# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Ohh00016y3.fasta.nr -Q hh00016y3.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 hh00016y3, 3705 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2362217958 residues in 6843189 sequences statistics sampled from 60000 to 6840851 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9713+/-0.000188; mu= 14.1751+/- 0.010 mean_var=92.5930+/-18.553, 0's: 28 Z-trim: 43 B-trim: 3456 in 2/62 Lambda= 0.133286 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 48, opt: 36, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(6843189) gi|166788528|dbj|BAG06712.1| DNAH9 variant protein (3705) 24578 4738.5 0 gi|119610386|gb|EAW89980.1| dynein, axonemal, heav (4411) 24562 4735.5 0 gi|119610389|gb|EAW89983.1| dynein, axonemal, heav (4486) 21500 4146.7 0 gi|8574048|emb|CAB94756.1| axonemal dynein heavy c (4486) 21500 4146.7 0 gi|114155133|ref|NP_001363.2| dynein, axonemal, he (4486) 21500 4146.7 0 gi|12643822|sp|Q9NYC9.1|DYH9_HUMAN Dynein heavy ch (4486) 21491 4145.0 0 gi|158253421|gb|AAI53884.1| DNAH9 protein [Homo sa (2992) 19833 3826.0 0 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(4464) 15274 2949.5 0 gi|73964963|ref|XP_533129.2| PREDICTED: similar to (4468) 15172 2929.9 0 gi|189233886|ref|XP_971055.2| PREDICTED: similar t (4475) 14443 2789.7 0 gi|194216584|ref|XP_001915362.1| PREDICTED: simila (4497) 14433 2787.8 0 gi|108875107|gb|EAT39332.1| dynein heavy chain [Ae (4472) 14375 2776.6 0 gi|119610388|gb|EAW89982.1| dynein, axonemal, heav (2248) 14366 2774.7 0 gi|110763439|ref|XP_623957.2| PREDICTED: similar t (4461) 14113 2726.2 0 gi|54639819|gb|EAL29221.1| GA17641-PA [Drosophila (4486) 14075 2718.9 0 gi|23171841|gb|AAF55834.2| CG3723-PA [Drosophila m (4496) 14055 2715.1 0 gi|194182597|gb|EDW96208.1| GE25024 [Drosophila ya (4222) 14052 2714.5 0 gi|73976480|ref|XP_539463.2| PREDICTED: similar to (4510) 13962 2697.2 0 gi|157018370|gb|EAL41019.3| AGAP010435-PA [Anophel (4486) 13927 2690.5 0 gi|33321803|gb|AAQ06635.1| dynein heavy chain prot (4488) 13862 2678.0 0 gi|6409282|gb|AAF07922.1|AF183144_1 left-right dyn (4488) 13796 2665.3 0 gi|153791278|ref|NP_034190.2| 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