# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Ofj13109.fasta.nr -Q fj13109.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 fj13109, 545 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2362217958 residues in 6843189 sequences statistics sampled from 60000 to 6818132 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9630+/-0.000188; mu= 10.7092+/- 0.011 mean_var=79.7982+/-15.270, 0's: 34 Z-trim: 229 B-trim: 15 in 1/66 Lambda= 0.143575 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(6843189) gi|74762511|sp|Q8N141|ZN545_HUMAN Zinc finger prot ( 532) 3760 789.1 0 gi|22760718|dbj|BAC11308.1| unnamed protein produc ( 532) 3746 786.2 0 gi|109124516|ref|XP_001112876.1| PREDICTED: simila ( 574) 3687 774.0 0 gi|194675164|ref|XP_001788291.1| PREDICTED: simila ( 548) 3445 723.9 2.5e-206 gi|194215358|ref|XP_001494637.2| PREDICTED: simila (1539) 3428 720.8 6e-205 gi|73947801|ref|XP_867605.1| PREDICTED: similar to ( 745) 3273 688.4 1.6e-195 gi|81911355|sp|Q6P9Y7|ZN545_MOUSE Zinc finger prot ( 530) 3228 678.9 8.2e-193 gi|148692099|gb|EDL24046.1| zinc finger protein 82 (1357) 3173 667.9 4.3e-189 gi|73947799|ref|XP_867596.1| PREDICTED: similar to (1751) 3132 659.5 1.9e-186 gi|149056371|gb|EDM07802.1| rCG54648 [Rattus norve ( 987) 2982 628.2 2.8e-177 gi|73947797|ref|XP_867586.1| PREDICTED: similar to ( 939) 2858 602.5 1.5e-169 gi|154425583|gb|AAI51290.1| LOC100124429 protein [ ( 534) 2842 599.0 9.7e-169 gi|194215367|ref|XP_001493771.2| PREDICTED: simila ( 592) 2789 588.0 2.1e-165 gi|148692113|gb|EDL24060.1| zinc finger protein 30 ( 548) 2694 568.3 1.7e-159 gi|66773972|sp|Q60585|ZFP30_MOUSE Zinc finger prot ( 533) 2691 567.7 2.5e-159 gi|456269|emb|CAA82913.1| zinc finger protein 30 [ ( 548) 2691 567.7 2.6e-159 gi|149056388|gb|EDM07819.1| rCG54037 [Rattus norve ( 548) 2662 561.7 1.7e-157 gi|114677086|ref|XP_512623.2| PREDICTED: zinc fing ( 660) 2644 558.1 2.5e-156 gi|20140808|sp|Q9HCL3|ZFP14_HUMAN Zinc finger prot ( 533) 2639 556.9 4.4e-156 gi|158259667|dbj|BAF85792.1| unnamed protein produ ( 533) 2639 556.9 4.4e-156 gi|194675168|ref|XP_001790692.1| PREDICTED: simila ( 621) 2575 543.7 4.8e-152 gi|19343744|gb|AAH25629.1| Zfp82 protein [Mus musc ( 380) 2545 537.3 2.5e-150 gi|109458497|ref|XP_577780.2| PREDICTED: similar t (1293) 2548 538.5 3.9e-150 gi|148692112|gb|EDL24059.1| zinc finger protein 30 ( 486) 2504 528.9 1.1e-147 gi|6686181|sp|Q9Y2G7|ZFP30_HUMAN Zinc finger prote ( 519) 2386 504.5 2.6e-140 gi|75073966|sp|Q9BE27|ZFP30_MACFA Zinc finger prot ( 519) 2384 504.1 3.4e-140 gi|114676933|ref|XP_001165552.1| PREDICTED: zinc f ( 518) 2380 503.3 6.1e-140 gi|114676931|ref|XP_001165619.1| PREDICTED: zinc f ( 519) 2380 503.3 6.1e-140 gi|73947805|ref|XP_867624.1| PREDICTED: similar to (1980) 2329 493.3 2.4e-136 gi|73947807|ref|XP_541674.2| PREDICTED: similar to (2872) 2329 493.4 3.1e-136 gi|73947795|ref|XP_853558.1| PREDICTED: similar to (1186) 2312 489.5 1.9e-135 gi|85681855|sp|P10755|ZFP14_MOUSE Zinc finger prot ( 501) 2173 460.4 4.8e-127 gi|118764097|gb|AAI28773.1| LOC499124 protein [Rat ( 501) 2096 444.4 3e-122 gi|149722013|ref|XP_001492884.1| PREDICTED: simila ( 673) 1993 423.2 9.9e-116 gi|73948421|ref|XP_541655.2| PREDICTED: similar to ( 719) 1985 421.6 3.3e-115 gi|194215356|ref|XP_001493077.2| PREDICTED: simila (1098) 1964 417.4 9e-114 gi|193787074|dbj|BAG51897.1| unnamed protein produ ( 539) 1958 415.9 1.3e-113 gi|74760034|sp|Q8N9K5|ZN565_HUMAN Zinc finger prot ( 499) 1957 415.6 1.4e-113 gi|114676838|ref|XP_001162905.1| PREDICTED: simila ( 539) 1952 414.6 3.1e-113 gi|46249996|gb|AAH68453.1| Zinc finger protein 565 ( 499) 1951 414.4 3.3e-113 gi|194387894|dbj|BAG61360.1| unnamed protein produ ( 540) 1946 413.4 7.2e-113 gi|26337507|dbj|BAC32439.1| unnamed protein produc ( 457) 1938 411.7 2e-112 gi|149722053|ref|XP_001494018.1| PREDICTED: zinc f ( 688) 1923 408.7 2.3e-111 gi|151553977|gb|AAI49024.1| ZNF565 protein [Bos ta ( 494) 1921 408.2 2.5e-111 gi|109124478|ref|XP_001104516.1| PREDICTED: simila (1233) 1919 408.1 6.3e-111 gi|71153480|sp|Q8TAQ5|ZN420_HUMAN Zinc finger prot ( 688) 1916 407.3 6.4e-111 gi|149722044|ref|XP_001493834.1| PREDICTED: zinc f ( 671) 1894 402.7 1.5e-109 gi|124829120|gb|AAI33353.1| LOC100124518 protein [ ( 687) 1893 402.5 1.7e-109 gi|194387058|dbj|BAG59895.1| unnamed protein produ ( 636) 1889 401.7 2.9e-109 gi|114676876|ref|XP_001164063.1| PREDICTED: hypoth ( 636) 1888 401.5 3.4e-109 >>gi|74762511|sp|Q8N141|ZN545_HUMAN Zinc finger protein (532 aa) initn: 3760 init1: 3760 opt: 3760 Z-score: 4212.3 bits: 789.1 E(): 0 Smith-Waterman score: 3760; 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