# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Ohk05319.fasta.nr -Q hk05319.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 hk05319, 1011 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2362217958 residues in 6843189 sequences statistics sampled from 60000 to 6791838 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1167+/-0.00019; mu= 14.9021+/- 0.011 mean_var=100.5826+/-20.576, 0's: 33 Z-trim: 390 B-trim: 2831 in 1/65 Lambda= 0.127883 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(6843189) gi|62087748|dbj|BAD92321.1| Sulfonylurea receptor (1011) 6772 1260.9 0 gi|126332097|ref|XP_001366704.1| PREDICTED: simila (1579) 5222 975.2 0 gi|118091216|ref|XP_421005.2| PREDICTED: similar t (1595) 4914 918.4 0 gi|118091218|ref|XP_001232387.1| PREDICTED: simila (1558) 4798 896.9 0 gi|114645660|ref|XP_001149494.1| PREDICTED: ATP-bi (1558) 4135 774.6 0 gi|119616865|gb|EAW96459.1| ATP-binding cassette, (1549) 4087 765.8 0 gi|119616859|gb|EAW96453.1| ATP-binding cassette, (1549) 4087 765.8 0 gi|114645654|ref|XP_001149571.1| PREDICTED: ATP-bi (1549) 4087 765.8 0 gi|109095933|ref|XP_001098888.1| PREDICTED: simila (1549) 4084 765.2 0 gi|126339888|ref|XP_001362734.1| PREDICTED: simila (1552) 4079 764.3 0 gi|126339886|ref|XP_001362645.1| PREDICTED: simila (1552) 4079 764.3 0 gi|149713819|ref|XP_001502308.1| PREDICTED: ATP-bi (1549) 4073 763.2 0 gi|73997047|ref|XP_852746.1| PREDICTED: similar to (1549) 4073 763.2 0 gi|149713822|ref|XP_001502321.1| PREDICTED: ATP-bi (1549) 4073 763.2 0 gi|73997053|ref|XP_543765.2| PREDICTED: similar to (1549) 4073 763.2 0 gi|18202098|sp|O60706|ABCC9_HUMAN ATP-binding cass (1549) 4068 762.3 0 gi|3127176|gb|AAC16058.1| sulfonylurea receptor 2B (1549) 4068 762.3 0 gi|4996854|dbj|BAA12970.2| sulfonylurea receptor 2 (1546) 4063 761.3 7e-217 gi|18202338|sp|P70170|ABCC9_MOUSE ATP-binding cass (1546) 4063 761.3 7e-217 gi|2149953|gb|AAB58701.1| sulfonylurea receptor 2B (1546) 4059 760.6 1.2e-216 gi|15778680|gb|AAL07506.1|AF417511_1 sulphonylurea (1549) 4057 760.2 1.5e-216 gi|18202413|sp|P82451|ABCC9_RABIT ATP-binding cass (1549) 4057 760.2 1.5e-216 gi|126332099|ref|XP_001366758.1| PREDICTED: simila (1596) 4053 759.5 2.6e-216 gi|126339894|ref|XP_001362991.1| PREDICTED: simila (1553) 4049 758.8 4.2e-216 gi|126339890|ref|XP_001362820.1| PREDICTED: simila (1553) 4049 758.8 4.2e-216 gi|119588842|gb|EAW68436.1| ATP-binding cassette, (1404) 3944 739.3 2.7e-210 gi|3643190|gb|AAC36724.1| sulfonylurea receptor 1 (1581) 3944 739.4 2.9e-210 gi|189442452|gb|AAI67829.1| ATP-binding cassette, (1581) 3944 739.4 2.9e-210 gi|119588843|gb|EAW68437.1| ATP-binding cassette, (1588) 3944 739.4 2.9e-210 gi|6920064|sp|Q09428|ABCC8_HUMAN ATP-binding casse (1581) 3936 737.9 8e-210 gi|1369844|gb|AAB02278.1| sulfonylurea receptor (1581) 3924 735.7 3.7e-209 gi|1374920|gb|AAB02418.1| alternative splice (exon (1582) 3924 735.7 3.7e-209 gi|1480871|gb|AAB36699.1| sulfonylurea receptor (1581) 3923 735.5 4.2e-209 gi|109107151|ref|XP_001088694.1| PREDICTED: ATP-bi (1581) 3893 730.0 2e-207 gi|119907194|ref|XP_584132.3| PREDICTED: similar t (1581) 3855 723.0 2.5e-205 gi|187954955|gb|AAI41412.1| ATP-binding cassette, (1588) 3845 721.1 9.1e-205 gi|149055838|gb|EDM07269.1| ATP-binding cassette, (1079) 3841 720.2 1.2e-204 gi|2773162|gb|AAB96684.1| sulfonylurea receptor 1B (1544) 3841 720.4 1.5e-204 gi|19862855|sp|Q09429|ABCC8_RAT ATP-binding casset (1582) 3841 720.4 1.5e-204 gi|11691886|dbj|BAB19011.1| sulphonylurea receptor (1582) 3841 720.4 1.5e-204 gi|1311534|gb|AAA99237.1| sulfonylurea receptor [R (1581) 3838 719.8 2.2e-204 gi|3851471|gb|AAC72292.1| sulfonylurea receptor-1 ( 899) 3834 718.8 2.6e-204 gi|73988884|ref|XP_542520.2| PREDICTED: similar to (1543) 3831 718.5 5.4e-204 gi|1711613|sp|Q09427|ABCC8_CRICR ATP-binding casse (1582) 3802 713.2 2.2e-202 gi|1083191|pir||A56248 sulfonylurea receptor - gol (1582) 3802 713.2 2.2e-202 gi|37650997|emb|CAD54073.1| sulphonylurea receptor (1575) 3776 708.4 6.2e-201 gi|114636657|ref|XP_508310.2| PREDICTED: ATP-bindi (1551) 3609 677.6 1.1e-191 gi|194213881|ref|XP_001501692.2| PREDICTED: simila (1539) 3517 660.6 1.5e-186 gi|189537541|ref|XP_001920483.1| PREDICTED: ATP-bi (1559) 3143 591.6 8.8e-166 gi|73997051|ref|XP_866286.1| PREDICTED: similar to (1534) 3102 584.0 1.6e-163 >>gi|62087748|dbj|BAD92321.1| Sulfonylurea receptor 1 va (1011 aa) initn: 6772 init1: 6772 opt: 6772 Z-score: 6752.2 bits: 1260.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 6772; 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