# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Ohk01703s1.fasta.nr -Q hk01703s1.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 hk01703s1, 1635 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 3124998222 residues in 9136299 sequences statistics sampled from 60000 to 9101714 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8654+/-0.000214; mu= 7.4245+/- 0.012 mean_var=179.1198+/-34.628, 0's: 34 Z-trim: 166 B-trim: 105 in 1/64 Lambda= 0.095830 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(9136299) gi|168273230|dbj|BAG10454.1| ribosome-binding prot (1560) 9906 1383.7 0 gi|152949522|dbj|BAF73807.1| p180/ribosome recepto (1540) 8180 1145.0 0 gi|23822112|sp|Q9P2E9.4|RRBP1_HUMAN RecName: Full= (1410) 7389 1035.6 0 gi|23822106|sp|Q99PL5.2|RRBP1_MOUSE RecName: Full= (1605) 6881 965.4 0 gi|123239483|emb|CAM26890.1| ribosome binding prot (1464) 6600 926.6 0 gi|109468922|ref|XP_230637.4| PREDICTED: similar t (1327) 6535 917.5 0 gi|109470913|ref|XP_001053669.1| PREDICTED: simila (1417) 6343 891.0 0 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