# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Ohg01394s1.fasta.nr -Q hg01394s1.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 hg01394s1, 619 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 3124998222 residues in 9136299 sequences statistics sampled from 60000 to 9134943 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9413+/-0.000183; mu= 13.8747+/- 0.010 mean_var=71.8476+/-13.917, 0's: 32 Z-trim: 39 B-trim: 0 in 0/67 Lambda= 0.151310 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(9136299) gi|14602977|gb|AAH09975.1| WSCD1 protein [Homo sap ( 575) 4003 883.2 0 gi|109112953|ref|XP_001101952.1| PREDICTED: simila ( 575) 3958 873.4 0 gi|148680704|gb|EDL12651.1| cDNA sequence BC030477 ( 612) 3615 798.5 0 gi|73955318|ref|XP_848808.1| PREDICTED: similar to ( 575) 3611 797.7 0 gi|194217530|ref|XP_001918396.1| PREDICTED: WSC do ( 578) 3471 767.1 0 gi|81873382|sp|Q80XH4.1|WSCD1_MOUSE RecName: Full= ( 572) 3419 755.7 1e-215 gi|81887350|sp|Q505J3.1|WSCD1_RAT RecName: Full=WS ( 572) 3394 750.3 4.5e-214 gi|149637551|ref|XP_001510281.1| PREDICTED: simila ( 577) 2832 627.6 3.9e-177 gi|224076775|ref|XP_002199844.1| PREDICTED: WSC do ( 577) 2824 625.9 1.3e-176 gi|123908673|sp|Q0IIY2.1|WSCD1_XENTR RecName: Full ( 573) 2540 563.9 5.9e-158 gi|194675952|ref|XP_617236.4| PREDICTED: similar t ( 343) 1999 445.6 1.4e-122 gi|189524519|ref|XP_693820.2| PREDICTED: similar t ( 568) 1930 430.7 7.2e-118 gi|158706408|sp|A2BGL3.1|WSCD2_DANRE RecName: Full ( 572) 1929 430.5 8.4e-118 gi|148687998|gb|EDL19945.1| RIKEN cDNA C530024P05, ( 571) 1925 429.6 1.5e-117 gi|149063650|gb|EDM13973.1| rCG21835, isoform CRA_ ( 572) 1925 429.6 1.5e-117 gi|83759171|gb|AAI10331.1| WSCD2 protein [Homo sap ( 565) 1871 417.8 5.4e-114 gi|73994833|ref|XP_543448.2| PREDICTED: similar to ( 564) 1857 414.8 4.5e-113 gi|194374573|dbj|BAG57182.1| unnamed protein produ ( 565) 1856 414.5 5.2e-113 gi|189538004|ref|XP_001920170.1| PREDICTED: simila ( 427) 1827 408.1 3.4e-111 gi|47226482|emb|CAG08498.1| unnamed protein produc ( 565) 1820 406.7 1.2e-110 gi|119911825|ref|XP_001255275.1| PREDICTED: simila ( 304) 1756 392.5 1.2e-106 gi|109098597|ref|XP_001101755.1| PREDICTED: simila ( 562) 1596 357.8 6.3e-96 gi|194214211|ref|XP_001497174.2| PREDICTED: simila ( 541) 1409 316.9 1.2e-83 gi|109497518|ref|XP_001080476.1| PREDICTED: simila ( 363) 1315 296.3 1.3e-77 gi|219496018|ref|XP_002244642.1| hypothetical prot ( 458) 1225 276.7 1.3e-71 gi|194675950|ref|XP_001255823.2| PREDICTED: simila ( 396) 1192 269.5 1.7e-69 gi|56206659|emb|CAI24648.1| WSC domain containing ( 213) 1154 260.9 3.4e-67 gi|219474251|ref|XP_002234531.1| hypothetical prot ( 440) 1154 261.2 5.8e-67 gi|229290945|gb|EEN61620.1| hypothetical protein B ( 440) 1153 261.0 6.8e-67 gi|229297252|gb|EEN67889.1| hypothetical protein B ( 714) 952 217.3 1.6e-53 gi|229297254|gb|EEN67891.1| hypothetical protein B ( 591) 941 214.8 7.2e-53 gi|145207287|gb|AAH37969.2| WSCD2 protein [Homo sa ( 329) 876 200.4 8.7e-49 gi|26339802|dbj|BAC33564.1| unnamed protein produc ( 216) 675 156.4 1e-35 gi|73994831|ref|XP_864483.1| PREDICTED: similar to ( 254) 661 153.4 9.6e-35 gi|198430355|ref|XP_002124015.1| PREDICTED: simila ( 506) 597 139.7 2.6e-30 gi|198432137|ref|XP_002120962.1| PREDICTED: simila ( 281) 558 130.9 6.1e-28 gi|115760555|ref|XP_788295.2| PREDICTED: hypotheti ( 376) 545 128.2 5.4e-27 gi|115931210|ref|XP_001195912.1| PREDICTED: hypoth ( 459) 545 128.3 6.3e-27 gi|212518490|gb|EEB20243.1| conserved hypothetical ( 305) 513 121.1 5.9e-25 gi|91084175|ref|XP_966466.1| PREDICTED: similar to ( 289) 499 118.1 4.7e-24 gi|159155449|gb|AAI54933.1| LOC100127745 protein [ ( 230) 488 115.6 2.1e-23 gi|115729174|ref|XP_001198986.1| PREDICTED: hypoth ( 291) 483 114.6 5.3e-23 gi|56206657|emb|CAI24646.1| WSC domain containing ( 88) 459 108.9 8.2e-22 gi|229297196|gb|EEN67833.1| hypothetical protein B ( 213) 461 109.7 1.2e-21 gi|193907995|gb|EDW06862.1| GI15414 [Drosophila mo ( 322) 460 109.6 1.9e-21 gi|193896567|gb|EDV95433.1| GH17945 [Drosophila gr ( 328) 460 109.6 1.9e-21 gi|158706518|sp|Q7Q297.3|WSCD_ANOGA RecName: Full= ( 319) 459 109.4 2.1e-21 gi|194147149|gb|EDW62868.1| GJ16373 [Drosophila vi ( 322) 458 109.2 2.5e-21 gi|190649744|gb|EDV47022.1| GG19405 [Drosophila er ( 317) 455 108.5 3.9e-21 gi|223969257|emb|CAR94359.1| CG9164-PA [Drosophila ( 296) 454 108.3 4.3e-21 >>gi|14602977|gb|AAH09975.1| WSCD1 protein [Homo sapiens (575 aa) initn: 4003 init1: 4003 opt: 4003 Z-score: 4719.2 bits: 883.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 4003; 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