# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Ohg02120s1.fasta.nr -Q hg02120s1.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 hg02120s1, 1109 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 3124998222 residues in 9136299 sequences statistics sampled from 60000 to 9127485 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6234+/-0.000193; mu= 12.7170+/- 0.011 mean_var=98.1268+/-18.768, 0's: 30 Z-trim: 69 B-trim: 2 in 1/66 Lambda= 0.129473 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(9136299) gi|24369934|gb|AAN57784.1|AF464189_1 WAVE-associat (1075) 7085 1334.7 0 gi|76665096|ref|XP_590495.2| PREDICTED: similar to (1075) 7071 1332.1 0 gi|149728319|ref|XP_001495819.1| PREDICTED: SLIT-R (1075) 7062 1330.4 0 gi|109035849|ref|XP_001097317.1| PREDICTED: simila (1075) 7013 1321.3 0 gi|119584354|gb|EAW63950.1| SLIT-ROBO Rho GTPase a ( 955) 6313 1190.5 0 gi|119584355|gb|EAW63951.1| SLIT-ROBO Rho GTPase a ( 935) 6187 1166.9 0 gi|34604126|gb|AAQ79776.1| Rho GTPase activating p (1064) 4834 914.3 0 gi|114643999|ref|XP_001164049.1| PREDICTED: SLIT-R (1061) 4823 912.2 0 gi|109097610|ref|XP_001116821.1| PREDICTED: simila (1059) 4812 910.1 0 gi|114643997|ref|XP_001164248.1| PREDICTED: SLIT-R (1062) 4805 908.8 0 gi|122066214|sp|Q91Z69.2|SRGP1_MOUSE RecName: Full (1062) 4794 906.8 0 gi|119617528|gb|EAW97122.1| SLIT-ROBO Rho GTPase a (1022) 4607 871.8 0 gi|148692479|gb|EDL24426.1| mCG114195 [Mus musculu (1022) 4589 868.5 0 gi|149029195|gb|EDL84471.1| similar to SLIT-ROBO R (1022) 4581 867.0 0 gi|213626327|gb|AAI71580.1| Si:ch211-125a15.2 prot (1071) 4003 759.0 3.5e-216 gi|48429207|sp|O43295.3|SRGP2_HUMAN RecName: Full= (1099) 3938 746.9 1.6e-212 gi|109035846|ref|XP_001097218.1| PREDICTED: simila (1099) 3932 745.8 3.5e-212 gi|149728321|ref|XP_001495736.1| PREDICTED: SLIT-R (1099) 3925 744.5 8.7e-212 gi|73985028|ref|XP_852764.1| PREDICTED: similar to (1099) 3924 744.3 9.9e-212 gi|76665098|ref|XP_869609.1| PREDICTED: similar to (1099) 3924 744.3 9.9e-212 gi|148667017|gb|EDK99433.1| SLIT-ROBO Rho GTPase a ( 979) 3885 737.0 1.4e-209 gi|189442797|gb|AAI67211.1| SLIT-ROBO Rho GTPase a (1099) 3885 737.0 1.5e-209 gi|62648014|ref|XP_575637.1| PREDICTED: similar to (1099) 3885 737.0 1.5e-209 gi|14028714|gb|AAK52474.1|AF338472_1 Rho GTPase-ac ( 987) 3880 736.0 2.7e-209 gi|48428625|sp|Q812A2.1|SRGP2_MOUSE RecName: Full= (1099) 3880 736.1 2.9e-209 gi|118102419|ref|XP_417972.2| PREDICTED: similar t (1073) 3397 645.8 4.2e-182 gi|114572187|ref|XP_001163749.1| PREDICTED: SLIT-R (1072) 3379 642.5 4.3e-181 gi|219520432|gb|AAI44344.1| SRGAP2 protein [Homo s (1070) 3367 640.2 2e-180 gi|126306747|ref|XP_001365837.1| PREDICTED: simila (1073) 3363 639.5 3.4e-180 gi|124375936|gb|AAI32873.1| SLIT-ROBO Rho GTPase a (1071) 3355 638.0 9.6e-180 gi|48427907|sp|O75044.2|FNBP2_HUMAN RecName: Full= (1071) 3353 637.6 1.2e-179 gi|114572193|ref|XP_001163788.1| PREDICTED: SLIT-R ( 918) 3349 636.8 1.9e-179 gi|55662259|emb|CAH73674.1| SLIT-ROBO Rho GTPase a ( 984) 3349 636.8 2e-179 gi|114572191|ref|XP_001163825.1| PREDICTED: SLIT-R (1003) 3349 636.8 2e-179 gi|114572189|ref|XP_001163866.1| PREDICTED: SLIT-R (1040) 3349 636.9 2e-179 gi|119908010|ref|XP_598073.3| PREDICTED: similar t (1071) 3346 636.3 3.1e-179 gi|109018622|ref|XP_001089021.1| PREDICTED: SLIT-R (1071) 3333 633.9 1.7e-178 gi|74005918|ref|XP_848803.1| PREDICTED: similar to (1071) 3332 633.7 1.9e-178 gi|74005908|ref|XP_856904.1| PREDICTED: similar to (1079) 3329 633.1 2.8e-178 gi|194210238|ref|XP_001491388.2| PREDICTED: SLIT-R (1103) 3326 632.6 4.2e-178 gi|74005922|ref|XP_857192.1| PREDICTED: similar to (1081) 3321 631.6 7.9e-178 gi|122065186|sp|Q91Z67.2|FNBP2_MOUSE RecName: Full (1071) 3308 629.2 4.2e-177 gi|148707762|gb|EDL39709.1| mCG131000, isoform CRA (1042) 3270 622.1 5.6e-175 gi|114572181|ref|XP_514148.2| PREDICTED: SLIT-ROBO (1084) 3197 608.5 7.4e-171 gi|74005924|ref|XP_857241.1| PREDICTED: similar to (1083) 3180 605.3 6.7e-170 gi|74005906|ref|XP_856858.1| PREDICTED: similar to (1089) 3177 604.7 9.9e-170 gi|169154745|emb|CAQ14643.1| SLIT-ROBO Rho GTPase (1100) 3102 590.7 1.6e-165 gi|114107587|gb|AAI22887.1| SLIT-ROBO Rho GTPase a (1100) 3099 590.2 2.4e-165 gi|149036886|gb|EDL91504.1| similar to WARP (predi ( 800) 3074 585.4 4.9e-164 gi|26341836|dbj|BAC34580.1| unnamed protein produc ( 522) 3013 573.8 9.6e-161 >>gi|24369934|gb|AAN57784.1|AF464189_1 WAVE-associated R (1075 aa) initn: 7085 init1: 7085 opt: 7085 Z-score: 7149.8 bits: 1334.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 7085; 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