# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Opf02338.fasta.nr -Q pf02338.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 pf02338, 2362 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 3071326396 residues in 8985982 sequences statistics sampled from 60000 to 8983227 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6537+/-0.000188; mu= 14.7162+/- 0.010 mean_var=84.2238+/-16.327, 0's: 37 Z-trim: 42 B-trim: 45 in 1/66 Lambda= 0.139752 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 43, opt: 31, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(8985982) gi|205371872|sp|Q4AC94.3|C2CD3_HUMAN RecName: Full (2353) 15587 3154.1 0 gi|114639348|ref|XP_001174891.1| PREDICTED: hypoth (2353) 15432 3122.8 0 gi|109107899|ref|XP_001115612.1| PREDICTED: hypoth (2242) 14202 2874.8 0 gi|148596944|ref|NP_056346.3| C2 calcium-dependent (1963) 12988 2630.0 0 gi|72069061|dbj|BAE17137.1| hypothetical protein [ (1963) 12944 2621.1 0 gi|114639350|ref|XP_001174885.1| PREDICTED: hypoth (1970) 12861 2604.4 0 gi|114639352|ref|XP_001174886.1| PREDICTED: hypoth (1963) 12854 2603.0 0 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