# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Opj01758.fasta.nr -Q pj01758.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 pj01758, 589 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2779448989 residues in 8089198 sequences statistics sampled from 60000 to 8087881 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8618+/-0.000185; mu= 13.7429+/- 0.010 mean_var=78.0082+/-16.030, 0's: 33 Z-trim: 35 B-trim: 3050 in 1/64 Lambda= 0.145213 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(8089198) gi|117949602|sp|Q7Z2K6.2|ERMP1_HUMAN RecName: Full ( 904) 4013 850.8 0 gi|149736855|ref|XP_001493226.1| PREDICTED: endopl ( 893) 3773 800.5 0 gi|73946936|ref|XP_852123.1| PREDICTED: similar to ( 917) 3711 787.5 0 gi|194034135|ref|XP_001924252.1| PREDICTED: endopl ( 905) 3700 785.2 0 gi|118597349|sp|Q3UVK0.2|ERMP1_MOUSE RecName: Full ( 898) 3605 765.3 0 gi|148709742|gb|EDL41688.1| mCG124990, isoform CRA ( 918) 3605 765.3 0 gi|81864306|sp|Q6UPR8.1|ERMP1_RAT RecName: Full=En ( 898) 3603 764.9 0 gi|74209380|dbj|BAE23269.1| unnamed protein produc ( 898) 3599 764.0 0 gi|26349293|dbj|BAC38286.1| unnamed protein produc ( 680) 3594 762.9 0 gi|66347358|emb|CAI95005.1| endoplasmic reticulum ( 518) 3548 753.1 4.8e-215 gi|126335629|ref|XP_001365350.1| PREDICTED: hypoth ( 899) 3523 748.1 2.7e-213 gi|109111623|ref|XP_001108869.1| PREDICTED: simila (1016) 3178 675.9 1.7e-191 gi|224091246|ref|XP_002192981.1| PREDICTED: simila ( 922) 2780 592.5 2e-166 gi|118597350|sp|Q0VGW4.1|ERMP1_XENLA RecName: Full ( 876) 2678 571.1 5.2e-160 gi|211826946|gb|AAH31630.2| ERMP1 protein [Homo sa ( 376) 2625 559.6 6.3e-157 gi|47077855|dbj|BAD18796.1| unnamed protein produc ( 419) 2545 542.9 7.5e-152 gi|10439948|dbj|BAB15604.1| unnamed protein produc ( 317) 2206 471.7 1.5e-130 gi|55731416|emb|CAH92422.1| hypothetical protein [ ( 303) 2008 430.3 4.4e-118 gi|21618719|gb|AAH31519.1| Ermp1 protein [Mus musc ( 317) 1996 427.8 2.6e-117 gi|83318276|gb|AAI08866.1| LOC398673 protein [Xeno ( 408) 1821 391.2 3.4e-106 gi|170285061|gb|AAI61393.1| LOC100145630 protein [ ( 400) 1819 390.8 4.4e-106 gi|148709741|gb|EDL41687.1| mCG124990, isoform CRA ( 850) 1742 375.0 5.4e-101 gi|149062677|gb|EDM13100.1| rCG48104 [Rattus norve ( 850) 1732 372.9 2.3e-100 gi|193787467|dbj|BAG52673.1| unnamed protein produ ( 351) 1714 368.7 1.7e-99 gi|32766491|gb|AAH55270.1| LOC398673 protein [Xeno ( 380) 1707 367.3 4.9e-99 gi|189534531|ref|XP_699324.3| PREDICTED: similar t ( 445) 1545 333.4 9.1e-89 gi|210091075|gb|EEA39335.1| hypothetical protein B ( 889) 1435 310.7 1.3e-81 gi|190583340|gb|EDV23411.1| hypothetical protein T ( 846) 1157 252.4 4.2e-64 gi|156546880|ref|XP_001606695.1| PREDICTED: simila ( 883) 1050 230.0 2.4e-57 gi|47223597|emb|CAF99206.1| unnamed protein produc ( 913) 954 209.9 2.8e-51 gi|212512772|gb|EEB15473.1| conserved hypothetical ( 874) 921 203.0 3.3e-49 gi|193910546|gb|EDW09413.1| GI20486 [Drosophila mo ( 861) 914 201.5 9e-49 gi|194157383|gb|EDW72284.1| GK20844 [Drosophila wi ( 861) 906 199.8 2.9e-48 gi|193910545|gb|EDW09412.1| GI19045 [Drosophila mo ( 862) 897 197.9 1.1e-47 gi|193902157|gb|EDW01024.1| GH21200 [Drosophila gr ( 882) 894 197.3 1.7e-47 gi|198136160|gb|EDY69036.1| GA24794 [Drosophila ps ( 862) 890 196.5 2.9e-47 gi|194110367|gb|EDW32410.1| GL11618 [Drosophila pe ( 862) 885 195.4 6.1e-47 gi|194145573|gb|EDW61969.1| GJ20013 [Drosophila vi ( 865) 884 195.2 7e-47 gi|193902156|gb|EDW01023.1| GH20682 [Drosophila gr ( 862) 882 194.8 9.4e-47 gi|193910549|gb|EDW09416.1| GI19043 [Drosophila mo ( 892) 877 193.8 2e-46 gi|194177895|gb|EDW91506.1| GE12043 [Drosophila ya ( 862) 876 193.5 2.2e-46 gi|198136158|gb|EAL25416.2| GA11297 [Drosophila ps ( 894) 873 192.9 3.6e-46 gi|190620194|gb|EDV35718.1| GF12333 [Drosophila an ( 862) 869 192.1 6.2e-46 gi|194145577|gb|EDW61973.1| GJ20011 [Drosophila vi ( 892) 869 192.1 6.4e-46 gi|190657986|gb|EDV55199.1| GG20912 [Drosophila er ( 854) 868 191.9 7.1e-46 gi|194110364|gb|EDW32407.1| GL11616 [Drosophila pe ( 894) 868 191.9 7.4e-46 gi|167876047|gb|EDS39430.1| conserved hypothetical ( 875) 867 191.7 8.4e-46 gi|198136159|gb|EAL25420.2| GA21772 [Drosophila ps ( 861) 865 191.2 1.1e-45 gi|91086773|ref|XP_972680.1| PREDICTED: similar to ( 879) 865 191.2 1.1e-45 gi|194194230|gb|EDX07806.1| GD11449 [Drosophila si ( 862) 864 191.0 1.3e-45 >>gi|117949602|sp|Q7Z2K6.2|ERMP1_HUMAN RecName: Full=End (904 aa) initn: 4013 init1: 4013 opt: 4013 Z-score: 4540.6 bits: 850.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 4013; 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