# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Osj03418.fasta.nr -Q sj03418.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 sj03418, 1177 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 3071326396 residues in 8985982 sequences statistics sampled from 60000 to 8982959 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0636+/-0.000187; mu= 15.2200+/- 0.010 mean_var=71.5112+/-14.526, 0's: 34 Z-trim: 50 B-trim: 5829 in 2/63 Lambda= 0.151666 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(8985982) gi|62087470|dbj|BAD92182.1| PREDICTED: integrin, a (1177) 7787 1713.9 0 gi|162317970|gb|AAI56096.1| Integrin, alpha D [syn (1161) 7665 1687.2 0 gi|12643717|sp|Q13349.1|ITAD_HUMAN RecName: Full=I (1162) 7653 1684.6 0 gi|194218991|ref|XP_001915421.1| PREDICTED: simila (1160) 6190 1364.5 0 gi|160837835|ref|NP_001104272.1| integrin, alpha D (1168) 6179 1362.1 0 gi|73958316|ref|XP_848776.1| PREDICTED: similar to (1166) 5996 1322.0 0 gi|151556938|gb|AAI49717.1| ITGAD protein [Bos tau (1165) 5826 1284.8 0 gi|149067641|gb|EDM17193.1| rCG39970 [Rattus norve (1163) 5696 1256.4 0 gi|48428189|sp|Q9QYE7.1|ITAD_RAT RecName: Full=Int (1161) 5691 1255.3 0 gi|148685686|gb|EDL17633.1| mCG133512, isoform CRA (1168) 5592 1233.6 0 gi|88911344|sp|Q3V0T4.1|ITAD_MOUSE RecName: Full=I (1168) 5579 1230.8 0 gi|148685685|gb|EDL17632.1| mCG133512, isoform CRA (1164) 5515 1216.8 0 gi|23398603|gb|AAH38237.1| ITGAX protein [Homo sap (1169) 4979 1099.5 0 gi|60654537|gb|AAX29959.1| integrin alpha X [synth (1170) 4979 1099.5 0 gi|146345441|sp|P20702.3|ITAX_HUMAN RecName: Full= (1163) 4975 1098.6 0 gi|487830|gb|AAA59180.1| eukocyte adhesion glycopr (1163) 4966 1096.7 0 gi|164507177|gb|ABY59790.1| integrin alpha X [Equu (1160) 4958 1094.9 0 gi|386831|gb|AAA51620.1|AAA51620 integrin alpha su (1163) 4925 1087.7 0 gi|148749338|gb|ABR09545.1| CD11c protein [Callith (1161) 4920 1086.6 0 gi|73958318|ref|XP_547049.2| PREDICTED: similar to (1149) 4883 1078.5 0 gi|126334038|ref|XP_001370553.1| PREDICTED: simila (1224) 4632 1023.6 0 gi|126334042|ref|XP_001370610.1| PREDICTED: simila (1154) 4579 1012.0 0 gi|74220882|dbj|BAE33629.1| unnamed protein produc (1202) 4507 996.2 0 gi|64654539|gb|AAH96347.1| Integrin, alpha M (comp (1152) 4480 990.3 0 gi|1708572|sp|P11215.2|ITAM_HUMAN RecName: Full=In (1152) 4479 990.1 0 gi|119572529|gb|EAW52144.1| integrin, alpha M (com (1152) 4479 990.1 0 gi|64654595|gb|AAH96346.1| Integrin, alpha M (comp (1152) 4478 989.9 0 gi|307114|gb|AAA59491.1| leukocyte adhesion glycop (1152) 4470 988.1 0 gi|307148|gb|AAA59544.1| glycoprotein Mac-1 gi (1153) 4467 987.5 0 gi|119572528|gb|EAW52143.1| integrin, alpha M (com (1153) 4467 987.5 0 gi|74229861|gb|AAX46797.1| integrin alpha M [Bos t (1152) 4465 987.0 0 gi|126334040|ref|XP_001370580.1| PREDICTED: simila (1156) 4465 987.0 0 gi|124127039|gb|ABM92271.1| CD11b [Ovis aries] (1152) 4460 985.9 0 gi|386975|gb|AAA59903.1| neutrophil adherence rece (1145) 4447 983.1 0 gi|33340728|gb|AAQ14925.1| Mac-1 alpha subunit [Pa (1144) 4444 982.4 0 gi|124127041|gb|ABM92272.1| CD11b [Ovis canadensis (1152) 4432 979.8 0 gi|73958268|ref|XP_848527.1| PREDICTED: similar to (1153) 4420 977.2 0 gi|149725809|ref|XP_001495640.1| PREDICTED: simila (1140) 4410 975.0 0 gi|148685679|gb|EDL17626.1| integrin alpha M, isof (1153) 4370 966.3 0 gi|74213162|dbj|BAE41718.1| unnamed protein produc (1153) 4369 966.0 0 gi|132626289|ref|NP_001076429.1| integrin alpha M (1154) 4358 963.6 0 gi|74178358|dbj|BAE32446.1| unnamed protein produc (1153) 4356 963.2 0 gi|73958264|ref|XP_547048.2| PREDICTED: similar to (1165) 4354 962.8 0 gi|149067646|gb|EDM17198.1| integrin alpha M [Ratt (1151) 4350 961.9 0 gi|124956|sp|P05555.2|ITAM_MOUSE RecName: Full=Int (1153) 4348 961.4 0 gi|8917587|gb|AAF81280.1| integrin beta 2 alpha su (1151) 4340 959.7 0 gi|74212905|dbj|BAE33399.1| unnamed protein produc (1232) 4291 949.0 0 gi|74191759|dbj|BAE32836.1| unnamed protein produc (1166) 4280 946.6 0 gi|148685680|gb|EDL17627.1| integrin alpha M, isof (1168) 4279 946.3 0 gi|74222716|dbj|BAE42227.1| unnamed protein produc (1064) 3988 882.6 0 >>gi|62087470|dbj|BAD92182.1| PREDICTED: integrin, alpha (1177 aa) initn: 7787 init1: 7787 opt: 7787 Z-score: 9198.0 bits: 1713.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 7787; 100.000% identity (100.000% similar) in 1177 aa overlap (1-1177:1-1177) 10 20 30 40 50 60 sj0341 CALSPTFHFPSTRCSGMTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 CALSPTFHFPSTRCSGMTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 sj0341 SRLVVGAPLEVVAANQTGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 SRLVVGAPLEVVAANQTGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 sj0341 ACGPTLHRVCGENSYSKGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 ACGPTLHRVCGENSYSKGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQN 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 sj0341 DFNQMKGFVQAVMGQFEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 DFNQMKGFVQAVMGQFEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 sj0341 TFTATGILTVVTQLFHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 TFTATGILTVVTQLFHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 sj0341 IGVGHAFQGPTARQELNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 IGVGHAFQGPTARQELNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASS 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 sj0341 SFQHEMSQEGFSTALTMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 SFQHEMSQEGFSTALTMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYL 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 sj0341 GYSTELALWKGVQNLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 GYSTELALWKGVQNLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSV 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 sj0341 DVDSDGSTDLILIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 DVDSDGSTDLILIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAAL 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 sj0341 TVLGDVNEDKLIDVAIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 TVLGDVNEDKLIDVAIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFG 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 sj0341 QALSGGQDLTQDGLMDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 QALSGGQDLTQDGLMDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPS 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 sj0341 ALEAGDATVCLTIQKSSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 ALEAGDATVCLTIQKSSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLG 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 sj0341 LGIHCETLKLLLPDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 LGIHCETLKLLLPDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPF 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 sj0341 EKNCGQDGLCEGDLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 EKNCGQDGLCEGDLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGL 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 sj0341 SHRRVSGAQKQPHQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 SHRRVSGAQKQPHQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYK 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 sj0341 ATLGDRMLMRASASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 ATLGDRMLMRASASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKK 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 sj0341 MKEAEHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 MKEAEHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSD 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 sj0341 FLTQISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 FLTQISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSV 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 sj0341 AEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 AEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYK 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 sj0341 LGFFKRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|620 LGFFKRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS 1150 1160 1170 >>gi|162317970|gb|AAI56096.1| Integrin, alpha D [synthet (1161 aa) initn: 7665 init1: 7665 opt: 7665 Z-score: 9053.9 bits: 1687.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 7665; 100.000% identity (100.000% similar) in 1161 aa overlap (17-1177:1-1161) 10 20 30 40 50 60 sj0341 CALSPTFHFPSTRCSGMTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|162 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGG 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 sj0341 SRLVVGAPLEVVAANQTGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|162 SRLVVGAPLEVVAANQTGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLL 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 sj0341 ACGPTLHRVCGENSYSKGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|162 ACGPTLHRVCGENSYSKGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQN 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 sj0341 DFNQMKGFVQAVMGQFEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|162 DFNQMKGFVQAVMGQFEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGL 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 sj0341 TFTATGILTVVTQLFHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|162 TFTATGILTVVTQLFHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYA 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 sj0341 IGVGHAFQGPTARQELNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|162 IGVGHAFQGPTARQELNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASS 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 sj0341 SFQHEMSQEGFSTALTMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|162 SFQHEMSQEGFSTALTMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYL 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 sj0341 GYSTELALWKGVQNLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|162 GYSTELALWKGVQNLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSV 410 420 430 440 450 460 490 500 510 520 530 540 sj0341 DVDSDGSTDLILIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|162 DVDSDGSTDLILIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAAL 470 480 490 500 510 520 550 560 570 580 590 600 sj0341 TVLGDVNEDKLIDVAIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|162 TVLGDVNEDKLIDVAIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFG 530 540 550 560 570 580 610 620 630 640 650 660 sj0341 QALSGGQDLTQDGLMDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|162 QALSGGQDLTQDGLMDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPS 590 600 610 620 630 640 670 680 690 700 710 720 sj0341 ALEAGDATVCLTIQKSSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|162 ALEAGDATVCLTIQKSSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLG 650 660 670 680 690 700 730 740 750 760 770 780 sj0341 LGIHCETLKLLLPDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|162 LGIHCETLKLLLPDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPF 710 720 730 740 750 760 790 800 810 820 830 840 sj0341 EKNCGQDGLCEGDLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|162 EKNCGQDGLCEGDLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGL 770 780 790 800 810 820 850 860 870 880 890 900 sj0341 SHRRVSGAQKQPHQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|162 SHRRVSGAQKQPHQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYK 830 840 850 860 870 880 910 920 930 940 950 960 sj0341 ATLGDRMLMRASASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|162 ATLGDRMLMRASASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKK 890 900 910 920 930 940 970 980 990 1000 1010 1020 sj0341 MKEAEHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|162 MKEAEHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSD 950 960 970 980 990 1000 1030 1040 1050 1060 1070 1080 sj0341 FLTQISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|162 FLTQISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSV 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1090 1100 1110 1120 1130 1140 sj0341 AEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|162 AEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYK 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1150 1160 1170 sj0341 LGFFKRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|162 LGFFKRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS 1130 1140 1150 1160 >>gi|12643717|sp|Q13349.1|ITAD_HUMAN RecName: Full=Integ (1162 aa) initn: 4356 init1: 4356 opt: 7653 Z-score: 9039.7 bits: 1684.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 7653; 99.914% identity (99.914% similar) in 1162 aa overlap (17-1177:1-1162) 10 20 30 40 50 60 sj0341 CALSPTFHFPSTRCSGMTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|126 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGG 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 sj0341 SRLVVGAPLEVVAANQTGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|126 SRLVVGAPLEVVAANQTGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLL 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 sj0341 ACGPTLHRVCGENSYSKGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|126 ACGPTLHRVCGENSYSKGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQN 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 sj0341 DFNQMKGFVQAVMGQFEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|126 DFNQMKGFVQAVMGQFEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGL 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 sj0341 TFTATGILTVVTQLFHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|126 TFTATGILTVVTQLFHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYA 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 sj0341 IGVGHAFQGPTARQELNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|126 IGVGHAFQGPTARQELNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASS 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 sj0341 SFQHEMSQEGFSTALTMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|126 SFQHEMSQEGFSTALTMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYL 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 sj0341 GYSTELALWKGVQNLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|126 GYSTELALWKGVQNLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSV 410 420 430 440 450 460 490 500 510 520 530 sj0341 DVDSDGSTDLILIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRG-RVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAA ::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::: gi|126 DVDSDGSTDLILIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGQRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAA 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 sj0341 LTVLGDVNEDKLIDVAIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|126 LTVLGDVNEDKLIDVAIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYF 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 sj0341 GQALSGGQDLTQDGLMDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|126 GQALSGGQDLTQDGLMDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKP 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 sj0341 SALEAGDATVCLTIQKSSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|126 SALEAGDATVCLTIQKSSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTL 650 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 sj0341 GLGIHCETLKLLLPDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|126 GLGIHCETLKLLLPDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLP 710 720 730 740 750 760 780 790 800 810 820 830 sj0341 FEKNCGQDGLCEGDLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|126 FEKNCGQDGLCEGDLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAG 770 780 790 800 810 820 840 850 860 870 880 890 sj0341 LSHRRVSGAQKQPHQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|126 LSHRRVSGAQKQPHQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSY 830 840 850 860 870 880 900 910 920 930 940 950 sj0341 KATLGDRMLMRASASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|126 KATLGDRMLMRASASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEK 890 900 910 920 930 940 960 970 980 990 1000 1010 sj0341 KMKEAEHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|126 KMKEAEHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHS 950 960 970 980 990 1000 1020 1030 1040 1050 1060 1070 sj0341 DFLTQISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|126 DFLTQISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVS 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1080 1090 1100 1110 1120 1130 sj0341 VAEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|126 VAEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLY 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1140 1150 1160 1170 sj0341 KLGFFKRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|126 KLGFFKRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS 1130 1140 1150 1160 >>gi|194218991|ref|XP_001915421.1| PREDICTED: similar to (1160 aa) initn: 4425 init1: 4425 opt: 6190 Z-score: 7309.6 bits: 1364.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 6190; 80.345% identity (92.586% similar) in 1160 aa overlap (17-1176:1-1159) 10 20 30 40 50 60 sj0341 CALSPTFHFPSTRCSGMTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGG :.: ..:::.:::: :::::::::: .:.::..::::::.::: gi|194 MAFEVMLLLGVLASCHGFNLDVEEPKVFREDGAGFGQSVAQFGR 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 sj0341 SRLVVGAPLEVVAANQTGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLL ::.::::::::::.:::::::.:..::. :::: :: ::::::::::.:.::.: : :: gi|194 SRFVVGAPLEVVAVNQTGRLYECVVATSRCQPISLHTPPEAVNMSLGLSLVASANLSWLL 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 sj0341 ACGPTLHRVCGENSYSKGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQN .:::: ::.:::: :..::::::::. .::. :: : ::::.::.:::::::::::: . gi|194 VCGPTSHRACGENMYAEGSCLLLGSHLKIIRRVPTALPECPNQEIDIVFLIDGSGSIAPS 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 sj0341 DFNQMKGFVQAVMGQFEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGL .:.::: ::.:::::::::.:::.:::::. :: ::::..::.: : ::::::::.:: gi|194 EFKQMKDFVRAVMGQFEGTNTLFSLMQYSSGLKTHFTFSKFRSSLSPLRLVDPIVQLQGL 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 sj0341 TFTATGILTVVTQLFHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYA ::::::::.::..::: :::::.:::::::::::::::::: :: :::::::.::::::: gi|194 TFTATGILAVVNELFHSKNGARRSAKKILIVITDGQKYKDPWEYRDVIPQAERAGIIRYA 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 sj0341 IGVGHAFQGPTARQELNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASS :::: ::: : ::::::::.::: :::::::::::::.::::::::::.::::::::.:: gi|194 IGVGDAFQEPIARQELNTIGSAPSQDHVFKVDNFAALSSIQKQLQEKIFAVEGTQSRTSS 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 sj0341 SFQHEMSQEGFSTALTMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYL ::::::::::::..:: :: :::::::.::::::::::. ::::::.::.. ::::::: gi|194 SFQHEMSQEGFSSVLTTDGPVLGAVGSFGWSGGAFLYPPKTSPTFINVSQKKEDMRDSYL 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 sj0341 GYSTELALWKGVQNLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSV ::::::. :.:::.:::::::.:::::. :::: ::::: .:.::::::::::::::::: gi|194 GYSTELVTWQGVQSLVLGAPRHQHTGKVFIFTQQSRQWRPEANVTGTQIGSYFGASLCSV 410 420 430 440 450 460 490 500 510 520 530 540 sj0341 DVDSDGSTDLILIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAAL ::: :::.::.:::::::: ::.:::::::::::: ..:::.:::::::::::::::::: gi|194 DVDRDGSSDLVLIGAPHYYMQTQGGQVSVCPLPRGSAKWQCEAVLRGEQGHPWGRFGAAL 470 480 490 500 510 520 550 560 570 580 590 600 sj0341 TVLGDVNEDKLIDVAIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFG ::::::: ::: ::::::::::::.::::::::.: ::::::::::..:::: :.::: gi|194 TVLGDVNGDKLTDVAIGAPGEQENQGAVYLFHGTSGLGISPSHSQRITGSQLSSGLRYFG 530 540 550 560 570 580 610 620 630 640 650 660 sj0341 QALSGGQDLTQDGLMDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPS :.::::::::::::.::.:::.:.::::::::::.::::::: : :::::::.:::: :. gi|194 QSLSGGQDLTQDGLVDLVVGAQGHVLLLRSLPVLNVGVAMRFMPSEVAKAVYQCWEEVPT 590 600 610 620 630 640 670 680 690 700 710 720 sj0341 ALEAGDATVCLTIQKSSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLG .:::.::::::::.::: :::::..::: .::::: ::: :::::.:::: ::::::::: gi|194 TLEAADATVCLTIHKSSPDQLGDVKSSVIYDLALDAGRLISRAIFDETKNRTLTRRKTLG 650 660 670 680 690 700 730 740 750 760 770 780 sj0341 LGIHCETLKLLLPDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPF :: ::::.:::::::::::.:::::.:::::. :: :: :::::::::::::::::.::: gi|194 LGDHCETVKLLLPDCVEDVMSPIILRLNFSLMGEPNPSLQNLRPVLAVGSQDLFTAALPF 710 720 730 740 750 760 790 800 810 820 830 840 sj0341 EKNCGQDGLCEGDLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGL :::::::.::.:::.:.:::::::::.::::::::::::.:: :::::::.:..:::::: gi|194 EKNCGQDNLCQGDLSVNLSFSGLQTLVVGSSLELNVIVTLWNEGEDSYGTMVNFYYPAGL 770 780 790 800 810 820 850 860 870 880 890 900 sj0341 SHRRVSGAQKQPHQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYK :.::: :.:. ::: :::::: ::: .:::::. :..:::::.::..:::::::::::: gi|194 SYRRVLGTQR-PHQRPLRLACEGVPTGSEGLRSTSCNINHPIFQEGTKGTFIVTFDVSYK 830 840 850 860 870 880 910 920 930 940 950 960 sj0341 ATLGDRMLMRASASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKK :.:::..:.::.::::::: .:::.::::::::::::::.:::::::::::::.:: ::. gi|194 ANLGDKLLLRANASSENNKPTSSKTTFQLELPVKYAVYTVISRQEESTKYFNFSTSHEKS 890 900 910 920 930 940 970 980 990 1000 1010 1020 sj0341 MKEAEHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSD ::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.. ::::::::::::.:::::: gi|194 RKEAEHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPILLNGVAVWDVAVVAPSQSLPCVSEREPPQHSD 950 960 970 980 990 1000 1030 1040 1050 1060 1070 1080 sj0341 FLTQISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSV : ::: :: ::::::::::.::::.:::...::::: :::.:::::: .::::::::::: gi|194 FQTQIPRSLMLDCSIADCLRFRCDIPSFGIREELDFILKGDLSFGWVSQTLQKKVLVVSV 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1090 1100 1110 1120 1130 1140 sj0341 AEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYK :::::.:::: ::::::::.:::::::::: :::: ::.:.:::::.::::::::::::: gi|194 AEITFNTSVYLQLPGQEAFLRAQMEMVLEEYEVYNPIPLIVGSSVGGLLLLALITATLYK 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1150 1160 1170 sj0341 LGFFKRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS ::::::.:::::..::::::::::.: . ::: :: gi|194 LGFFKRQYKEMLDNKPEDTATFSGEDSNSDAPNPPLY 1130 1140 1150 1160 >>gi|160837835|ref|NP_001104272.1| integrin, alpha D [Ca (1168 aa) initn: 4497 init1: 4497 opt: 6179 Z-score: 7296.6 bits: 1362.1 E(): 0 Smith-Waterman score: 6179; 80.278% identity (92.268% similar) in 1151 aa overlap (27-1177:19-1168) 10 20 30 40 50 60 sj0341 CALSPTFHFPSTRCSGMTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGG ::::::::::::::: .::::..::::::.:.:: gi|160 MEDKLLLHNSTCDGPAVCVLASYHGFNLDVEEPMVFQEDGAGFGQSVAQLGG 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 sj0341 SRLVVGAPLEVVAANQTGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLL :::::::::::::.:::::::::.::::.::::::: :.::::::::.:.:... :: gi|160 SRLVVGAPLEVVAVNQTGRLYDCVAATGLCQPIPLHTPPDAVNMSLGLSLSAAASRPWLL 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 sj0341 ACGPTLHRVCGENSYSKGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQN :::::.::.:::: :..: :::: :. . : ::: : :::: :::::::::::::::.:. gi|160 ACGPTMHRACGENMYAEGFCLLLDSHLQTIWTVPAALPECPSQEMDIVFLIDGSGSIEQS 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 sj0341 DFNQMKGFVQAVMGQFEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGL ::.::: ::.:::::::::.:::.:.:::.:::::::::::..: . ::::::::: :: gi|160 DFKQMKDFVRAVMGQFEGTNTLFSLIQYSHLLKIHFTFTQFQSSWNPLSLVDPIVQLDGL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 sj0341 TFTATGILTVVTQLFHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYA :.::::: :: .::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::: gi|160 TYTATGIRKVVEELFHSKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAERAGIIRYA 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 sj0341 IGVGHAFQGPTARQELNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASS :::: :: :.:.:::..:.: : :::::.:::::::.:::.::::::.:.::::: .:: gi|160 IGVGDAFWKPSAKQELDNIGSEPAQDHVFRVDNFAALSSIQEQLQEKIFALEGTQSTTSS 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 sj0341 SFQHEMSQEGFSTALTMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYL ::::::::::::..::::: ::::::::::::::::::. ::::::::::::::::::: gi|160 SFQHEMSQEGFSSVLTMDGPVLGAVGSFSWSGGAFLYPPKTSPTFINMSQENVDMRDSYL 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 sj0341 GYSTELALWKGVQNLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSV :::::::.:::::.:.:::::.:::::.:::::.:.::: ::::.:::::::::::::.: gi|160 GYSTELAFWKGVQSLILGAPRHQHTGKVVIFTQASEQWRPKAEVSGTQIGSYFGASLCTV 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 sj0341 DVDSDGSTDLILIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAAL ::: ::.:::.::::::.:. :.:::::::::: ::..:::...:::::::::::::::: gi|160 DVDRDGNTDLVLIGAPHFYKPTQGGQVSVCPLPPGRAKWQCEVILRGEQGHPWGRFGAAL 480 490 500 510 520 530 550 560 570 580 590 600 sj0341 TVLGDVNEDKLIDVAIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFG :.::::: ::: :::::::::::::::::::::.: :::::::::::.::::: ::::: gi|160 TLLGDVNGDKLTDVAIGAPGEQENRGAVYLFHGTSGLGISPSHSQRIAGSQLSPTLQYFG 540 550 560 570 580 590 610 620 630 640 650 660 sj0341 QALSGGQDLTQDGLMDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPS :.::::::::.:::.::::::.:::::::: :::.:::.::::: ::::::..:::: :: gi|160 QSLSGGQDLTHDGLVDLAVGAQGQVLLLRSQPVLNVGVTMRFSPSEVAKAVHQCWEEVPS 600 610 620 630 640 650 670 680 690 700 710 720 sj0341 ALEAGDATVCLTIQKSSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLG :::::.::::.::::::::::::.:::::.::::::::: :::::.:::: ::::::::: gi|160 ALEAGNATVCFTIQKSSLDQLGDVQSSVRYDLALDPGRLISRAIFDETKNWTLTRRKTLG 660 670 680 690 700 710 730 740 750 760 770 780 sj0341 LGIHCETLKLLLPDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPF : .:::.:::::::::::::::::.:::::: ::::: ::::::::::::::::::::: gi|160 TGDYCETIKLLLPDCVEDVVSPIILRLNFSLVGEPIPSAQNLRPVLAVGSQDLFTASLPF 720 730 740 750 760 770 790 800 810 820 830 840 sj0341 EKNCGQDGLCEGDLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGL ::::::: .:::::.:.:: :.:::: ::::::::: ::.:: ::::: ::. .:::::: gi|160 EKNCGQDHFCEGDLSVNLSSSSLQTLMVGSSLELNVTVTLWNEGEDSYRTVIHFYYPAGL 780 790 800 810 820 830 850 860 870 880 890 900 sj0341 SHRRVSGAQKQPHQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYK :.::: :.: :::: ::::::.::: .:::::: ::.::::::::..: :::::::::: gi|160 SYRRVLGTQ-QPHQRPLRLACEAVPTGNEGLRSSSCSINHPIFHEGTKGIFIVTFDVSYK 840 850 860 870 880 890 910 920 930 940 950 960 sj0341 ATLGDRMLMRASASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKK ::::...:.::.::::::: :.::.: ::::::::::: .:::::.:::::::.:::::. gi|160 ATLGNKLLLRANASSENNKPSTSKTTSQLELPVKYAVYMVISRQEDSTKYFNFSTSDEKS 900 910 920 930 940 950 970 980 990 1000 1010 1020 sj0341 MKEAEHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSD ::::::::::::::::..:::: :::.::::::::::.. :::: :::::.::: : gi|160 KKEAEHRYRVNNLSQRDVVISINVWVPILLNGVAVWDVALLDHSQSLTCVSEREPPQDPD 960 970 980 990 1000 1010 1030 1040 1050 1060 1070 1080 sj0341 FLTQISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSV ::::: : .:.:::::::...::.:::..::::.:::::::.:::: .::::::::::: gi|160 FLTQIPGSLVLNCSIADCLKIHCDLPSFGIQEELEFTLKGNLNFGWVSQTLQKKVLVVSV 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1090 1100 1110 1120 1130 1140 sj0341 AEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYK :::::. ::::::::::::.::::: :::. :::: :::: :::::.::::::::: ::: gi|160 AEITFNRSVYSQLPGQEAFLRAQMETVLEKYEVYNPIPIIAGSSVGGLLLLALITAILYK 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1150 1160 1170 sj0341 LGFFKRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS ::::::.:::::..::::::: ::.: .: :::.::: gi|160 LGFFKRQYKEMLDNKPEDTATCSGEDVNCDAPNLPLS 1140 1150 1160 >>gi|73958316|ref|XP_848776.1| PREDICTED: similar to int (1166 aa) initn: 5996 init1: 5996 opt: 5996 Z-score: 7080.2 bits: 1322.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 5996; 78.804% identity (91.909% similar) in 1137 aa overlap (28-1164:22-1158) 10 20 30 40 50 60 sj0341 CALSPTFHFPSTRCSGMTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGG :.:::::::::::: .::::..::::::.:.:: gi|739 MLMTNPDRDAKRWNIRESEEFLTSYHGFNLDVEEPMVFQEDGAGFGQSVAQLGG 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 sj0341 SRLVVGAPLEVVAANQTGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLL :::::::::::::.:::::::::.::::.::::::: :.::::::::.:.:... :: gi|739 SRLVVGAPLEVVAVNQTGRLYDCVAATGLCQPIPLHTPPDAVNMSLGLSLSAAASRPWLL 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 sj0341 ACGPTLHRVCGENSYSKGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQN :::::.::.:::: :..: :::: :. . : ::: : :::: ::::::::::::::: .. gi|739 ACGPTMHRACGENMYAEGFCLLLDSHLQTIWTVPAALPECPSQEMDIVFLIDGSGSIYES 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 sj0341 DFNQMKGFVQAVMGQFEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGL .:.::: ::.:.::.::::.:::.:.:::.:::::::::::..: . :::::::::::: gi|739 SFKQMKDFVRALMGHFEGTNTLFSLIQYSHLLKIHFTFTQFQNSWNPLSLVDPIVQLKGL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 sj0341 TFTATGILTVVTQLFHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYA :.::::: :: .::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::: gi|739 TYTATGIRKVVEELFHSKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAERAGIIRYA 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 sj0341 IGVGHAFQGPTARQELNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASS :::: :: :.:.:::..:.: : :::::.:::::::.:::.::::::.:.::::: .:: gi|739 IGVGDAFWKPSAKQELDNIGSEPAQDHVFRVDNFAALSSIQEQLQEKIFALEGTQSTTSS 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 sj0341 SFQHEMSQEGFSTALTMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYL ::::::::::::..::::: ::::::::::::::::::. ::::::::::::::::::: gi|739 SFQHEMSQEGFSSVLTMDGPVLGAVGSFSWSGGAFLYPPKTSPTFINMSQENVDMRDSYL 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 sj0341 GYSTELALWKGVQNLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSV :::::::.:::::.:.:::::.:::::.:::::.:.::: ::::.:::::::::::::.: gi|739 GYSTELAFWKGVQSLILGAPRHQHTGKVVIFTQASEQWRPKAEVSGTQIGSYFGASLCTV 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 sj0341 DVDSDGSTDLILIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAAL ::: ::.:::.::::::::. :.::::::::::.::..:::...:::::::::::::::: gi|739 DVDRDGNTDLVLIGAPHYYKPTQGGQVSVCPLPQGRAKWQCEVILRGEQGHPWGRFGAAL 480 490 500 510 520 530 550 560 570 580 590 600 sj0341 TVLGDVNEDKLIDVAIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFG :.::::: ::: :::::::::::::::::::::.: :::::::::::.::::: ::::: gi|739 TLLGDVNGDKLTDVAIGAPGEQENRGAVYLFHGTSGLGISPSHSQRIAGSQLSPTLQYFG 540 550 560 570 580 590 610 620 630 640 650 660 sj0341 QALSGGQDLTQDGLMDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPS :.::::::::.:::.::::::.:::::::: :::.: :.::::: ::::::..:::: :: gi|739 QSLSGGQDLTHDGLVDLAVGAQGQVLLLRSQPVLNVRVTMRFSPSEVAKAVHQCWEEVPS 600 610 620 630 640 650 670 680 690 700 710 720 sj0341 ALEAGDATVCLTIQKSSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLG :::::.::::.::::::::::::.:::::.::::::::: :::::.:::: ::::::::: gi|739 ALEAGNATVCFTIQKSSLDQLGDVQSSVRYDLALDPGRLISRAIFDETKNWTLTRRKTLG 660 670 680 690 700 710 730 740 750 760 770 780 sj0341 LGIHCETLKLLLPDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPF .: .:::.:::::::::::::::::.:::::: ::::: ::::::::::::: ::::::: gi|739 MGDYCETVKLLLPDCVEDVVSPIILRLNFSLVGEPIPSAQNLRPVLAVGSQDPFTASLPF 720 730 740 750 760 770 790 800 810 820 830 840 sj0341 EKNCGQDGLCEGDLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGL ::::::: .:.:::.:.:: ..::::.::::::::: ::.:: ::::: ::. .:::::: gi|739 EKNCGQDHFCKGDLSVNLSSQSLQTLVVGSSLELNVTVTLWNEGEDSYRTVIHFYYPAGL 780 790 800 810 820 830 850 860 870 880 890 900 sj0341 SHRRVSGAQKQPHQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYK :.::.: ..:::: ::::::.::: .:::::: ::.::::::::..: :::::::::: gi|739 SYRRLSTFSSQPHQRPLRLACEAVPTGNEGLRSSSCSINHPIFHEGTKGIFIVTFDVSYK 840 850 860 870 880 890 910 920 930 940 950 960 sj0341 ATLGDRMLMRASASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKK ::::...:.::.:::.::: :.::.: ::::::::::: .:::::.:::::::.:::::. gi|739 ATLGNKLLLRANASSQNNKPSTSKTTSQLELPVKYAVYMVISRQEDSTKYFNFSTSDEKS 900 910 920 930 940 950 970 980 990 1000 1010 1020 sj0341 MKEAEHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSD ::::::::::::::::..:::: :::.::::::::::.. :::: :::::.::: : gi|739 KKEAEHRYRVNNLSQRDVVISINVWVPILLNGVAVWDVALLDHSQSLTCVSEREPPQDPD 960 970 980 990 1000 1010 1030 1040 1050 1060 1070 1080 sj0341 FLTQISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSV ::::: : .:.:::::::...::.:::..::::.:::::::.:::: .::::::::::: gi|739 FLTQIPGSLVLNCSIADCLKIHCDLPSFGIQEELEFTLKGNLNFGWVSQTLQKKVLVVSV 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1090 1100 1110 1120 1130 1140 sj0341 AEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYK :::::. ::::::::::::.::::: :::. :::: :::: :::::.::::::::: ::: gi|739 AEITFNRSVYSQLPGQEAFLRAQMETVLEKYEVYNPIPIIAGSSVGGLLLLALITAILYK 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1150 1160 1170 sj0341 LGFFKRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS .:::::.::::. . . : .: gi|739 VGFFKRQYKEMMAEANGQIAPENGTSDPQVAQ 1140 1150 1160 >>gi|151556938|gb|AAI49717.1| ITGAD protein [Bos taurus] (1165 aa) initn: 4300 init1: 4271 opt: 5826 Z-score: 6879.2 bits: 1284.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 5826; 74.914% identity (91.409% similar) in 1164 aa overlap (14-1177:3-1164) 10 20 30 40 50 60 sj0341 CALSPTFHFPSTRCSGMTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGG : ::.:..::.:. :::::::::::::: .:.::..::::::::: gi|151 MSCLGMAFAVVLFLTGLASYHGFNLDVEEPLVFREDGAGFGQSVVQFDR 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 sj0341 SRLVVGAPLEVVAANQTGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLL ::::::::::::..:.:::::::. :: :.:: :. :::.:::::.:::::. :.:: gi|151 SRLVVGAPLEVVTVNKTGRLYDCTPATRRCRPISLNTPSEAVDMSLGLSLAASTHLSQLL 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 sj0341 ACGPTLHRVCGENSYSKGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQN :::::.:..:::: : ::.::::.:. .::.::: : ::: .::.::.:::::::::::. gi|151 ACGPTVHKACGENMYLKGTCLLLSSHLQIIRTVPAALPECTNQEIDIAFLIDGSGSIDQT 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 sj0341 DFNQMKGFVQAVMGQFEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGL ::..::.::.::: . .::.: :.:::::::.: ::::.:: :: :.::::::::::.:: gi|151 DFKRMKNFVRAVMDRSKGTNTQFSLMQYSNLMKTHFTFNQFWTSRSSQSLVDPIVQLNGL 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 sj0341 TFTATGILTVVTQLFHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYA ::::::: ::: .::: ::::::::.::.::::::.::::::::.::::.::::.::::: gi|151 TFTATGIRTVVRELFHSKNGARKSARKIIIVITDGEKYKDPLEYKDVIPEAEKANIIRYA 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 sj0341 IGVGHAFQGPTARQELNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASS :::: :::. .::.::. :.:.: .:::::::.::::.::::::::::.::::::: .:: gi|151 IGVGDAFQAHAAREELKIIGSVPSEDHVFKVDSFAALSSIQKQLQEKIFAVEGTQSGTSS 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 sj0341 SFQHEMSQEGFSTALTMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYL ::::::::::::. ::::: ::::::::::::::::: : .:::::::::.:::::::: gi|151 SFQHEMSQEGFSSILTMDGPVLGAVGSFSWSGGAFLYPQNKKPTFINMSQEHVDMRDSYL 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 sj0341 GYSTELALWKGVQNLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSV :::::::::.:.:.:.:::::.:::::.:.::::::::: .::::::::::::::::::: gi|151 GYSTELALWRGAQSLILGAPRHQHTGKVVLFTQVSRQWRPQAEVTGTQIGSYFGASLCSV 410 420 430 440 450 460 490 500 510 520 530 540 sj0341 DVDSDGSTDLILIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAAL ::..:.:.::.::::::.::::.::::::::.::: ..:::::::::: ::::.:::::: gi|151 DVNGDSSSDLVLIGAPHFYEQTQGGQVSVCPFPRGGTKWQCDAVLRGEPGHPWSRFGAAL 470 480 490 500 510 520 550 560 570 580 590 600 sj0341 TVLGDVNEDKLIDVAIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFG ::::::: :.: ::::::::::::.::::::::.:: ::.: ::::::.:::: ::::: gi|151 TVLGDVNGDRLADVAIGAPGEQENQGAVYLFHGTSELGIGPMHSQRIAGSQLSLGLQYFG 530 540 550 560 570 580 610 620 630 640 650 660 sj0341 QALSGGQDLTQDGLMDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPS ..::::::::::::.::::::.:..:::::::::::.:.:.:.: ::.::::.::.: . gi|151 RSLSGGQDLTQDGLVDLAVGAQGHALLLRSLPVLKVNVTMKFTPPEVTKAVYQCWDELTT 590 600 610 620 630 640 670 680 690 700 710 720 sj0341 ALEAGDATVCLTIQKSSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLG ..:::.:::::::.::: :.::::.::: .::::::::: :::.:.::.: :::::::: gi|151 TMEAGQATVCLTIHKSSQDRLGDIRSSVTYDLALDPGRLISRAVFGETRNWTLTRRKTLE 650 660 670 680 690 700 730 740 750 760 770 780 sj0341 LGIHCETLKLLLPDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPF :: ::...:::.::::::.:.::::.:::::: ::: : ::::::::::::::::::::: gi|151 LGEHCDSMKLLIPDCVEDMVNPIILRLNFSLVGEPIASSQNLRPVLAVGSQDLFTASLPF 710 720 730 740 750 760 790 800 810 820 830 840 sj0341 EKNCGQDGLCEGDLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGL ::::::: ::::::.:.::: ::.::.::::::::: : : : ::::::::.:.:::::: gi|151 EKNCGQDHLCEGDLSVNLSFLGLETLVVGSSLELNVAVMVSNEGEDSYGTVISFYYPAGL 770 780 790 800 810 820 850 860 870 880 890 900 sj0341 SHRRVSGAQKQPHQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYK :.::. . : :: : ::::::.::: .:::.:: ::.:::::.:: .::::.::::::: gi|151 SYRRTLAIQ-QPGQRPLRLACEAVPTGNEGLKSSGCSINHPIFREGIKGTFIITFDVSYK 830 840 850 860 870 880 910 920 930 940 950 960 sj0341 ATLGDRMLMRASASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKK :::::.. . :. :::::: .:.:.: ::::::::::::.:::::::::::::..::.:. gi|151 ATLGDKFHLSANISSENNKPTSNKTTSQLELPVKYAVYTVISRQEESTKYFNFSASDQKS 890 900 910 920 930 940 970 980 990 1000 1010 1020 sj0341 MKEAEHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSD .::::::::::::::.::::..::::.:::::.::::.. ::::::::::::. ::. : gi|151 RREAEHRYRVNNLSQRELAISVHFWVPILLNGVVVWDVALVAPSQSLPCVSERESPQQPD 950 960 970 980 990 1000 1030 1040 1050 1060 1070 1080 sj0341 FLTQISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSV : ::. : .:::::::::.::::.:::.::::::: :::::::::. . ::::.::::. gi|151 FQTQMPSSLVLDCSIADCLRFRCDIPSFGVQEELDFILKGNLSFGWASQLLQKKTLVVSM 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1090 1100 1110 1120 1130 1140 sj0341 AEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYK ::.::. :::.:. :::::.:::.:::::: :::. .:....::.:.::::::::: ::: gi|151 AEVTFNRSVYTQISGQEAFLRAQVEMVLEEYEVYSPMPLLVSSSMGGLLLLALITALLYK 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1150 1160 1170 sj0341 LGFFKRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS :::::.::::...:::.:: ..:.:. .:..::: gi|151 CGFFKRQYKEMMDNKPENTA-LNGEDIHHETPDLPLSE 1130 1140 1150 1160 >>gi|149067641|gb|EDM17193.1| rCG39970 [Rattus norvegicu (1163 aa) initn: 5552 init1: 4675 opt: 5696 Z-score: 6725.4 bits: 1256.4 E(): 0 Smith-Waterman score: 5696; 73.707% identity (89.828% similar) in 1160 aa overlap (17-1172:1-1158) 10 20 30 40 50 sj0341 CALSPTFHFPSTRCSGMTFGTVLLLS--VLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQF :. :.:.:: :::: :: ::::::: .:.:::..:::.:::: gi|149 MAGGVVILLCGWVLASCHGSNLDVEEPIVFREDAASFGQTVVQF 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 sj0341 GGSRLVVGAPLEVVAANQTGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSR ::::::::::::.::.:::::::::: :::::::: :. :::::::::.:...::... gi|149 GGSRLVVGAPLEAVAVNQTGRLYDCAPATGMCQPIVLRSPLEAVNMSLGLSLVTATNNAQ 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 sj0341 LLACGPTLHRVCGENSYSKGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSID ::::::: .:.: .: :.::::::::: ..::.:: . ::::.:::::.:::::::::. gi|149 LLACGPTAQRACVKNMYAKGSCLLLGSSLQFIQAVPASMPECPRQEMDIAFLIDGSGSIN 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 sj0341 QNDFNQMKGFVQAVMGQFEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLK : :: ::: ::.:.::.: .:.:::.::::::.:: :::::.:.. . ::::::::::. gi|149 QRDFAQMKDFVKALMGEFASTSTLFSLMQYSNILKTHFTFTEFKNILDPQSLVDPIVQLQ 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 sj0341 GLTFTATGILTVVTQLFHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIR :::.::::: ::: .::: :::.::::::::.::::::::.:::::::::: :.:::::: gi|149 GLTYTATGIRTVVEELFHSKNGSRKSAKKILLVITDGQKYRDPLEYSDVIPAADKAGIIR 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 sj0341 YAIGVGHAFQGPTARQELNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRA :::::: ::: ::: .:::::.::::::::::: ::::: :::.::::::.:.::::::. gi|149 YAIGVGDAFQEPTALKELNTIGSAPPQDHVFKVGNFAALRSIQRQLQEKIFAIEGTQSRS 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 sj0341 SSSFQHEMSQEGFSTALTMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDS ::::::::::::::.::: :: ::::::::::::::::::: :::::::::::::::: gi|149 SSSFQHEMSQEGFSSALTSDGPVLGAVGSFSWSGGAFLYPPNTRPTFINMSQENVDMRDS 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 sj0341 YLGYSTELALWKGVQNLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLC :::::: .:.::::..:.:::::.:::::.::::: .:.:: :.:: ::::::::::::: gi|149 YLGYSTAVAFWKGVHSLILGAPRHQHTGKVVIFTQEARHWRPKSEVRGTQIGSYFGASLC 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 sj0341 SVDVDSDGSTDLILIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGA ::::: ::::::.::::::::::::::::::::.: : .:::.:.:.:::::::::::. gi|149 SVDVDRDGSTDLVLIGAPHYYEQTRGGQVSVCPVPGVRGRWQCEATLHGEQGHPWGRFGV 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 sj0341 ALTVLGDVNEDKLIDVAIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQY ::::::::: :.: :::::::::.:.:::::.:::::. : :: :::...:::: :::: gi|149 ALTVLGDVNGDNLADVAIGAPGEEESRGAVYIFHGASRLEIMPSPSQRVTGSQLSLRLQY 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 sj0341 FGQALSGGQDLTQDGLMDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEK :::.::::::::::::.::::::.:.::::::::.::: ...::.:.:::::::.:::. gi|149 FGQSLSGGQDLTQDGLVDLAVGAQGHVLLLRSLPLLKVELSIRFAPMEVAKAVYQCWERT 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 sj0341 PSALEAGDATVCLTIQKSSLDQLGD--IQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRR :..::::.::::::..:.: : ::. .:.:::.::::::::: :::::.:::: ::: : gi|149 PTVLEAGEATVCLTVHKGSPDLLGECNVQGSVRYDLALDPGRLISRAIFDETKNCTLTGR 650 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 sj0341 KTLGLGIHCETLKLLLPDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTA :::::: ::::.::::::::::.::::::.:::::::. ::.::.::::::::: .:: gi|149 KTLGLGDHCETVKLLLPDCVEDAVSPIILRLNFSLVRDSA-SPRNLHPVLAVGSQDHITA 710 720 730 740 750 760 780 790 800 810 820 830 sj0341 SLPFEKNCGQDGLCEGDLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYY :::::::: :. :::::::....:::::.:.::.: ::.: ::::: :::::::.:..:: gi|149 SLPFEKNCKQELLCEGDLGISFNFSGLQVLVVGGSPELTVTVTVWNEGEDSYGTLVKFYY 770 780 790 800 810 820 840 850 860 870 880 890 sj0341 PAGLSHRRVSGAQKQPHQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFD :::::.:::.:.: :::: ::::::. :. .: :::: ::.:::::.::.. ::..::: gi|149 PAGLSYRRVTGTQ-QPHQYPLRLACEAEPAAQEDLRSSSCSINHPIFREGAKTTFMITFD 830 840 850 860 870 880 900 910 920 930 940 950 sj0341 VSYKATLGDRMLMRASASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATS ::::: ::::.:.::.::::::: ...:..:::::::::.:::.:::::.::.. ::..: gi|149 VSYKAFLGDRLLLRAKASSENNKPDTNKTAFQLELPVKYTVYTLISRQEDSTNHVNFSSS 890 900 910 920 930 940 960 970 980 990 1000 1010 sj0341 DEKKMKEAEHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPP . .:: ::::::::: ::. .::::::::::::::::.. .:.:.. :::. ::: gi|149 HGGRRQEAAHRYRVNNLSPLKLAVRVNFWVPVLLNGVAVWDVTLSSPAQGVSCVSQMKPP 950 960 970 980 990 1000 1020 1030 1040 1050 1060 1070 sj0341 QHSDFLTQISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVL :. ::::::.: .:::::::::.::::.::...:.:::: :.:::::::: .:::.::: gi|149 QNPDFLTQIQRRSVLDCSIADCLHFRCDIPSLGIQDELDFILRGNLSFGWVSQTLQEKVL 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1080 1090 1100 1110 1120 1130 sj0341 VVSVAEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITA .:: :::::::::::::::::::.:::.: .::: ::. : .. :::::.::::::::. gi|149 LVSEAEITFDTSVYSQLPGQEAFLRAQVETTLEEYVVYEPIFLVAGSSVGGLLLLALITV 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1140 1150 1160 1170 sj0341 TLYKLGFFKRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS .:::::::::.:::::. : : .: . ::.: .: gi|149 VLYKLGFFKRQYKEMLDGKAADPVTAGQADFGCETPPYLVS 1130 1140 1150 1160 >>gi|48428189|sp|Q9QYE7.1|ITAD_RAT RecName: Full=Integri (1161 aa) initn: 5678 init1: 3766 opt: 5691 Z-score: 6719.5 bits: 1255.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 5691; 73.661% identity (89.896% similar) in 1158 aa overlap (17-1172:1-1156) 10 20 30 40 50 sj0341 CALSPTFHFPSTRCSGMTFGTVLLLS--VLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQF :. :.:.:: :::: :: ::::::: .:.:::..:::.:::: gi|484 MAGGVVILLCGWVLASCHGSNLDVEEPIVFREDAASFGQTVVQF 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 sj0341 GGSRLVVGAPLEVVAANQTGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSR ::::::::::::.::.:::::::::: :::::::: :. :::::::::.:...::... gi|484 GGSRLVVGAPLEAVAVNQTGRLYDCAPATGMCQPIVLRSPLEAVNMSLGLSLVTATNNAQ 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 sj0341 LLACGPTLHRVCGENSYSKGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSID ::::::: .:.: .: :.::::::::: ..::.:: . ::::.:::::.:::::::::. gi|484 LLACGPTAQRACVKNMYAKGSCLLLGSSLQFIQAVPASMPECPRQEMDIAFLIDGSGSIN 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 sj0341 QNDFNQMKGFVQAVMGQFEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLK : :: ::: ::.:.::.: .:.:::.::::::.:: :::::.:.. . ::::::::::. gi|484 QRDFAQMKDFVKALMGEFASTSTLFSLMQYSNILKTHFTFTEFKNILDPQSLVDPIVQLQ 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 sj0341 GLTFTATGILTVVTQLFHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIR :::.::::: ::. .::: :::.::::::::.::::::::.:::::::::: :.:::::: gi|484 GLTYTATGIRTVMEELFHSKNGSRKSAKKILLVITDGQKYRDPLEYSDVIPAADKAGIIR 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 sj0341 YAIGVGHAFQGPTARQELNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRA :::::: ::: ::: .:::::.::::::::::: ::::: :::.::::::.:.::::::. gi|484 YAIGVGDAFQEPTALKELNTIGSAPPQDHVFKVGNFAALRSIQRQLQEKIFAIEGTQSRS 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 sj0341 SSSFQHEMSQEGFSTALTMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDS ::::::::::::::.::: :: ::::::::::::::::::: :::::::::::::::: gi|484 SSSFQHEMSQEGFSSALTSDGPVLGAVGSFSWSGGAFLYPPNTRPTFINMSQENVDMRDS 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 sj0341 YLGYSTELALWKGVQNLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLC :::::: .:.::::..:.:::::.:::::.::::: .:.:: :.:: ::::::::::::: gi|484 YLGYSTAVAFWKGVHSLILGAPRHQHTGKVVIFTQEARHWRPKSEVRGTQIGSYFGASLC 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 sj0341 SVDVDSDGSTDLILIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGA ::::: ::::::.:::::::::::::::::: :.: : .:::.:.:.:::::::::::. gi|484 SVDVDRDGSTDLVLIGAPHYYEQTRGGQVSVFPVPGVRGRWQCEATLHGEQGHPWGRFGV 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 sj0341 ALTVLGDVNEDKLIDVAIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQY ::::::::: :.: :::::::::.:.:::::.:::::. : :: :::...:::: :::: gi|484 ALTVLGDVNGDNLADVAIGAPGEEESRGAVYIFHGASRLEIMPSPSQRVTGSQLSLRLQY 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 sj0341 FGQALSGGQDLTQDGLMDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEK :::.::::::::::::.::::::.:.::::::::.::: ...::.:.:::::::.:::. gi|484 FGQSLSGGQDLTQDGLVDLAVGAQGHVLLLRSLPLLKVELSIRFAPMEVAKAVYQCWERT 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 sj0341 PSALEAGDATVCLTIQKSSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKT :..::::.::::::..:.: : ::..:.:::.::::::::: :::::.:::: ::: ::: gi|484 PTVLEAGEATVCLTVHKGSPDLLGNVQGSVRYDLALDPGRLISRAIFDETKNCTLTGRKT 650 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 sj0341 LGLGIHCETLKLLLPDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASL :::: ::::.::::::::::.::::::.:::::::. ::.::.::::::::: .:::: gi|484 LGLGDHCETVKLLLPDCVEDAVSPIILRLNFSLVRDSA-SPRNLHPVLAVGSQDHITASL 710 720 730 740 750 760 780 790 800 810 820 830 sj0341 PFEKNCGQDGLCEGDLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPA :::::: :. :::::::....:::::.:.::.: ::.: ::::: :::::::.:..:::: gi|484 PFEKNCKQELLCEGDLGISFNFSGLQVLVVGGSPELTVTVTVWNEGEDSYGTLVKFYYPA 770 780 790 800 810 820 840 850 860 870 880 890 sj0341 GLSHRRVSGAQKQPHQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVS :::.:::.:.: :::: ::::::. :. .: :::: ::.:::::.::.. ::..::::: gi|484 GLSYRRVTGTQ-QPHQYPLRLACEAEPAAQEDLRSSSCSINHPIFREGAKTTFMITFDVS 830 840 850 860 870 880 900 910 920 930 940 950 sj0341 YKATLGDRMLMRASASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDE ::: ::::.:.::.::::::: ...:..:::::::::.:::.:::::.::.. ::..: gi|484 YKAFLGDRLLLRAKASSENNKPDTNKTAFQLELPVKYTVYTLISRQEDSTNHVNFSSSHG 890 900 910 920 930 940 960 970 980 990 1000 1010 sj0341 KKMKEAEHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQH . .:: ::::::::: ::. .::::::::::::::::.. .:.:.. :::. ::::. gi|484 GRRQEAAHRYRVNNLSPLKLAVRVNFWVPVLLNGVAVWDVTLSSPAQGVSCVSQMKPPQN 950 960 970 980 990 1000 1020 1030 1040 1050 1060 1070 sj0341 SDFLTQISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVV ::::::.: .:::::::::.::::.::...:.:::: :.:::::::: .:::.:::.: gi|484 PDFLTQIQRRSVLDCSIADCLHFRCDIPSLDIQDELDFILRGNLSFGWVSQTLQEKVLLV 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1080 1090 1100 1110 1120 1130 sj0341 SVAEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATL : :::::::::::::::::::.:::.: .::: ::. : .. :::::.::::::::..: gi|484 SEAEITFDTSVYSQLPGQEAFLRAQVETTLEEYVVYEPIFLVAGSSVGGLLLLALITVVL 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1140 1150 1160 1170 sj0341 YKLGFFKRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS ::::::::.:::::. : : .: . ::.: .: gi|484 YKLGFFKRQYKEMLDGKAADPVTAGQADFGCETPPYLVS 1130 1140 1150 1160 >>gi|148685686|gb|EDL17633.1| mCG133512, isoform CRA_b [ (1168 aa) initn: 5483 init1: 4596 opt: 5592 Z-score: 6602.4 bits: 1233.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 5592; 73.060% identity (90.148% similar) in 1147 aa overlap (14-1156:3-1146) 10 20 30 40 50 sj0341 CALSPTFHFPSTRCSGMTFGTVLLLS--VLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQF ::.:. :.:.:: .::: :: :::::.:..:.:::..:::.:::: gi|148 MHCSAMARGVVILLCGWALASCHGSNLDVEKPVVFKEDAASFGQTVVQF 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 sj0341 GGSRLVVGAPLEVVAANQTGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSR ::::::::::::.::.::::.::::: :::.:::: ::: :::::::::.:.:.::.:. gi|148 GGSRLVVGAPLEAVAVNQTGQLYDCAPATGVCQPILLHIPLEAVNMSLGLSLVADTNNSQ 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 sj0341 LLACGPTLHRVCGENSYSKGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSID ::::::: .:.:..: :.::::::::: ..::..: . :::: :::::.:::::::::: gi|148 LLACGPTAQRACAKNMYAKGSCLLLGSSLQFIQAIPATMPECPGQEMDIAFLIDGSGSID 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 sj0341 QNDFNQMKGFVQAVMGQFEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLK :.::.::: ::.:.:::. .:.: :.::::::.:: :::::.:..: : ::::: ::::. gi|148 QSDFTQMKDFVKALMGQLASTSTSFSLMQYSNILKTHFTFTEFKSSLSPQSLVDAIVQLQ 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 sj0341 GLTFTATGILTVVTQLFHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIR :::.::.:: :: .::: ::::::::::::::::::::..::::: :::.:::::::: gi|148 GLTYTASGIQKVVKELFHSKNGARKSAKKILIVITDGQKFRDPLEYRHVIPEAEKAGIIR 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 sj0341 YAIGVGHAFQGPTARQELNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRA :::::: ::. ::: ::::::.::: ::::::: ::.:: :::.:.::::.:.:::.::. gi|148 YAIGVGDAFREPTALQELNTIGSAPSQDHVFKVGNFVALRSIQRQIQEKIFAIEGTESRS 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 sj0341 SSSFQHEMSQEGFSTALTMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDS ::::::::::::::.::.::: ::::::::::::::::: :: ::::::::: ::::. gi|148 SSSFQHEMSQEGFSSALSMDGPVLGAVGSFSWSGGAFLYPSNMRSTFINMSQENEDMRDA 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 sj0341 YLGYSTELALWKGVQNLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLC :::::: ::.::::..:.:::::.:::::.::::: ::.:: :.:: ::::::::::::: gi|148 YLGYSTALAFWKGVHSLILGAPRHQHTGKVVIFTQESRHWRPKSEVRGTQIGSYFGASLC 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 sj0341 SVDVDSDGSTDLILIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGA :::.: ::::::.:::.:::::.::::::::::.: : .:.: ..:.:::::::::::: gi|148 SVDMDRDGSTDLVLIGVPHYYEHTRGGQVSVCPMPGVRSRWHCGTTLHGEQGHPWGRFGA 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 sj0341 ALTVLGDVNEDKLIDVAIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQY ::::::::: :.: :::::::::.:::::::.:::::.. :.:: :::...::: :::: gi|148 ALTVLGDVNGDSLADVAIGAPGEEENRGAVYIFHGASRQDIAPSPSQRVTGSQLFLRLQY 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 sj0341 FGQALSGGQDLTQDGLMDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEK :::.::::::::::::.::::::.:.::::::::.::::...::.: ::::.::.:: . gi|148 FGQSLSGGQDLTQDGLVDLAVGAQGHVLLLRSLPLLKVGISIRFAPSEVAKTVYQCWGRT 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 sj0341 PSALEAGDATVCLTIQKSSLDQLG--DIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRR :..::::.::::::..:.: : :: :.:::::.::::::::: :::::.:::: ::::: gi|148 PTVLEAGEATVCLTVRKGSPDLLGECDVQSSVRYDLALDPGRLISRAIFDETKNCTLTRR 650 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 sj0341 KTLGLGIHCETLKLLLPDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTA :::::: ::::.::::::::::.:.::::.::.::. . :: .:::::::::::: :: gi|148 KTLGLGDHCETMKLLLPDCVEDAVTPIILRLNLSLAGDSAPS-RNLRPVLAVGSQDHVTA 710 720 730 740 750 760 780 790 800 810 820 830 sj0341 SLPFEKNCGQDGLCEGDLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYY :.:::::: :. ::::.:::...:::::.: :::: ::.: ::::: :::::::....:: gi|148 SFPFEKNCKQELLCEGNLGVSFNFSGLQVLEVGSSPELTVTVTVWNEGEDSYGTLIKFYY 770 780 790 800 810 820 840 850 860 870 880 890 sj0341 PAGLSHRRVSGAQKQPHQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFD :: ::.:::. :: ::: ::::::. :: .:.:::: ::.:::::.::...::..::: gi|148 PAELSYRRVTRAQ-QPHPYPLRLACEAEPTGQESLRSSSCSINHPIFREGAKATFMITFD 830 840 850 860 870 880 900 910 920 930 940 950 sj0341 VSYKATLGDRMLMRASASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATS ::::: ::::.:.:::::::::: .::..:::::::::.:::.:::::.:::.:::..: gi|148 VSYKAFLGDRLLLRASASSENNKPETSKTAFQLELPVKYTVYTVISRQEDSTKHFNFSSS 890 900 910 920 930 940 960 970 980 990 1000 1010 sj0341 DEKKMKEAEHRYRVNNLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPP ...::::::::::::: ::::.:::::.::::::::::....:.:.. :::.:.:: gi|148 HGERQKEAEHRYRVNNLSPLTLAISVNFWVPILLNGVAVWDVTLRSPAQGVSCVSQREPP 950 960 970 980 990 1000 1020 1030 1040 1050 1060 1070 sj0341 QHSDFLTQISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVL ::::.::::. .:::.:::::..:::.::... .:::: :::::::::. .::::::: gi|148 QHSDLLTQIQGRSVLDCAIADCLHLRCDIPSLGTLDELDFILKGNLSFGWISQTLQKKVL 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1080 1090 1100 1110 1120 1130 sj0341 VVSVAEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITA ..: :::::.:::::::::::::.:::. .::: ::. . ... ::::.::::::::. gi|148 LLSEAEITFNTSVYSQLPGQEAFLRAQVSTMLEEYVVYEPVFLMVFSSVGGLLLLALITV 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1140 1150 1160 1170 sj0341 TLYKLGFFKRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS .:::::::::.::::: : : gi|148 ALYKLGFFKRQYKEML-DLPSADPDPAGQADSNHETPPHLTS 1130 1140 1150 1160 1177 residues in 1 query sequences 3071326396 residues in 8985982 library sequences Tcomplib [34.26] (8 proc) start: Thu Jun 18 18:22:44 2009 done: Thu Jun 18 18:25:40 2009 Total Scan time: 1506.630 Total Display time: 0.860 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]