# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Ofj03879s2.fasta.nr -Q fj03879s2.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 fj03879s2, 2374 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2779448989 residues in 8089198 sequences statistics sampled from 60000 to 8058188 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8494+/-0.000215; mu= 9.6954+/- 0.012 mean_var=184.3306+/-34.889, 0's: 42 Z-trim: 119 B-trim: 109 in 1/67 Lambda= 0.094466 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 43, opt: 31, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(8089198) gi|90110075|sp|Q9H2D6.3|TARA_HUMAN RecName: Full=T (2365) 16327 2239.8 0 gi|81176579|gb|ABB59559.1| TRIOBP isoform 3 [Homo (2193) 15103 2073.0 0 gi|114686389|ref|XP_515120.2| PREDICTED: TRIO and (2187) 12228 1681.1 0 gi|82469902|gb|ABB77204.1| trio-associated repeat (2266) 9340 1287.6 0 gi|119580589|gb|EAW60185.1| TRIO and F-actin bindi (1215) 8319 1148.1 0 gi|81176581|gb|ABB59560.1| TRIOBP isoform 4 [Homo (1144) 7973 1100.9 0 gi|194226812|ref|XP_001916851.1| PREDICTED: TRIO a (2250) 5976 829.1 0 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