# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Ohg00891s1.fasta.nr -Q hg00891s1.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 hg00891s1, 4838 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2779448989 residues in 8089198 sequences statistics sampled from 60000 to 8085784 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2623+/-0.000192; mu= 13.4504+/- 0.011 mean_var=116.5570+/-22.615, 0's: 25 Z-trim: 36 B-trim: 0 in 0/65 Lambda= 0.118797 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 52, opt: 40, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(8089198) gi|74744979|sp|Q5T4S7.1|UBR4_HUMAN RecName: Full=E (5183) 31678 5443.1 0 gi|19070472|gb|AAL83880.1|AF348492_1 p600 [Homo sa (5183) 31660 5440.1 0 gi|114554360|ref|XP_513158.2| PREDICTED: retinobla (5183) 31641 5436.8 0 gi|194207959|ref|XP_001501841.2| PREDICTED: ubiqui (5181) 31246 5369.1 0 gi|73950291|ref|XP_853095.1| PREDICTED: similar to (5181) 31204 5361.9 0 gi|119888879|ref|XP_592432.3| PREDICTED: similar t (5181) 30910 5311.5 0 gi|147742910|sp|A2AN08.1|UBR4_MOUSE RecName: Full= (5180) 30862 5303.3 0 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