# /hgtech/tools/solaris8/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -Osj08895y2.fasta.nr -Q sj08895y2.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 sj08895y2, 3841 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2362217958 residues in 6843189 sequences statistics sampled from 60000 to 6839050 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4173+/-0.000195; mu= 13.0768+/- 0.011 mean_var=109.3206+/-21.062, 0's: 26 Z-trim: 53 B-trim: 9 in 1/66 Lambda= 0.122666 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 48, opt: 36, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(6843189) gi|166788554|dbj|BAG06725.1| DNHD1 variant protein (3841) 25763 4572.2 0 gi|194673688|ref|XP_874544.3| PREDICTED: similar t (3708) 12178 2168.1 0 gi|109462612|ref|XP_001075408.1| PREDICTED: simila (3325) 10537 1877.6 0 gi|148684857|gb|EDL16804.1| mCG141377 [Mus musculu (3459) 9686 1727.1 0 gi|149068462|gb|EDM18014.1| rCG39998 [Rattus norve (3462) 9617 1714.8 0 gi|114635901|ref|XP_001165091.1| PREDICTED: dynein (1334) 8917 1590.7 0 gi|149257642|ref|XP_913886.3| PREDICTED: dynein he (3180) 8752 1561.7 0 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