# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Ofh21869.fasta.nr -Q fh21869.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 fh21869, 343 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2355815254 residues in 6825066 sequences statistics sampled from 60000 to 6824260 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7365+/-0.00019; mu= 6.9477+/- 0.011 mean_var=79.5497+/-15.696, 0's: 37 Z-trim: 38 B-trim: 1575 in 2/65 Lambda= 0.143799 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(6825066) gi|2708628|gb|AAB92554.1| FGFR signalling adaptor ( 508) 2266 479.5 5.4e-133 gi|71152057|sp|Q8WU20|FRS2_HUMAN Fibroblast growth ( 512) 2266 479.5 5.5e-133 gi|114645792|ref|XP_522464.2| PREDICTED: fibroblas ( 508) 2256 477.4 2.3e-132 gi|73968669|ref|XP_850500.1| PREDICTED: similar to ( 508) 2252 476.6 4.1e-132 gi|61808641|ref|XP_581582.1| PREDICTED: similar to ( 508) 2223 470.6 2.6e-130 gi|149715277|ref|XP_001494369.1| PREDICTED: fibrob ( 508) 2214 468.7 9.6e-130 gi|71152058|sp|Q8C180|FRS2_MOUSE Fibroblast growth ( 508) 2183 462.3 8.3e-128 gi|149066900|gb|EDM16633.1| fibroblast growth fact ( 508) 2177 461.0 2e-127 gi|126339362|ref|XP_001362732.1| PREDICTED: simila ( 508) 2122 449.6 5.4e-124 gi|118082317|ref|XP_416087.2| PREDICTED: similar t ( 508) 2080 440.9 2.2e-121 gi|28422659|gb|AAH46943.1| Frs2-prov protein [Xeno ( 509) 1779 378.5 1.4e-102 gi|14588670|dbj|BAB61837.1| FRS2 [Xenopus laevis] ( 509) 1778 378.2 1.6e-102 gi|18033970|gb|AAL57304.1|AF390895_1 suc1-associat ( 509) 1758 374.1 2.9e-101 gi|49903281|gb|AAH76548.1| Zgc:91973 [Danio rerio] ( 490) 802 175.8 1.4e-41 gi|189517876|ref|XP_001923962.1| PREDICTED: fibrob ( 485) 681 150.7 5.1e-34 gi|126309991|ref|XP_001379891.1| PREDICTED: simila ( 555) 669 148.2 3.2e-33 gi|163915793|gb|AAI57661.1| Unknown (protein for M ( 517) 632 140.5 6.1e-31 gi|47507434|gb|AAH71027.1| MGC82242 protein [Xenop ( 517) 609 135.7 1.7e-29 gi|184185438|gb|ACC68845.1| fibroblast growth fact ( 494) 574 128.5 2.5e-27 gi|57094926|ref|XP_538915.1| PREDICTED: similar to ( 496) 570 127.6 4.4e-27 gi|149732181|ref|XP_001501207.1| PREDICTED: simila ( 495) 569 127.4 5.1e-27 gi|148877404|gb|AAI46159.1| FRS3 protein [Bos taur ( 495) 560 125.6 1.9e-26 gi|71152061|sp|Q52RG8|FRS3_RAT Fibroblast growth f ( 492) 555 124.5 3.8e-26 gi|149069455|gb|EDM18896.1| fibroblast growth fact ( 493) 547 122.9 1.2e-25 gi|157939797|gb|ABW05536.1| fibroblast growth fact ( 492) 543 122.0 2.1e-25 gi|71152059|sp|O43559|FRS3_HUMAN Fibroblast growth ( 492) 541 121.6 2.8e-25 gi|109071130|ref|XP_001084538.1| PREDICTED: simila ( 492) 539 121.2 3.8e-25 gi|114607419|ref|XP_001174236.1| PREDICTED: fibrob ( 492) 539 121.2 3.8e-25 gi|169731524|gb|ACA64895.1| fibroblast growth fact ( 492) 538 121.0 4.4e-25 gi|167206802|gb|ABZ11033.1| fibroblast growth fact ( 492) 536 120.6 5.8e-25 gi|71152060|sp|Q91WJ0|FRS3_MOUSE Fibroblast growth ( 492) 526 118.5 2.4e-24 gi|148691633|gb|EDL23580.1| fibroblast growth fact ( 500) 526 118.5 2.5e-24 gi|118102559|ref|XP_418044.2| PREDICTED: similar t ( 464) 428 98.2 3.1e-18 gi|47220597|emb|CAG05623.1| unnamed protein produc ( 74) 355 82.5 2.4e-14 gi|149421861|ref|XP_001518131.1| PREDICTED: simila ( 552) 337 79.3 1.7e-12 gi|89272114|emb|CAJ82175.1| fibroblast growth fact ( 435) 318 75.3 2.2e-11 gi|37748691|gb|AAH60017.1| MGC68639 protein [Xenop ( 439) 316 74.9 2.9e-11 gi|47229724|emb|CAG06920.1| unnamed protein produc ( 620) 259 63.2 1.4e-07 gi|47204064|emb|CAF87724.1| unnamed protein produc ( 449) 254 62.1 2.2e-07 >>gi|2708628|gb|AAB92554.1| FGFR signalling adaptor SNT- (508 aa) initn: 2266 init1: 2266 opt: 2266 Z-score: 2542.8 bits: 479.5 E(): 5.4e-133 Smith-Waterman score: 2266; 100.000% identity (100.000% similar) in 343 aa overlap (1-343:166-508) 10 20 30 fh2186 RHPSVGSARLPSVGEESTHPLLVAEEQVHT :::::::::::::::::::::::::::::: gi|270 PTTPGFAAQNLPNGYPRYPSFGDASSHPSSRHPSVGSARLPSVGEESTHPLLVAEEQVHT 140 150 160 170 180 190 40 50 60 70 80 90 fh2186 YVNTTGVQEERKNRTSVHVPLEARVSNAESSTPKEEPSSIEDRDPQILLEPEGVKFVLGP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|270 YVNTTGVQEERKNRTSVHVPLEARVSNAESSTPKEEPSSIEDRDPQILLEPEGVKFVLGP 200 210 220 230 240 250 100 110 120 130 140 150 fh2186 TPVQKQLMEKEKLEQLGRDQVSGSGANNTEWDTGYDSDERRDAPSVNKLVYENINGLSIP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|270 TPVQKQLMEKEKLEQLGRDQVSGSGANNTEWDTGYDSDERRDAPSVNKLVYENINGLSIP 260 270 280 290 300 310 160 170 180 190 200 210 fh2186 SASGVRRGRLTSTSTSDTQNINNSAQRRTALLNYENLPSLPPVWEARKLSRDEDDNLGPK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|270 SASGVRRGRLTSTSTSDTQNINNSAQRRTALLNYENLPSLPPVWEARKLSRDEDDNLGPK 320 330 340 350 360 370 220 230 240 250 260 270 fh2186 TPSLNGYHNNLDPMHNYVNTENVTVPASAHKIEYSRRRDCTPTVFNFDIRRPSLEHRQLN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|270 TPSLNGYHNNLDPMHNYVNTENVTVPASAHKIEYSRRRDCTPTVFNFDIRRPSLEHRQLN 380 390 400 410 420 430 280 290 300 310 320 330 fh2186 YIQVDLEGGSDSDNPQTPKTPTTPLPQTPTRRTELYAVIDIERTAAMSNLQKALPRDDGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|270 YIQVDLEGGSDSDNPQTPKTPTTPLPQTPTRRTELYAVIDIERTAAMSNLQKALPRDDGT 440 450 460 470 480 490 340 fh2186 SRKTRHNSTDLPM ::::::::::::: gi|270 SRKTRHNSTDLPM 500 >>gi|71152057|sp|Q8WU20|FRS2_HUMAN Fibroblast growth fac (512 aa) initn: 2266 init1: 2266 opt: 2266 Z-score: 2542.7 bits: 479.5 E(): 5.5e-133 Smith-Waterman score: 2266; 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99.417% identity (99.708% similar) in 343 aa overlap (1-343:166-508) 10 20 30 fh2186 RHPSVGSARLPSVGEESTHPLLVAEEQVHT :::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 PTTPGFAAQNLPNGYPRYPSFGDASSHPSSRHPSVGSARLPSVGEESTHPLLVAEEQVHT 140 150 160 170 180 190 40 50 60 70 80 90 fh2186 YVNTTGVQEERKNRTSVHVPLEARVSNAESSTPKEEPSSIEDRDPQILLEPEGVKFVLGP ::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::: :::::::::::::::::::: gi|114 YVNTTGVQEERKNRTSVHVPLEARVSNAESNTPKEEPSSTEDRDPQILLEPEGVKFVLGP 200 210 220 230 240 250 100 110 120 130 140 150 fh2186 TPVQKQLMEKEKLEQLGRDQVSGSGANNTEWDTGYDSDERRDAPSVNKLVYENINGLSIP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 TPVQKQLMEKEKLEQLGRDQVSGSGANNTEWDTGYDSDERRDAPSVNKLVYENINGLSIP 260 270 280 290 300 310 160 170 180 190 200 210 fh2186 SASGVRRGRLTSTSTSDTQNINNSAQRRTALLNYENLPSLPPVWEARKLSRDEDDNLGPK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 SASGVRRGRLTSTSTSDTQNINNSAQRRTALLNYENLPSLPPVWEARKLSRDEDDNLGPK 320 330 340 350 360 370 220 230 240 250 260 270 fh2186 TPSLNGYHNNLDPMHNYVNTENVTVPASAHKIEYSRRRDCTPTVFNFDIRRPSLEHRQLN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 TPSLNGYHNNLDPMHNYVNTENVTVPASAHKIEYSRRRDCTPTVFNFDIRRPSLEHRQLN 380 390 400 410 420 430 280 290 300 310 320 330 fh2186 YIQVDLEGGSDSDNPQTPKTPTTPLPQTPTRRTELYAVIDIERTAAMSNLQKALPRDDGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 YIQVDLEGGSDSDNPQTPKTPTTPLPQTPTRRTELYAVIDIERTAAMSNLQKALPRDDGT 440 450 460 470 480 490 340 fh2186 SRKTRHNSTDLPM ::::::::::::: gi|114 SRKTRHNSTDLPM 500 >>gi|73968669|ref|XP_850500.1| PREDICTED: similar to fib (508 aa) initn: 2252 init1: 2252 opt: 2252 Z-score: 2527.1 bits: 476.6 E(): 4.1e-132 Smith-Waterman score: 2252; 98.834% identity (100.000% similar) in 343 aa overlap (1-343:166-508) 10 20 30 fh2186 RHPSVGSARLPSVGEESTHPLLVAEEQVHT :::::::::::::::::::::::::::::: gi|739 PTTPGFAAQNLPNGYPRYPSFGDASSHPSSRHPSVGSARLPSVGEESTHPLLVAEEQVHT 140 150 160 170 180 190 40 50 60 70 80 90 fh2186 YVNTTGVQEERKNRTSVHVPLEARVSNAESSTPKEEPSSIEDRDPQILLEPEGVKFVLGP ::::::::::::::::::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::: gi|739 YVNTTGVQEERKNRTSVHVPLEARISNAESNTPKEEPSSIEDRDPQILLEPEGVKFVLGP 200 210 220 230 240 250 100 110 120 130 140 150 fh2186 TPVQKQLMEKEKLEQLGRDQVSGSGANNTEWDTGYDSDERRDAPSVNKLVYENINGLSIP :::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::: gi|739 TPVQKQLMEKEKLEQLGRDQVSGSGANSTEWDTGYDSDERRDAPSVNKLVYENINGLSIP 260 270 280 290 300 310 160 170 180 190 200 210 fh2186 SASGVRRGRLTSTSTSDTQNINNSAQRRTALLNYENLPSLPPVWEARKLSRDEDDNLGPK ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|739 SASGVRRGRLTSSSTSDTQNINNSAQRRTALLNYENLPSLPPVWEARKLSRDEDDNLGPK 320 330 340 350 360 370 220 230 240 250 260 270 fh2186 TPSLNGYHNNLDPMHNYVNTENVTVPASAHKIEYSRRRDCTPTVFNFDIRRPSLEHRQLN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|739 TPSLNGYHNNLDPMHNYVNTENVTVPASAHKIEYSRRRDCTPTVFNFDIRRPSLEHRQLN 380 390 400 410 420 430 280 290 300 310 320 330 fh2186 YIQVDLEGGSDSDNPQTPKTPTTPLPQTPTRRTELYAVIDIERTAAMSNLQKALPRDDGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|739 YIQVDLEGGSDSDNPQTPKTPTTPLPQTPTRRTELYAVIDIERTAAMSNLQKALPRDDGT 440 450 460 470 480 490 340 fh2186 SRKTRHNSTDLPM ::::::::::::: gi|739 SRKTRHNSTDLPM 500 >>gi|61808641|ref|XP_581582.1| PREDICTED: similar to FRS (508 aa) initn: 2223 init1: 2223 opt: 2223 Z-score: 2494.6 bits: 470.6 E(): 2.6e-130 Smith-Waterman score: 2223; 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96.501% identity (99.708% similar) in 343 aa overlap (1-343:166-508) 10 20 30 fh2186 RHPSVGSARLPSVGEESTHPLLVAEEQVHT :::::::::::::::::::::::::::::: gi|149 PTTPGFAAQSLPNGCPRYPSFGDASSRPSSRHPSVGSARLPSVGEESTHPLLVAEEQVHT 140 150 160 170 180 190 40 50 60 70 80 90 fh2186 YVNTTGVQEERKNRTSVHVPLEARVSNAESSTPKEEPSSIEDRDPQILLEPEGVKFVLGP ::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::.::::::::::::::::::::: gi|149 YVNTTGVQEERKNRTSVHVPLEARISNAESNTPKEEPSNIEDRDPQILLEPEGVKFVLGP 200 210 220 230 240 250 100 110 120 130 140 150 fh2186 TPVQKQLMEKEKLEQLGRDQVSGSGANNTEWDTGYDSDERRDAPSVNKLVYENINGLSIP ::::::::::::::::::: :::.:::.:.::::::::::::::.:.::::::::::::: gi|149 TPVQKQLMEKEKLEQLGRDPVSGGGANSTDWDTGYDSDERRDAPAVSKLVYENINGLSIP 260 270 280 290 300 310 160 170 180 190 200 210 fh2186 SASGVRRGRLTSTSTSDTQNINNSAQRRTALLNYENLPSLPPVWEARKLSRDEDDNLGPK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|149 SASGVRRGRLTSTSTSDTQNINNSAQRRTALLNYENLPSLPPVWEARKLSRDEDDNLGPK 320 330 340 350 360 370 220 230 240 250 260 270 fh2186 TPSLNGYHNNLDPMHNYVNTENVTVPASAHKIEYSRRRDCTPTVFNFDIRRPSLEHRQLN ::::::::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::: gi|149 TPSLNGYHSNLDPMHNYVNTENVTVPASAHKVEYSRRRDCTPTVFNFDIRRPSLEHRQLN 380 390 400 410 420 430 280 290 300 310 320 330 fh2186 YIQVDLEGGSDSDNPQTPKTPTTPLPQTPTRRTELYAVIDIERTAAMSNLQKALPRDDGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::: gi|149 YIQVDLEGGSDSDNPQTPKTPTTPLPQTPTRRTELYAVIDIERTAAMSNLQRALPRDDGT 440 450 460 470 480 490 340 fh2186 SRKTRHNSTDLPM ::::::::::::: gi|149 SRKTRHNSTDLPM 500 >>gi|71152058|sp|Q8C180|FRS2_MOUSE Fibroblast growth fac (508 aa) initn: 2183 init1: 2183 opt: 2183 Z-score: 2449.7 bits: 462.3 E(): 8.3e-128 Smith-Waterman score: 2183; 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95.044% identity (98.542% similar) in 343 aa overlap (1-343:166-508) 10 20 30 fh2186 RHPSVGSARLPSVGEESTHPLLVAEEQVHT :::::::::::::::::::::::::::::: gi|149 PTTPGLGAQSLPNGYPRYPSFGDASSHPSSRHPSVGSARLPSVGEESTHPLLVAEEQVHT 140 150 160 170 180 190 40 50 60 70 80 90 fh2186 YVNTTGVQEERKNRTSVHVPLEARVSNAESSTPKEEPSSIEDRDPQILLEPEGVKFVLGP ::::::::::::::.:::.: :::::::::.:::::::. :::::..::.:::::::::: gi|149 YVNTTGVQEERKNRASVHIPPEARVSNAESNTPKEEPSNTEDRDPHVLLKPEGVKFVLGP 200 210 220 230 240 250 100 110 120 130 140 150 fh2186 TPVQKQLMEKEKLEQLGRDQVSGSGANNTEWDTGYDSDERRDAPSVNKLVYENINGLSIP :::::::::::::::::.::::::::..::::::::::::::.: ::::::::::::::: gi|149 TPVQKQLMEKEKLEQLGKDQVSGSGASSTEWDTGYDSDERRDVPPVNKLVYENINGLSIP 260 270 280 290 300 310 160 170 180 190 200 210 fh2186 SASGVRRGRLTSTSTSDTQNINNSAQRRTALLNYENLPSLPPVWEARKLSRDEDDNLGPK :::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::: gi|149 SASGVRRGRLTSTSTSDTQNINNSAQRRPALLNYENLPSLPPVWEARKLSRDEDDNLGPK 320 330 340 350 360 370 220 230 240 250 260 270 fh2186 TPSLNGYHNNLDPMHNYVNTENVTVPASAHKIEYSRRRDCTPTVFNFDIRRPSLEHRQLN ::::::::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::::::: gi|149 TPSLNGYHNNLDPMHNYVNTENVTVPASAHKIDCSRRRDCTPTVFNFDIRRPSLEHRQLN 380 390 400 410 420 430 280 290 300 310 320 330 fh2186 YIQVDLEGGSDSDNPQTPKTPTTPLPQTPTRRTELYAVIDIERTAAMSNLQKALPRDDGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|149 YIQVDLEGGSDSDNPQTPKTPTTPLPQTPTRRTELYAVIDIERTAAMSNLQKALPRDDGT 440 450 460 470 480 490 340 fh2186 SRKTRHNSTDLPM ::::::::::::: gi|149 SRKTRHNSTDLPM 500 >>gi|126339362|ref|XP_001362732.1| PREDICTED: similar to (508 aa) initn: 2122 init1: 2122 opt: 2122 Z-score: 2381.3 bits: 449.6 E(): 5.4e-124 Smith-Waterman score: 2122; 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90.379% identity (97.085% similar) in 343 aa overlap (1-343:166-508) 10 20 30 fh2186 RHPSVGSARLPSVGEESTHPLLVAEEQVHT :::::::::::::::::::::::::::::: gi|118 PTTPGFNAQSLPNGYPRYPSFGDASSHPSSRHPSVGSARLPSVGEESTHPLLVAEEQVHT 140 150 160 170 180 190 40 50 60 70 80 90 fh2186 YVNTTGVQEERKNRTSVHVPLEARVSNAESSTPKEEPSSIEDRDPQILLEPEGVKFVLGP ::::::::::::::.:::.:::...::.:.. ::. .::: ..::::::::::::: gi|118 YVNTTGVQEERKNRSSVHAPLESKLSNTETTKVKEDQMCTDDRDAHVLLEPEGVKFVLGP 200 210 220 230 240 250 100 110 120 130 140 150 fh2186 TPVQKQLMEKEKLEQLGRDQVSGSGANNTEWDTGYDSDERRDAPSVNKLVYENINGLSIP ::::.::::.::::::::::::::..:::::::::::::::..:: ::::::::: :::: gi|118 TPVQRQLMEREKLEQLGRDQVSGSSTNNTEWDTGYDSDERRETPSGNKLVYENINRLSIP 260 270 280 290 300 310 160 170 180 190 200 210 fh2186 SASGVRRGRLTSTSTSDTQNINNSAQRRTALLNYENLPSLPPVWEARKLSRDEDDNLGPK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::: gi|118 SASGVRRGRLTSTSTSDTQNINNSAQRRTALLNYENLPSLPPVWESRKLSRDEDDSLGPK 320 330 340 350 360 370 220 230 240 250 260 270 fh2186 TPSLNGYHNNLDPMHNYVNTENVTVPASAHKIEYSRRRDCTPTVFNFDIRRPSLEHRQLN ::::::::::::::::::::::::::.::::::. ::::::::::::::::::::::::: gi|118 TPSLNGYHNNLDPMHNYVNTENVTVPSSAHKIEFPRRRDCTPTVFNFDIRRPSLEHRQLN 380 390 400 410 420 430 280 290 300 310 320 330 fh2186 YIQVDLEGGSDSDNPQTPKTPTTPLPQTPTRRTELYAVIDIERTAAMSNLQKALPRDDGT ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::: gi|118 YIQVDLEGGSDSDNPQTPKTPTTPLPQTPTRRTELYAVIDIERTAAMSSLQKALPRDDGT 440 450 460 470 480 490 340 fh2186 SRKTRHNSTDLPM ::::::::::::: gi|118 SRKTRHNSTDLPM 500 343 residues in 1 query sequences 2355815254 residues in 6825066 library sequences Tcomplib [34.26] (8 proc) start: Sun Aug 10 01:02:06 2008 done: Sun Aug 10 01:04:42 2008 Total Scan time: 775.750 Total Display time: 0.090 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]