 RFRQMCNSFFVDLVSTICFKDNAPPEKEVIESLLSLLFVQKGRLRDAAQRHCEHTKSLSP .::::::::.:::::.:::::.::::.::. ::.:::::: :::. :::::::::::: gi|739 CLRQMCNSFFLDLVSTVCFKDNTPPEKDVIDVLLNLLFVQKEFLRDTPQRHCEHTKSLSP 2250 2260 2270 2280 2290 2300 3080 3090 3100 3110 3120 3130 fh1722 FNDVVDKTPVIRSVILKLLLKYSFHDVKDYIQEYLTLLKKKAFITEDKTELYMLFINCLE :.:.::::::::::.:::::::::..:::::: ::.::..::..::::::::.:: :::: gi|739 FDDIVDKTPVIRSVVLKLLLKYSFQEVKDYIQAYLSLLQQKALVTEDKTELYILFSNCLE 2310 2320 2330 2340 2350 2360 3140 3150 3160 3170 3180 3190 fh1722 DSILEKTSAYSRNDELNHLEEEGRFLKAYSPASRGREPANEASVEYLQEVARIRLCLDRA ::. ::::: : ..:: .:.::: :::.:: . :::.:::::::::..::::::..: gi|739 DSLYEKTSALSTSEELRYLREEGAFLKTYSMWC-SPEPASEASVEYLQEMTRIRLCLNKA 2370 2380 2390 2400 2410 2420 3200 3210 3220 3230 3240 3250 fh1722 ADFLSEPEGGPEMAKEKQCYLQQVKQFCIRVENDWHRVYLVRKLSSQRGMEFVQGLSKPG .::::: . . : :.:::::::::..:: ...:::.:::::::::::::.:.:: . : gi|739 SDFLSELQDSSETAREKQCYLQQVERFCRQAKNDWYRVYLVRKLSSQRGIEYVQQFCAQG 2430 2440 2450 2460 2470 2480 3260 3270 3280 3290 3300 3310 fh1722 RPHQWVFPKDVVKQQGLRQDHPGQMDRYLVYGDEYKALRDAVAKAVLECKPLGIKTALKA .: .:.::.... ::.. .:::::::.::.::::::.:.::.:. .:: ..::. gi|739 HPARWIFPEEAL----LRENMLSQMDRYLVHGDKYKALRDTVGKAILQNEPLTTVAVLKG 2490 2500 2510 2520 2530 2540 3320 3330 3340 3350 3360 3370 fh1722 CKTPQSQQSAYFLLTLFREVAILYRSHNASLHPTPEQCEAVSKFIGECKILSPPDISRFA .. . . .:..::.::::::.::.: :.:::: ::::::.. :: : ::.: : . .:: gi|739 GRNHDPELAAHLLLVLFREVAVLYQSCNTSLHPKPEQCEALNAFIEEGKIFSSPHMRHFA 2550 2560 2570 2580 2590 2600 3380 3390 3400 3410 3420 3430 fh1722 TSLVDNSVPLLRAGPSDSNLDGTVTEMAIHAAAVLLCGQNELLEPLKNLAFSPATMAHAF .:::.:..::::.:: ::.:.:::.:.:.:.::::::::...:::::.:::::: :.... gi|739 ASLVNNTLPLLRTGPRDSSLQGTVAELAVHTAAVLLCGQGDILEPLKSLAFSPADMVNSY 2610 2620 2630 2640 2650 2660 3440 3450 3460 3470 3480 3490 fh1722 LPTMPEDLLAQARRWKGLERVHWYTCPNGHPCSVGECGRPMEQSICIDCHAPIGGIDHKP :::::::::.::: ::::: . :: :::::::::::::.:::.: :::: . .::..:.: gi|739 LPTMPEDLLVQARNWKGLETLSWYMCPNGHPCSVGECGKPMEKSHCIDCGVQVGGVNHSP 2670 2680 2690 2700 2710 2720 3500 3510 3520 3530 3540 3550 fh1722 RDGFHLVKDKADRTQTGHVLGNPQRRD-VVTCDRGLPPVVFLLIRLLTHLALLLGASQSS . :::.. ::.:::: ::::: : :: :.. :: : : :::::::::::::::::.: gi|739 ETGFHVITDKTDRTQKGHVLGAPPSRDKVLVSDRELAPDVFLLIRLLTHLALLLGATQRP 2730 2740 2750 2760 2770 2780 3560 3570 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::::::.:: :...: .::: .: ::::::.:::::::::::::::::.. gi|123 DMNTVLQPWQKSIVQELQQWAHEFADVKADQFIARHKYSPADVFIGYHSDACASVVLQAV 2900 2910 2920 2930 2940 2950 2190 2200 2210 2220 2230 2240 fh1722 ERQGPRALTEELHQKVSEEAKSILLNCATPDAVVRLSAYSLGGFAAEWLSQEYFHRQRHN :::: : :::::..::::::.::::.:::::::::::. :::.:.:. :::::.. :.:: gi|123 ERQGCRDLTEELYRKVSEEARSILLDCATPDAVVRLSGSSLGSFTAKQLSQEYYYAQQHN 2960 2970 2980 2990 3000 3010 2250 2260 2270 2280 2290 2300 fh1722 SFADFLQAHLHTADLERHAIFTEITTFSRLLTSHDCEILESEVTGRAPKPTLLWLQQFDT ::.:::::::. . : .:.::::::::::::..::..: ::. : : ::..: :::.:: gi|123 SFVDFLQAHLRMTHHECRAVFTEITTFSRLLTGNDCDVLASELRGLASKPVVLSLQQYDT 3020 3030 3040 3050 3060 3070 2310 2320 2330 2340 2350 2360 fh1722 EYSFLKEVRNCLTNTAKCKILIFQTDFEDGIRSAQLIASAKYSVINEINKIRENEDRIFV ::::::.::. ::: .: :.:..:.::.:: :::::.:::::..:::::: . ..: .:: gi|123 EYSFLKDVRSWLTNPGKRKVLVIQADFDDGTRSAQLVASAKYTAINEINKTQGTKDFVFV 3080 3090 3100 3110 3120 3130 2370 2380 2390 2400 2410 2420 fh1722 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