# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Ofj10308y2.fasta.nr -Q fj10308y2.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 fj10308y2, 1972 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2355815254 residues in 6825066 sequences statistics sampled from 60000 to 6822476 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5559+/-0.000187; mu= 14.4951+/- 0.010 mean_var=86.2929+/-16.839, 0's: 31 Z-trim: 47 B-trim: 81 in 1/65 Lambda= 0.138066 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(6825066) gi|166788540|dbj|BAG06718.1| DNAH5 variant protein (1972) 13011 2603.1 0 gi|119628455|gb|EAX08050.1| dynein, axonemal, heav (4624) 13011 2603.4 0 gi|116241343|sp|Q8TE73.3|DYH5_HUMAN Dynein heavy c (4624) 13005 2602.2 0 gi|149732989|ref|XP_001500013.1| PREDICTED: simila (4624) 12516 2504.8 0 gi|74003035|ref|XP_848572.1| PREDICTED: similar to (4642) 12344 2470.5 0 gi|148676944|gb|EDL08891.1| dynein, axonemal, heav (4638) 12278 2457.3 0 gi|51316049|sp|Q8VHE6.1|DYH5_MOUSE Dynein heavy ch (4621) 12248 2451.4 0 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:::::::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::: gi|740 MLEKLPPGYGPFEVKERLQKMGPFQPMNIFLRQEIDRMQKLLSLVRSTLTELKLAIDGTI 4390 4400 4410 4420 4430 4440 1780 1790 1800 1810 1820 1830 fj1030 IMSENLRDALDCMFDARIPAWWKKASWVSSTLGFWFTELIERNSQFTSWVFNGRPHCFWM ::.:.: :::.::::::::: ::::::::::::::::::.::: :::::::::::::::: gi|740 IMNEDLGDALNCMFDARIPARWKKASWVSSTLGFWFTELLERNCQFTSWVFNGRPHCFWM 4450 4460 4470 4480 4490 4500 1840 1850 1860 1870 1880 1890 fj1030 TGFFNPQGFLTAMRQEITRANKGWALDNMVLCNEVTKWMKDDISAPPTEGVYVYGLYLEG :::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: gi|740 TGFFNPQGFLTAMRQEITRANKGWALDNMMLCNEVTKWMKDDISAPPTEGVYVYGLYLEG 4510 4520 4530 4540 4550 4560 1900 1910 1920 1930 1940 1950 fj1030 AGWDKRNMKLIESKPKVLFELMPVIRIYAENNTLRDPRFYSCPIYKKPVRTDLNYIAAVD :::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::: gi|740 AGWDKRNMKLIESKPKVLFELMPVIRIYAENNTLRDSRFYSCPIYKKPVRTDLNYIAAVD 4570 4580 4590 4600 4610 4620 1960 1970 fj1030 LRTAQTPEHWVLRGVALLCDVK :::.: ::::::::::::::.: gi|740 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