# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Opf02494.fasta.nr -Q pf02494.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 pf02494, 2414 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2362217958 residues in 6843189 sequences statistics sampled from 60000 to 6842237 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0533+/-0.000188; mu= 17.0044+/- 0.011 mean_var=73.7325+/-14.543, 0's: 36 Z-trim: 42 B-trim: 1547 in 1/65 Lambda= 0.149364 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 44, opt: 32, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(6843189) gi|62088916|dbj|BAD92905.1| Insulin-like growth fa (2414) 16671 3603.5 0 gi|60416403|sp|P11717.2|MPRI_HUMAN Cation-independ (2491) 16657 3600.5 0 gi|14210066|gb|AAK56918.1| IGF2R [Homo sapiens] (2491) 16646 3598.2 0 gi|33055|emb|CAA68395.1| unnamed protein product [ (2491) 16639 3596.6 0 gi|188672|gb|AAA59866.1| mannose 6-phosphate recep (2491) 16590 3586.1 0 gi|14647151|gb|AAK71867.1|AF339161_1 mannose-6-pho (2425) 14644 3166.7 0 gi|14647149|gb|AAK71866.1|AF339160_1 mannose-6-pho (2421) 14642 3166.3 0 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6-Phosphate Rec ( 485) 2054 453.2 3e-124 gi|162330144|pdb|2V5N|A Chain A, Structure Of Huma ( 299) 2009 443.3 1.7e-121 gi|12655877|gb|AAK00636.1| mannose 6 phosphate/ins ( 502) 1996 440.7 1.8e-120 >>gi|62088916|dbj|BAD92905.1| Insulin-like growth factor (2414 aa) initn: 16671 init1: 16671 opt: 16671 Z-score: 19399.1 bits: 3603.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 16671; 100.000% identity (100.000% similar) in 2414 aa overlap (1-2414:1-2414) 10 20 30 40 50 60 pf0249 GPSSAVCMHDLKTRTYHSVGDSVLRSATRSLLEFNTTVSCDQQGTNHRVQSSIAFLCGKT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 GPSSAVCMHDLKTRTYHSVGDSVLRSATRSLLEFNTTVSCDQQGTNHRVQSSIAFLCGKT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pf0249 LGTPEFVTATECVHYFEWRTTAACKKDIFKANKEVPCYVFDEELRKHDLNPLIKLSGAYL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 LGTPEFVTATECVHYFEWRTTAACKKDIFKANKEVPCYVFDEELRKHDLNPLIKLSGAYL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pf0249 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