# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Opg00681.fasta.nr -Q pg00681.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 pg00681, 1546 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2362217958 residues in 6843189 sequences statistics sampled from 60000 to 6830528 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7425+/-0.000211; mu= 9.4880+/- 0.012 mean_var=160.3918+/-30.602, 0's: 38 Z-trim: 69 B-trim: 0 in 0/64 Lambda= 0.101271 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(6843189) gi|109085035|ref|XP_001085858.1| PREDICTED: simila (1597) 9947 1466.7 0 gi|109085037|ref|XP_001085960.1| PREDICTED: simila (1595) 9917 1462.3 0 gi|163644261|ref|NP_001106197.1| hypothetical prot (1554) 8235 1216.6 0 gi|61742808|ref|NP_055820.1| hypothetical protein (1484) 8046 1188.9 0 gi|73964184|ref|XP_854808.1| PREDICTED: similar to (1587) 7951 1175.1 0 gi|73964180|ref|XP_548002.2| PREDICTED: similar to (1552) 6189 917.6 0 gi|74184550|dbj|BAE27896.1| unnamed protein produc (1574) 5090 757.1 2.1e-215 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